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単一細胞レベルの遺伝子発現プロファイルに基づく多能性獲得機構の解明

Publicly Offered Research

Project AreaThe germline: its developmental cycle and epigenome network
Project/Area Number 21028010
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

柊 卓志  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 特定拠点教授 (00512477)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥7,600,000 (Direct Cost: ¥7,600,000)
Fiscal Year 2010: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
Fiscal Year 2009: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
Keywords細胞分化 / 発生生物学 / 哺乳類生物学 / 細胞生物学
Research Abstract

本研究は、マウス初期胚から個々の胚細胞ごとにcDNAを増幅、精密度の高い遺伝子発現プロファイルを構築し、多能性細胞を生み出す初期発生のメカニズムを分子レベルで解明することを目指している。
昨年度は、個々の胚細胞からのcDNA増幅および定量的PCRによる遺伝子発現解析をおこない、胚盤葉上層と初期内胚葉の2つの細胞系統がわかれ始める発生時期を胎生3.25日前後と特定した。当該年度は、さらに網羅的な遺伝子発現情報の収集と統計学的解析のため、得られたサンプルを用いてマイクロアレイ解析をおこなった。
マイクロアレイデータの主成分分析では、胎生3,25日から胎生3.5,4.5日へと発生時間軸に沿って、非常に明瞭な2群への分化の方向性が認められ、定量的PCRで得られた知見を支持する結果が得られた。さらにアレイデータのクラスタリング解析から、新たな初期分化マーカーとなる複数の候補遺伝子を得た(e.g.Spp1, Fgf4, Cdyl2, Ppp1r3b, Lrp2)。この遺伝子群の中には、胚盤葉上層マーカーとしてFgf4も含まれており、最近の、マウス初期胚の単一胚細胞からの転写因子発現の解析報告との一致がみられた。いくつかの遺伝子については、定量的PCRによる遺伝子発現解析をおこない、マイクロアレイに含まれなかったサンプルからも分化マーカーとしての発現傾向が確認できた。
今回見つかった最初期マーカー遺伝子には転写因子以外の分子も含まれていた。これは本研究の解析手法である単一細胞cDNA増幅技術が、大規模解析可能な汎用性をもつ故に明らかになった重要な知見といえる。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2010

All Presentation (2 results)

  • [Presentation] Stochastic processes in the development of pluripotency in vivo2010

    • Author(s)
      柊卓志
    • Organizer
      Company of Biologists workshop, Stochasticity in Cell and Developmental Processes
    • Place of Presentation
      Cumberland Lodge, Windsor, Berkshire, UK(招待講演)
    • Year and Date
      2010-10-19
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] First mitoses : principles in embryonic patterning and what can go wrong with it2010

    • Author(s)
      柊卓志
    • Organizer
      26^<th> annual meeting of the European Society of Human Reproduction and Embryology (ESHRE)
    • Place of Presentation
      Rome, Italy(招待講演)
    • Year and Date
      2010-06-26
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

URL: 

Published: 2009-04-01   Modified: 2018-03-28  

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