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器官配置の周期を構成し変調するメリステム動態の理論生物学:コケと花

Publicly Offered Research

Project AreaIntrinsic periodicity of cellular systems and its modulation as the driving force behind plant development
Project/Area Number 20H05415
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

藤本 仰一  大阪大学, 大学院理学研究科, 准教授 (60334306)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥8,710,000 (Direct Cost: ¥6,700,000、Indirect Cost: ¥2,010,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Keywords数理モデル / 細胞分裂面 / 形態形成 / メカノバイオロジー / 幾何学 / 理論生物学 / メリステム / 花 / コケ植物 / コケ
Outline of Research at the Start

コケ植物から被子植物に至る地上部の体制は空間周期性を示す。被子植物の花器官は幹細胞組織(メリステム)の周縁へ同心円状に配置し、この配置に含まれる器官の数が周期となる。コケ植物では幹細胞の細胞分裂面の数が空間周期と強く相関する。これら周期は系統ごとに変調されることで多様性を創出するが、その仕組みは未解明である。本研究では、花器官配置および幹細胞の分裂面の数理モデリングとともに、実験データ定量解析と相互フィードバックを行い、空間周期を構成し変調する発生基盤を絞り込む。さらに、コケと花の空間周期の調節原理の共通性を理論的に探求する。

Outline of Annual Research Achievements

細胞分裂面を決定するルールをヒメツリガネゴケの葉になる組織で見出した。分裂面が親細胞の重心を通る知見と、野生型およびshr (shoot root)変異体それぞれの親細胞の形をphase-fieldモデルへ導入して、面積最小の曲面を探索した。その結果、shr変異体で観測した分裂面は、面積最小曲面の方向や位置と一致した。一方で、野生型の分裂面は、面積最小曲面と一致する細胞と大きく異なる細胞とが、ほぼ同頻度であった。この結果は、shrが重心を通る面積最小則(Errera’s rule)を「上書き」して分裂面を決定することを示唆する。
また、Anemoneなどの花器官の空間的配置に関する数理解析を動物に応用した。イソギンチャク(sea anemone)において、内臓器官の配置が左右対称な個体と放射対称な個体が同種内で共存することを、動物で初めて見出した。花器官配置の数理モデルを応用して解析を進め、対称性を制御する発生基盤を予測した(Zoological Lett. 2021)。
さらに、領域内融合研究を通じて、異なる細胞群との境界を形作る力学的仕組みを見出した。Arabidopsis根維管束の細胞分裂に伴い、木部と前形成層の境界は、直線的に細胞が配置することを我々は見出してきた。分裂は、境界から離れた2か所に対称に位置する師部へ局在した。我々はこの局所的かつ空間対称な分裂パタンをvertex modelへ導入した結果、師部から境界の方向への異方的な応力が維管束全体に生じた。この大域的な応力場が境界を圧迫した結果、境界の細胞配置が直線化した。動物上皮組織では、境界近くでの局所的な応力の生成が境界を形づくる。これに対して本成果では、遠位側に対称に局在する分裂による大域的かつ対称な応力の生成が境界を形づくる。この仕組みは、細胞壁などにより細胞が移動しにくい組織にとって力学的に適している。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Traveling wave of inflammatory response to regulate the expansion or shrinkage of skin erythema2022

    • Author(s)
      Sudo Maki、Fujimoto Koichi
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Issue: 2 Pages: e0263049-e0263049

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0263049

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Forebrain Architecture and Development in Cyclostomes, with Reference to the Early Morphology and Evolution of the Vertebrate Head2021

    • Author(s)
      Sugahara F, Murakami Y, Pascual-Anaya, J. and Kuratani, S
    • Journal Title

      Brain Behav. Evol.

      Volume: in press Issue: 1 Pages: 12-12

    • DOI

      10.1186/s40851-021-00180-0

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Tissue growth constrains root organ outlines into an isometrically scalable shape2021

    • Author(s)
      Fujiwara Motohiro、Goh Tatsuaki、Tsugawa Satoru、Nakajima Keiji、Fukaki Hidehiro、Fujimoto Koichi
    • Journal Title

      Development

      Volume: 148 Issue: 4 Pages: 196253-196253

    • DOI

      10.1242/dev.196253

    • NAID

      120007028967

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Polarity Fluctuation Inhibition by Memory in Collective Cell Motion2021

    • Author(s)
      Katsuyoshi Matsushita, Shunsuke Yabunaka and Koichi Fujimoto
    • Journal Title

      Journal of the Physical Society of Japan

      Volume: 90 Issue: 5 Pages: 054801-054801

    • DOI

      10.7566/jpsj.90.054801

    • NAID

      40022563209

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Mechanical Instability in Planar Epithelial Monolayers Leads to Cell Extrusion2020

    • Author(s)
      Satoru Okuda, Koichi Fujimoto
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 118 Issue: 10 Pages: 2549-2560

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2020.03.028

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Quantitative modeling of multicellular mechanics promoting pathogenesis and organogenesis.2022

    • Author(s)
      Koichi Fujimoto.
    • Organizer
      International Symposium on Evolutionary Genomics and Bioinformatics 2022
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞配置と器官配置の周期を構成し変調するメリステム動態の理論生物学.2021

    • Author(s)
      藤本仰一,鎌本直也,北沢美帆,嶋村正樹
    • Organizer
      日本植物学会第83回大会 シンポジウム「異分野協調と周期の変調で解き明かす植物の発生メカニズム」
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 細胞から個体に至る動植物の形を定量し生まれる仕組みを探る数理2021

    • Author(s)
      藤本仰一
    • Organizer
      第23回日本進化学会 夏の学校
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 発見!根の先端は橋と同じだ! 器官の形に生物種を超えた共通性をもたらす物理

    • URL

      https://resou.osaka-u.ac.jp/ja/research/2021/20210303_1

    • Related Report
      2020 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2023-12-25  

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