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Protein structure based drug design for regulation of flowering

Publicly Offered Research

Project AreaDetermining the principles of the birth of new plant species: molecular elucidation of the lock-and-key systems in sexual reproduction
Project/Area Number 19H04856
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionYokohama National University

Principal Investigator

児嶋 長次郎  横浜国立大学, 大学院工学研究院, 教授 (50333563)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥13,260,000 (Direct Cost: ¥10,200,000、Indirect Cost: ¥3,060,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,630,000 (Direct Cost: ¥5,100,000、Indirect Cost: ¥1,530,000)
Fiscal Year 2019: ¥6,630,000 (Direct Cost: ¥5,100,000、Indirect Cost: ¥1,530,000)
KeywordsNMR / 蛋白質 / 立体構造
Outline of Research at the Start

我々の研究グループでは、植物が花を咲かせる(花成)メカニズムの研究を行っている。2011年には、普遍的な花芽形成の運命決定因子であるフロリゲンの細胞内受容体を同定し、開花促進活性の本体となるフロリゲン・受容体・転写因子複合体の立体構造解析に成功している。本研究では今まで得られた花成メカニズムの研究成果に基づき、花成を制御する低分子化合物(花咲かじいさんの灰のような物質)を創出することを目指している。

Outline of Annual Research Achievements

我々の研究グループでは、普遍的な花芽形成の運命決定因子であるフロリゲンの細胞内受容体を同定し、開花促進活性の本体となるフロリゲン・受容体・転写因子複合体の結晶構造解析に成功している。本研究では花成ホルモン受容体の立体構造情報に基づき、花成を制御する低分子化合物を創出することを目指した。具体的には、「花成ホルモン」を作用点とする化合物を立体構造情報に基づき探索し、花成ホルモン・化合物複合体の立体構造を決定して化合物の最適化を行うことで、前回の公募研究で達成できていない植物個体で開花を「促進」する化合物の創製を目指した。また、生細胞内の蛋白質の構造動態を解析する超高感度生細胞内 NMR 法を開発し、ライブセルイメージング・化合物・構造生物学と連動した花成制御機構のリアルタイム解析技術の開発も進めた。
令和2年度は咋年度に引き続き研究項目(1)「花成ホルモン複合体の立体構造に基づく低分子化合物のデザインと花成制御」と(2)「超高感度生細胞内NMR法の開発と開花制御機構解明への応用」を推進した。研究項目(1)では、昨年度同定した「花成ホルモン」に結合する化合物の植物個体での効果の検証と花成ホルモン薬剤複合体の立体構造解析を行った。研究項目(2)では、昨年度に確立した超高感度生細胞内NMR法をさらに発展させ、細胞内での蛋白質の立体構造解析を進めた。
特筆すべき成果としては、スクリーニングによって得られた「花成ホルモン」をターゲットとした花成制御化合物によって植物個体の花成を制御できることが分かった。また、超高感度生細胞内NMR法をさらに発展させ、細胞内での蛋白質の立体構造決定に成功した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] Rutgers University(米国)

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      2019 Annual Research Report
  • [Journal Article] Sensitivity enhancement by sequential data acquisition for 13C-direct detection NMR2021

    • Author(s)
      Furuita Kyoko、Sugiki Toshihiko、Takamuku Mika、Hattori Yoshikazu、So Masatomo、Kawata Yasushi、Ikegami Takahisa、Fujiwara Toshimichi、Kojima Chojiro
    • Journal Title

      Journal of Magnetic Resonance

      Volume: 322 Pages: 106878-106878

    • DOI

      10.1016/j.jmr.2020.106878

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal contact-free conformation of an intrinsically flexible loop in protein crystal: Tim21 as the case study2020

    • Author(s)
      Bala Siqin、Shinya Shoko、Srivastava Arpita、Ishikawa Marie、Shimada Atsushi、Kobayashi Naohiro、Kojima Chojiro、Tama Florence、Miyashita Osamu、Kohda Daisuke
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      Volume: 1864 Issue: 2 Pages: 129418-129418

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2019.129418

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] In-cell NMR as a sensitive tool to monitor physiological condition of Escherichia coli2020

    • Author(s)
      Sugiki Toshihiko、Yamaguchi Yoshihiro、Fujiwara Toshimichi、Inouye Masayori、Ito Yutaka、Kojima Chojiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 2466-2466

    • DOI

      10.1038/s41598-020-59076-2

    • NAID

      120006952208

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      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural instability of lamin A tail domain modulates its assembly and higher order function in Emery-Dreifuss muscular dystrophy2019

    • Author(s)
      Muneyo Mio, Toshihiko Sugiki, Chie Matsuda, Hiroaki Mitsuhashi, Chojiro Kojima, Siu Yuen Chan, Yukiko K. Hayashi, Kazuhiro Mio
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 512 Issue: 1 Pages: 22-28

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.02.138

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural characterization of the N-terminal kinase-interacting domain of an Hsp90-cochaperone Cdc37 by CD and solution NMR spectroscopy.2019

    • Author(s)
      Ihama, F., Yamamoto, M., Kojima, C., Fujiwara, T., Matsuzaki, K., Miyata, Y., Hoshino, M.
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta-Proteins Proteom.

      Volume: 1867 Issue: 9 Pages: 813-820

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2019.06.007

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 19F-NMR for Fragment-Based Drug Discovery2019

    • Author(s)
      Chojiro Kojima
    • Organizer
      8th Asia-Pacific NMR Symposium 2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] NMRで分子集団の構造を捉える2019

    • Author(s)
      児嶋長次郎
    • Organizer
      第20回若手NMR研究会
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      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 19F-NMR for Drug Discovery2019

    • Author(s)
      Chojiro Kojima
    • Organizer
      Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2019
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      2019 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2021-12-27  

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