Regulation of intragenic heterochromatin in plants

Publicly Offered Research

Project Area	Chromatin potential for gene regulation
Project/Area Number	19H05272
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Biological Sciences
Research Institution	Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University
Principal Investigator	佐瀬英俊沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット, 准教授 (70510006)
Project Period (FY)	2019-06-28 – 2021-03-31
Project Status	Discontinued (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help	¥8,450,000 (Direct Cost: ¥6,500,000、Indirect Cost: ¥1,950,000) Fiscal Year 2020: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000) Fiscal Year 2019: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Keywords	ヘテロクロマチン / トランスポゾン / シロイヌナズナ / イネ / 植物 / エピジェネティクス / 転写
Outline of Research at the Start	動植物のゲノムでは進化の過程で遺伝子内に大量の転移因子(トランスポゾン)が蓄積されている。興味深いことにこうした遺伝子内転移因子は遺伝子間にある転移因子と同様に、抑制的クロマチン修飾であるヒストンH3K9メチル化やDNAメチル化を受けてヘテロクロマチン化している。しかしながら、転写が活発な遺伝子領域でヘテロクロマチン構造がどのような分子メカニズムで維持されているのか未だ不明な点が多い。本研究では遺伝子領域に存在するヘテロクロマチン制御のメカニズムと、遺伝子発現制御におけるその機能・進化を植物モデルを用いて明らかにすることを目的とする。
Outline of Annual Research Achievements	研究課題名:植物における遺伝子内ヘテロクロマチンの制御と機能動植物のゲノムでは進化の過程で遺伝子内の非翻訳領域(イントロンやUTR配列)に転移因子(トランスポゾン)が大量に蓄積されている。興味深いことにこうした遺伝子内転移因子(intragenic transposons)は遺伝子間にある転移因子と同様に、抑制的クロマチン修飾であるヒストンH3K9メチル化やDNAメチル化を受けてヘテロクロマチン化している。しかしながら、転写が活発な遺伝子領域のクロマチン環境下でヘテロクロマチン構造がどのような分子メカニズムで維持されているのか未だ不明な点が多い。本研究計画では遺伝子領域に存在するヘテロクロマチン制御の分子メカニズムと、遺伝子発現制御におけるその機能・進化を植物モデルを用いて明らかにすることを目的としている。2020年度は、シロイヌナズナにおいて遺伝子内ヘテロクロマチンがどのように転写されているかの解析を行った。また、この過程に関与する因子群についての探索を行った。
Research Progress Status	令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
Strategy for Future Research Activity	令和2年度が最終年度であるため、記入しない。