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亜鉛フィンガードメインUBZファミリーのユビキチン結合特異性の解明

Publicly Offered Research

Project AreaProteolysis in the Regulation of Biological Processes
Project/Area Number 21025037
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionHigh Energy Accelerator Research Organization

Principal Investigator

川崎 政人  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教 (00342600)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥6,400,000 (Direct Cost: ¥6,400,000)
Fiscal Year 2010: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2009: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
KeywordsX線結晶構造解析 / ユビキチン / 転写制御 / DNA修復 / 分子認識
Research Abstract

新規ユビキチン結合ドメインUBZ(Ub-binding zinc finger)は8つのグループからなるファミリーを形成する。UBZファミリーのうちタイプ3とタイプ4のグループはDNA修復に関与するタンパク質に見出される。一方、タイプ1およびタイプ5のグループは、転写因子NF-κBの活性制御に関与するタンパク質の中に見出される。本研究ではこれらのDNA修復と転写制御に関わるUBZドメインと種々のユビキチン鎖との相互作用の特異性を解析し、結晶構造解析によりそれらのユビキチン鎖結合特異性の違いを分子レベルで解明することを目的とする。
UBZドメインはいずれも30アミノ酸程度の短い配列のため、結晶化が困難であった。そこで平成21年度に結晶成長を助けるために緑色蛍光タンパク質(GFP)をタグとして付加した状態での精製・結晶化を検討したところ、タイプ1に属するTAX1BP1のUBZドメインについて、GFPと融合させた状態での結晶化に成功し、構造解析を行うことができた。平成22年度はGFP融合法を他のUBZドメインに適用し、GFP-UBZ融合タンパク質単独での結晶化ならびにユビキチンとの共結晶化を試みた。その結果タイプ4に属するWrnip1のUBZドメインのGFP融合タンパク質とユビキチンの複合体の結晶を得ることに成功した。これまでpolηおよびNEMOのUBZドメインについてはNMR構造が報告されており、そのC末端のヘリックスがユビキチンと結合することが示唆されていた。しかしながら今回のGFP融合法を用いたWrnip1のUBZドメインとユビキチンとの複合体の結晶構造解析の結果、ユビキチンはpolηやNEMOのUBZドメインの予想されていた結合面とは全く異なる新しい面で結合していた。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2010 2009

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Crystallization of small proteins assisted by green fluorescent protein2010

    • Author(s)
      Nobuhiro Suzuki
    • Journal Title

      Acta Crystallogr.D Biol.Crystallogr.

      Volume: VOL.66 Pages: 1059-1066

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] GFP融合法を用いた低分子量蛋白質の結晶化2010

    • Author(s)
      川崎政人
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-06-18
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Structural studies of the ubiquitin binding zinc finger domains of human TAX1-binding protein-1(TAX1BP1)2010

    • Author(s)
      Ahmed Rohaim
    • Organizer
      第27回PFシンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場エポカル
    • Year and Date
      2010-03-09
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] GFPタグを利用した蛋白質の結晶化2010

    • Author(s)
      川崎政人
    • Organizer
      PF研究会「放射光利用による構造生物学の将来像」
    • Place of Presentation
      KEK研究本館小林ホール
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] WRMP1のユビキチン結合ジンクフィンガーの結晶構造解析2009

    • Author(s)
      鈴木喜大
    • Organizer
      日本結晶学会2009年度年会
    • Place of Presentation
      関西学院大学
    • Related Report
      2009 Annual Research Report

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Published: 2009-04-01   Modified: 2018-03-28  

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