• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

DNAカーテン測定によるヒストン化学修飾がクロマチン凝集に与える影響の解明

Publicly Offered Research

Project AreaChromatin potential for gene regulation
Project/Area Number 19H05260
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

寺川 剛  京都大学, 理学研究科, 助教 (20809652)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥8,580,000 (Direct Cost: ¥6,600,000、Indirect Cost: ¥1,980,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2019: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Keywordsコンデンシン / ヌクレオソーム / 蛍光顕微鏡観察 / DNAカーテン / 一分子実験 / 染色体 / ヒストン化学修飾 / 1分子蛍光顕微鏡観察 / 染色体凝集 / クロマチン / エピジェネティクス
Outline of Research at the Start

真核生物の遺伝子発現は、クロマチン構造によって制御されている。有糸分裂期のクロマチン構造はコンデンシンとよばれるタンパク質によって制御されていることが知られている。また、クロマチンの構造変化はヒストンの化学修飾によっても制御されていることがわかってきた。本研究では、DNAカーテンと呼ばれる一分子蛍光顕微鏡観察法を用いて「ヒストンの化学修飾」と「コンデンシンが引き起こすクロマチンDNAの構造変化」の関係を明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、「ヒストンの化学修飾」と「コンデンシンが引き起こすクロマチンDNAの構造変化」の関係を明らかにすることであった。そのために、コンデンシンがヌクレオソームを再構成したDNAを凝縮する様子を一分子レベルで観察する手法を確立した。まず、ガラススライド上に描画したナノパターン上にDNAの片端を固定して、溶液流によって伸長させた。DNAをYoYoIで蛍光標識すると、DNAが伸長する様子を観察することができた。そこにコンデンシンとATPを溶液流に乗せてロードした。コンデンシンをロードして、約1分後にDNAの長さが短くなるのが観察された。この結果は、1分子のコンデンシンが分子モーター活性を利用してDNAの縮小反応を行っていることを示唆した。次に、ガラススライド上に描画したナノパターン上にヌクレオソームを再構成したDNAの片端を固定して、溶液流によって伸長させた。ヌクレオソームの再構成には、大腸菌に発現させた酵母の野生型H3、H4、H2Bと、FLAGタグをコンジュゲートしたH2Bを精製して用いた。ヌクレオソームを量子ドットで蛍光標識すると、複数のヌクレオソームがDNA上に並んでいる様子を観察することができた。そこにコンデンシンとATPを溶液流に乗せてロードした。ヌクレオソームを量子ドットで染色しなかった場合、コンデンシンをロードしてから約1分後にヌクレオソームDNAの長さが短くなるのが観察された。一方で、量子ドットで染色すると、ヌクレオソームDNAの長さが短くなるのを観察することができなかった。この結果は、コンデンシンが分子モーター活性を利用してDNAの縮小反応を起こすときに、リング状の構造をとるコンデンシンのリング内部をヌクレオソームがくぐり抜けていることを示唆した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2020 2019

All Presentation (3 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Presentation] Reconstitution of protein functions on chromatin curtain2020

    • Author(s)
      寺川剛
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] DNA curtains: high-throughput single molecule imaging for DNA transactions2019

    • Author(s)
      寺川剛
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Single-molecule observation of chromatin condensation induced by Condensin molecular motor2019

    • Author(s)
      寺川剛
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi