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揺動散逸定理の破れと非ガウス性解析に基づく非熱的揺らぎの有用性評価

Publicly Offered Research

Project AreaInformation physics of living matters
Project/Area Number 20H05536
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

水野 大介  九州大学, 理学研究院, 教授 (30452741)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥6,760,000 (Direct Cost: ¥5,200,000、Indirect Cost: ¥1,560,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Keywordsアクティブマター / 非平衡メカニクス / 非平衡散逸 / 非ガウス揺らぎ / 揺動散逸定理 / マイクロレオロジー / 非平衡力学 / アクティブガラス / 生体高分子機械 / 非平衡分布 / 非熱揺らぎ
Outline of Research at the Start

モーター蛋白質を始めとする生体高分子機械は、細胞内部で最適に稼働するために、細胞内部環境の力学特性や非熱的揺らぎを積極的に利用する術を獲得したと思われる。その結果、希薄なin vitro系よりも密に詰め込まれた細胞内の混み合い環境の下で最適に稼働する。本研究では、生体高分子機械の稼働速度や効率に対して周囲媒質の”非平衡性”が及ぼす影響に着目して、この謎の解明に寄与する。細胞内の非熱的揺らぎが持つ時空間特性を実測し、その有用性を情報物理学的観点から解析し、生体高分子機械の設計原理を探求する。

Outline of Annual Research Achievements

生体高分子機械は、細胞内部で生成する非熱的揺らぎを利用している可能性がある。そこで、細胞や細胞モデルシステム内で発生する非熱揺らぎの時空間分布のスペクトルを求め、非熱揺らぎのうち、生体高分子のようなメソスケール自由度が有効に利用できる成分を評価することを目指している。これまで行ってきた非熱的揺らぎの強度の評価に加えて、非熱的揺らぎの統計分布と時空間相関を新たに観測対象に加えることで、非熱揺らぎが系内部のメソスケール自由度の振る舞いを活性化する”効率”を評価するためのマイクロレオロジー(メソスケールの非熱揺らぎと応答の計測)を行った。細胞内での評価が困難な生体高分子機械の機能にかわり、観測実績がある周囲媒質の非線形硬化や非平衡流動を指標として、非熱的揺らぎの“有用性”と揺らぎの時空間分布の関係性を評価することを試みた。
また、上記を実行するために、以下の技術開発を行った。光捕捉を用いたマイクロレオロジー法は、非平衡媒質内部の揺らぎ・応答を物理法則の探索が可能な水準で観測する唯一の方法である。ただし、代謝活性の高い細胞質は光化学反応性を持つため、光捕捉レーザーの照射がその性質を変化させてしまう。そこで、フィードバックを用いた非侵襲的な粒子追跡を行うことで、0.5mW以下の微弱なレーザーによる細胞内観測を実現してこの問題を解決した。活発な代謝活動を長時間維持できる細胞質モデル系も作製した。また、光学的に不均質な細胞質中でマイクロレオロジー観測を行う技術を開発中であり、これらの開発技術を評価するとともに、非熱的揺らぎが保持する“情報”と“有用性”の関係性を試験的に探索した。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (36 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 1 results) Presentation (30 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Nonlinear master relation in microscopic mechanical response of semiflexible biopolymer networks2022

    • Author(s)
      Natsuki Honda, Keigo Shiraki, Francis van Esterik, Shono Inokuchi, Hiroyuki Ebata and Daisuke Mizuno
    • Journal Title

      New Journal of Physics

      Volume: -

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Noise-Induced Acceleration of Single Molecule Kinesin-12021

    • Author(s)
      Ariga Takayuki、Tateishi Keito、Tomishige Michio、Mizuno Daisuke
    • Journal Title

      Physical Review Letters

      Volume: 127 Issue: 17 Pages: 178101-178101

    • DOI

      10.1103/physrevlett.127.178101

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  • [Journal Article] Rapid local compression in active gels is caused by nonlinear network response2020

    • Author(s)
      Mizuno D.、Tardin C.、Schmidt C. F.
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 16 Issue: 40 Pages: 9369-9382

    • DOI

      10.1039/c9sm02362c

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  • [Journal Article] Experimental and theoretical energetics of walking molecular motors under fluctuating environments2020

    • Author(s)
      Ariga Takayuki、Tomishige Michio、Mizuno Daisuke
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: 12 Issue: 2 Pages: 503-510

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00684-7

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  • [Journal Article] Optimization of Optical Trapping and Laser Interferometry in Biological Cells2020

    • Author(s)
      Sugino Yujiro、Ikenaga Masahiro、Mizuno Daisuke
    • Journal Title

      Applied Sciences

      Volume: 10 Issue: 14 Pages: 4970-4970

    • DOI

      10.3390/app10144970

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  • [Journal Article] Biophysics at Kyushu University2020

    • Author(s)
      Akiyama Ryo、Annaka Masahiko、Kohda Daisuke、Kubota Hiroyuki、Maeda Yusuke、Matsumori Nobuaki、Mizuno Daisuke、Yoshida Norio
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: 12 Issue: 2 Pages: 245-247

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00643-2

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      杉野裕次郎, 江端宏之, 水野大介
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      杉野裕次郎、江端宏之, 水野大介
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      T. Ariga, Y. Tomishige, D. Mizuno
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      Kenji Nishizawa, Daisuke Mizuno
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      Yujiro Sugino, Kenji Nishizawa, Daisuke Mizuno
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      井口昇之、水野 大介
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      杉野裕次郎, 水野大介
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      井口昇之, 松岡亮介, 水野大介
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      物理学会2021年秋季大会
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  • [Presentation] 揺動散逸定理の破れの細胞質レオロジーへの示唆2021

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      熊丸一平, 杉野裕次郎, 水野大介
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      物理学会2021年秋季大会
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      荊原佳祐, 江藤高宏, 水野大介
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      物理学会2021年秋季大会
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      濱田啓聖, 杉野裕次郎, 水野大介
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      第 127 回日本物理学会九州支部例会
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      第 127 回日本物理学会九州支部例会
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      杉野裕次郎, 熊丸一平, 福本昂平, 曽和義幸, 高橋達郎, 水野大介
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      井口昇之, 水野大介
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  • [Presentation] 光てこを用いたレーザー干渉法による粒子追跡2021

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      井口昇之, 水野大介
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      江藤高宏, 荊原佳祐, 荻原僚, 水野大介
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      荊原佳祐,江藤高宏,水野大介
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      井口昇之,水野大介
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Published: 2020-04-28   Modified: 2022-12-28  

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