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ハイスループット電気化学培養法による電気細菌の同時複数単離法の開発

Publicly Offered Research

Project AreaPost-Koch Ecology: The next-era microbial ecology that elucidates the super-terrestrial organism system
Project/Area Number 20H05590
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionNational Institute for Materials Science

Principal Investigator

岡本 章玄  国立研究開発法人物質・材料研究機構, 国際ナノアーキテクトニクス研究拠点, グループリーダー (70710325)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥8,320,000 (Direct Cost: ¥6,400,000、Indirect Cost: ¥1,920,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Keywords電気培養 / フローサイトメトリー / 細胞外電子移動 / ハイスループット電気化学 / 磁性ナノ粒子 / シングルセルソーター / 電極培養 / ハイスループット
Outline of Research at the Start

最近の研究で、電気細菌や発電細菌と呼ばれる細胞外固体と直接電子のやり取り「Extracellular Electron Transport, EET」を行う細菌が特に熱水噴出孔などの深海生態系において豊富に存在する証拠が得られている。本研究では、深海生態系においてEET を行う細菌がどのくらいいるのか、と言った基本的な問いに答えるため、深海の海水から1細胞ずつ細菌を分けた後に電極上で培養・単離する実験をハイスループットに行う。

Outline of Annual Research Achievements

電気細菌や発電細菌と呼ばれる細胞外固体と直接電子のやり取り「細胞外電子移動(Extracellular Electron Transport, EET)」を行い代謝する細菌が特に熱水噴出孔などの深海生態系において注目されており、電気培養によって未分離の細菌を集積・単離する試みが盛んに行われている。しかし、電気化学測定系の制約 から単離効率が極めて低いという長年の課題があった。本研究では、フローサイトメトリーによって1細菌に分離してから電極培養するハイスループット電気微生物培養法の開発を行なった。これまでに、環境サンプルから電極培養で環境中から電気細菌を単離することに成功したが、96ウェルプレート上で電流生成が観測されるウェル数が少ないという問題点があった。各ウェルの中央に配置されている電極上に細菌が到達しない場合に電気培養が進まないことが考えられたため、電気細菌表面に選択的に吸着する磁性ナノ粒子を開発した(特許出願済み)。ナノ粒子を用いることで、環境中の電気細菌が濃縮され高い電流生成が示されることを確認した。さらに、ナノ粒子が吸着した後にも細菌が電流生成を行うことが確認できたため、電極培養へ直接アプライできることが示された。今後は、磁性ナノ粒子を用いて電気細菌を濃縮した後に、電極上に磁力で誘導、電気培養を行うことで1細胞電極培養の成功率を高める予定である。加えて、単離した細菌株の新種提唱の論文と電気化学解析を行なった論文の2報を準備中である。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (31 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 15 results) Patent(Industrial Property Rights) (11 results) (of which Overseas: 3 results)

  • [Journal Article] Current Production Capability of Drug-Resistant Pathogen Enables Its Rapid Label-Free Detection Applicable to Wastewater-Based Epidemiology2022

    • Author(s)
      Miran Waheed、Long Xizi、Huang Wenyuan、Okamoto Akihiro
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 10 Issue: 2 Pages: 472-472

    • DOI

      10.3390/microorganisms10020472

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    • Author(s)
      Hirano Shin-ichi、Ihara Sota、Wakai Satoshi、Dotsuta Yuma、Otani Kyohei、Kitagaki Toru、Ueno Fumiyoshi、Okamoto Akihiro
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 10 Issue: 2 Pages: 270-270

    • DOI

      10.3390/microorganisms10020270

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    • Author(s)
      Naradasu Divya、Miran Waheed、Sharma Shruti、Takenawa Satoshi、Soma Takamitsu、Nomura Nobuhiko、Toyofuku Masanori、Okamoto Akihiro
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 12 Pages: 682685-682685

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.682685

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    • Author(s)
      Long Xizi、Okamoto Akihiro
    • Journal Title

      Bioresource Technology

      Volume: 320 Pages: 124290-124290

    • DOI

      10.1016/j.biortech.2020.124290

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    • Filing Date
      2021
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Published: 2020-04-28   Modified: 2022-12-28  

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