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サンゴの熱ストレス応答の分子レベルでの網羅的解析

Publicly Offered Research

Project AreaCoral Reef Science for Symbiosis and Coexistence of Human and Ecosystem under Combined Stresses
Project/Area Number 21121505
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionOkinawa Institute of Science and Technology

Principal Investigator

新里 宙也  独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (70524726)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2009: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywordsサンゴ / ストレス / ゲノム / 白化現象 / 遺伝子発現応答
Research Abstract

サンゴの白化現象は海水温、光、塩分濃度など様々な要因が複雑に絡み合った様々な要因が複雑に絡み合った「複合ストレス」で引き起こされる事が示唆されている。複合ストレスを理解する為には、まず「単一」のストレスでのサンゴの応答メカニズムを解明する事から始めるべきだと考えた。本研究では白化現象の最大の要因であるとされる「海水温の上昇」に注目し、サンゴの熱ストレス応答を分子レベルで詳細に明らかにする事を目的とする。実験材料として、沖縄に普通に生息しゲノムプロジェクトが進行中で分子レベルでの研究基盤が最も整っているサンゴ、コユビミドリイシを用いる。
22年度に、熱ストレスを与えたサンゴと与えてないサンゴで、cDNAマイクロアレイによる遺伝子発現の違いを網羅的に解析した。その結果、ストレスにより発現の変動する遺伝子(全遺伝子の約4%)を突き止めた。これら遺伝子群から、熱ストレスにより影響を受けているサンゴの代謝系(DNA修復系やタンパク質分解系など)が明らかになった。一方で、共生している褐虫藻の遺伝子発現の変化は、特に検出出来なかった。このことから、熱ストレスは「ホスト」であるサンゴの方に影響を与えている可能性が示唆された。さらに、改良されたコユビミドリイシ・ゲノムの遺伝子モデルセットを元に、cDNAマイクロアレイの再設計を行い(2×108kから4×44kへアップグレード)、マイクロアレイ解析にかかるコストを半分に減らす事が出来た。これにより網羅的遺伝子発現解析がさらに容易になり、今後のサンゴの分子レベルでの研究がより発展することが期待される。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2011 2010 2009

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Identification of fast-evolving genes in the scleractinian coral Acropora using comparative EST analysis.2011

    • Author(s)
      Iguchi A, Shinzato C, Foret S, Miller DJ.
    • Journal Title

      PLos ONE

      Volume: (In press)

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Genome sequencing of the coral Acropora digitifera.2011

    • Author(s)
      Shinzato, C
    • Organizer
      ARC CoE Boden Conference-Genome Biology of Corals and their Relatives
    • Place of Presentation
      オーストラリア、タウンズビル
    • Year and Date
      2011-03-07
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] サンゴ生物学へのゲノム科学的アプローチ~バイオミネラリゼーション研究への応用に向けて~2011

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化-遺伝子から地球環境まで-」
    • Place of Presentation
      東京大学 大気海洋研究所
    • Year and Date
      2011-02-10
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] コユビミドリイシのマイクロアレイの開発2010

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      日本サンゴ礁学会
    • Place of Presentation
      つくばカピオ
    • Year and Date
      2010-12-02
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 造礁サンゴ、コユビミドリイシ(Acropora digitifera)のゲノム解読2010

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      日本動物学会
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2010-09-23
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] The coral Acropora digitifera genome project2010

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      Okazaki Biological conference
    • Place of Presentation
      ヤマハリゾートつま恋(静岡)
    • Year and Date
      2010-01-11
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] The coral Acropora digitifera genome project2009

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      International Symposium Marine Genomics
    • Place of Presentation
      サザンプラザ海邦(沖縄)
    • Year and Date
      2009-12-18
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] コユビミドリイシ・ゲノムプロジェクト2009

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      日本サンゴ礁学会
    • Place of Presentation
      本部町中央公民館(沖縄)
    • Year and Date
      2009-11-27
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] The coral Acropora digitifera genome project2009

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      International Workshop : The evolution of multicellularity
    • Place of Presentation
      Tutzing(ドイツ)
    • Year and Date
      2009-09-14
    • Related Report
      2009 Annual Research Report

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Published: 2009-04-01   Modified: 2018-03-28  

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