• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Design strategy for specific chemical probes visualizing multimolecular crowding biosystems

Publicly Offered Research

Project AreaChemical Approaches for Miscellaneous / Crowding Live Systems
Project/Area Number 20H04700
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

田井中 一貴  新潟大学, 脳研究所, 教授 (80506113)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywordsケミカルプローブ / 組織夾雑 / 3Dイメージング
Outline of Research at the Start

本研究は、組織透明化技術を用いて夾雑なヒト脳のシステムを従来の2次元平面画像ではなく、立体のまま全てを観察する3次元イメージングにより紐解くためのケミカルプローブの開発を目的とする。これまでに開発された屈折率調整液の課題を克服することで組織透明化技術を完成させると共に、組織透明化における根本的な化学的原理を明らかにする。また、これまでに得られたケミカルプローブをシーズとし、より特異性を示す分子プローブへと機能化させるための合理的スクリーニング手法を開発し、病理学的応用などに適用可能ななプローブを開発するための新規戦略を開拓する。

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、組織透明化技術を用いて、夾雑なヒト脳のシステムを、従来の2次元平面画像ではなく、立体のまま全てを観察する3次元イメージングにより紐解くためのケミカルプローブの開発を目的とする。これまでに、ヒト脳を高度に透明化するための透明化プロトコールの開発に取り組んだ結果、1.組織の内在的因子を保存したままの高度な脱脂手法、2.透明化時に生じる組織の褐変およびリポフスチンなどの強度な自家蛍光の効率的な抑制手法を開発することに成功した。
本研究では、以下の項目に関する研究開発を実施する。
(1) 大型組織に適用可能な完成版透明化プロトコールの開発:これまでに開発された屈折率調整液の課題を克服することで組織透明化技術を完成させると共に、組織透明化における根本的な化学的原理を明らかにする。
(2) 組織化学反応との組み合わせによる包括的染色スクリーニング系の開発:これまでに自家蛍光の抑制を目的として発見に至った化学処理は、自家蛍光の抑制のみならず、それぞれのケミカルプローブの染色性に変化がもたらされることを明らかにした。組織に対する化学修飾の違いにより、異なる染色性が発揮されることを活用し、種々の組織化学反応とケミカルプローブの組み合わせに基づく包括的染色スクリーニング系を構築する。この新規戦略により、緻密な分子デザインによるケミカルプローブの開発とは真逆のハイスループット機能性プローブ探索戦略を開拓する。
本年度は、透明化条件において特異的な染色パターンを示す蛍光プローブの染色プロファイリングを実施した。屈折率調整による染色色素の解離を防止するために、染色後にホルマリンによる追加固定が可能な蛍光色素のスクリーニングを行った結果、神経細胞の胞体や残留血液成分、軸索、老人斑などに特異的なケミカルプローブの探索に成功した。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Spatiotemporal dynamics of clonal selection and diversification in normal endometrial epithelium2022

    • Author(s)
      Yamaguchi Manako、Nakaoka Hirofumi、Suda Kazuaki、Yoshihara Kosuke、Ishiguro Tatsuya、Yachida Nozomi、Saito Kyota、Ueda Haruka、Sugino Kentaro、Mori Yutaro、Yamawaki Kaoru、Tamura Ryo、Revathidevi Sundaramoorthy、Motoyama Teiichi、Tainaka Kazuki、Verhaak Roel G. W.、Inoue Ituro、Enomoto Takayuki
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 943-943

    • DOI

      10.1038/s41467-022-28568-2

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Using a new three-dimensional CUBIC tissue-clearing method to examine the brain during experimental cerebral malaria.2021

    • Author(s)
      Matsuo-Dapaah J, Lee MSJ, Ishii KJ, Tainaka K, Coban C.
    • Journal Title

      Int Immunol.

      Volume: 33 Issue: 11 Pages: 587-594

    • DOI

      10.1093/intimm/dxab060

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mechanical load regulates bone growth via periosteal Osteocrin2021

    • Author(s)
      Watanabe-Takano H., Ochi H., Chiba A., Matsuo A., Kanai Y., Fukuhara S., Ito N., Sako K., Miyazaki T., Tainaka K., Harada I., Sato S., Sawada Y., Minamino N., Takeda S., Ueda H.R., Yasoda A., Mochizuki N.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 36 Issue: 2 Pages: 109380-109380

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.109380

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Whole-organ analysis of TGF-β-mediated remodelling of the tumour microenvironment by tissue clearing.2021

    • Author(s)
      Kubota SI, Takahashi K, Mano T, Matsumoto K, Katsumata T, Shi S, Tainaka K, Ueda HR, Ehata S, Miyazono K.
    • Journal Title

      Commun. Biol.

      Volume: 4 Issue: 1 Pages: 294-294

    • DOI

      10.1038/s42003-021-01786-y

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Three-dimensional understanding of the morphological complexity of the human uterine endometrium2021

    • Author(s)
      Yamaguchi Manako、Yoshihara Kosuke、Suda Kazuaki、Nakaoka Hirofumi、Yachida Nozomi、Ueda Haruka、Sugino Kentaro、Mori Yutaro、Yamawaki Kaoru、Tamura Ryo、Ishiguro Tatsuya、Motoyama Teiichi、Watanabe Yu、Okuda Shujiro、Tainaka Kazuki、Enomoto Takayuki
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 24 Issue: 4 Pages: 102258-102258

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102258

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Versatile whole-organ/body staining and imaging based on electrolyte-gel properties of biological tissues2020

    • Author(s)
      Susaki Etsuo A.、Shimizu Chika、Kuno Akihiro、Tainaka Kazuki、Li Xiang、Shibayama Mitsuhiro、Ueda Hiroki R. et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 1982-1982

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15906-5

    • NAID

      120006956725

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Neurotransmission through dopamine D1 receptors is required for aversive memory formation and Arc activation in the cerebral cortex2020

    • Author(s)
      Saito Nae、Tainaka Kazuki、Macpherson Tom、Hikida Takatoshi、Yamaguchi Shun、Sasaoka Toshikuni
    • Journal Title

      Neuroscience Research

      Volume: - Pages: 58-65

    • DOI

      10.1016/j.neures.2020.04.006

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 組織透明化の化学的アプローチ2021

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      ISNAC2021_若手フォーラム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 生体組織透明化技術CUBICによる包括的3Dイメージング技術2021

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第757回 新潟医学会例会シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 組織透明化・3Dイメージング技術による3次元神経病理学2021

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      2021年度 生理研研究会 機能的神経回路の構築と動作を支える分子細胞基盤
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ヒト脳組織透明化・3Dイメージングによる3次元神経病理学2021

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第127回日本解剖学会総会・企画シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 脳透明化2020

    • Author(s)
      田井中一貴
    • Organizer
      第3回若手育成セミナー「神経回路の可視化・操作・モデリングのための最先端技術」
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi