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Diverse RNA modifications at neuronal synapses and their role in neuropsychiatric diseases

Publicly Offered Research

Project AreaConstructive understanding of multi-scale dynamism of neuropsychiatric disorders
Project/Area Number 19H05212
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

王 丹  京都大学, 高等研究院, 特定拠点准教授 (50615482)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
KeywordsRNAメチル化 / YTHDF1 / 微小管 / APC / m1A / inosine / シナプトーム / 修飾塩基 / イノシン / N1-アデノシン / シナプス / 網羅解析 / NGS / 局所翻訳 / 精神疾患 / バイオマーカー
Outline of Research at the Start

精神疾患のバイオマーカー、診断法、治療法の開発において、手がかりが掴めていない。申請者はシナプスに局在するRNAの化学修飾(シナプスに局在するエピトランスクリプトーム)に着目し、特にメチル化アデノシン塩基(m6A)をもつmRNAおよびlncRNAを網羅的に解析した結果、ヒト神経発達および精神疾患に関与する数千もの遺伝子の転写物が検出され、その修飾認識の阻害がシナプス形態および機能の異常を誘発することを明らかにした。本研れは、化学修飾を目印にしたRNA群の詳細な機能解析をすることによって、シナプスの生理的機能や精神疾患の分子病態の解明に挑む。

Outline of Annual Research Achievements

2020年は予定通り、研究計画項目2を実施し、RNAメチル化修飾に関連するタンパク質の機能阻害実験を行い、マウス海馬の神経細胞の機能への影響をin vitroとin vivoの両方において検証した。具体的には、自発的神経活動が起きる初代培養神経細胞を用い、RNA修飾を制御する分子YTHDF1の発現レベルをRNAノックダウン技術を用いて操作し、神経の発達状況やスパイン形成、さらにin vivoでの神経発達の検証実験などを行った。その結果、RNA修飾読み取りタンパク質YTHDF1は分化後の神経細胞に高発現し、その機能欠損は培養神経細胞の中で極性、軸索、樹状突起、スパインなどさまざまな発達段階を阻害することを明らかになった。さらに、YTHDF1の機能を表出する細胞メカニズムとして、微小管末端に存在する翻訳制御タンパクadenomatous polyposis coli(APC)を同定した。RNAメチル化修飾とその下流シグナルを読み取るYTHDF1はAPC顆粒の形成に必要とされる。その欠損によるAPC顆粒の機能喪失は微小管の機能を阻害し、神経発達に障害をもたらすことを明らかにした。さらに、統合失調症および自閉症と関係するゲノム変異がRNAメチル化酵素に存在し、こちらの変異を神経細胞に導入した際に、同じに神経細胞の発達が阻害される結果が得られた(bioRxiv, 2021)。この結果から、RNAメチル化修飾の不具合が神経発達障害につながる可能性を示唆される。最後に、RNA修飾と遺伝子関連の解析ツールの開発や、脳内にあるRNA修飾の多様性とストレスによる精神疾患(PTSD)に注目した解析結果を発表した(Bioconductor, 2021; bioRxiv 2021.02.17.431575)

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Open Access: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Invited: 9 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Epitranscriptomic Dysregulation in Stress-induced Psychopathologies2021

    • Author(s)
      Ohtan Wang Dan、Joshi Kandarp、Gururajan Anand
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2021.02.17.431575

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Schizophrenia and autism associated mutations and disrupted m6A signal by YTHDF1 cause defects in microtubule function and neurodevelopment2020

    • Author(s)
      Roy Rohini、Li Xiangru、Hou Shengqun、Fujiwara Yoshie、Sukegawa Momoe、Hong Wan-Ting、Oomoto Ikumi、Ito Hidenori、Joshi Kandarp、Fan Ruolin、Nagata Koh-ichi、Lai Kwok-on、Wang Dan Ohtan
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2020.11.14.382556

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] RNA N6-Methyladenosine and the Regulation of RNA Localization and Function in the Brain2020

    • Author(s)
      Madugalle Sachithrani U.、Meyer Kate、Wang Dan Ohtan、Bredy Timothy W.
    • Journal Title

      Trends in Neurosciences

      Volume: 43 Issue: 12 Pages: 1011-1023

    • DOI

      10.1016/j.tins.2020.09.005

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] More Dynamic, More Quantitative, Unexpectedly Intricate: Advanced Understanding on Synaptic RNA Localization in Learning and Memory2020

    • Author(s)
      Rohini R, Nobuyuki S, Wang DO*.
    • Journal Title

      Neurobiol Learn and Mem

      Volume: 168 Pages: 107149-107149

    • DOI

      10.1016/j.nlm.2019.107149

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nanoparticle-based local translation reveals mRNA as translation-coupled scaffold with anchoring function2019

    • Author(s)
      Kashida S, Wang DO, Saito H, Gueroui Z*
    • Journal Title

      PNAS

      Volume: 116(27) Pages: 13346-13351

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] RNA 化学修飾と精神疾患-神経シナプスからの理解2019

    • Author(s)
      助川桃枝・王 丹*
    • Journal Title

      医学の歩み

      Volume: 269(10) Pages: 811-812

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] RNA modifications in nervous system2021

    • Author(s)
      Wang DO
    • Organizer
      Asian Chemical Biology Initiative
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Emerging Epitranscriptomics in the Synapses2019

    • Author(s)
      Wang DO et al
    • Organizer
      Indian Academy of Neuroscience
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Emerging Neuropitranscriptomics2019

    • Author(s)
      Wang DO et al
    • Organizer
      2019 Tzu Chi-Academia Sinica Biomedical Conference
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Dynamic RNA Imaging2019

    • Author(s)
      Wang DO et al
    • Organizer
      Australasian Neuroscience Society meeting
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] RNA Epigenetics in Neurons and Synapses2019

    • Author(s)
      Wang DO
    • Organizer
      生理研研究会「記憶研究会」
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Synaptic Epitranscriptomics and Dynamic RNA imaging2019

    • Author(s)
      Wang DO et al
    • Organizer
      EBPS Biennial Meeting
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] RNA modifications and translational regulation at neuronal synapses2019

    • Author(s)
      Wang DO et al
    • Organizer
      ISN-ASN
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Epitranscriptomics in Synapses2019

    • Author(s)
      Wang DO et al
    • Organizer
      NEURO2019, Asian Chemical Biology Initiative 2019 Yangon Meeting
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Emerging Neuropitranscriptomics2019

    • Author(s)
      Wang DO et al
    • Organizer
      2nd SPIRITS International Symposium
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] Oxford Handbook on Neuronal Protein synthesis2021

    • Author(s)
      Dan Ohtan Wang
    • Total Pages
      512
    • Publisher
      Oxford University Press
    • ISBN
      9780190686307
    • Related Report
      2020 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2021-12-27  

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