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核酸高次構造を反応場とするユビキチンプロテアソーム誘導分子の開発

Publicly Offered Research

Project AreaNew frontier for ubiquitin biology driven by chemo-technologies
Project/Area Number 21H00275
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

寺 正行  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (10643512)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords核酸構造 / グアニン四重鎖 / PROTAC / ユビキチン / クリック反応 / ポリオキサゾール / ヌクレオプロテイン
Outline of Research at the Start

核酸高次構造の一つ、グアニン四重鎖(G4)に結合したタンパク質に対して、ユビキチンリガーゼによるポリユビキチン化を誘導するキメラ分子(G4-PROTAC)を創製する。G4はゲノムやRNAのグアニンリッチ配列でしばしば形成され、タンパク質との相互作用を通じて転写や翻訳を制御する。G4は動的に形成される構造であるため、細胞内におけるG4-タンパク質相互作用解析は困難である。一方、ユビキチンリガーゼは標的タンパク質をポリユビキチン化することで、プロテアソーム分解へと誘導する。そこで、G4-PROTACを合成し、G4結合タンパク質がG4と結合した時のみユビキチン化されるシステムを開発する。

Outline of Annual Research Achievements

グアニン豊富な核酸領域で形成されるグアニン四重鎖(G4)はG4結合タンパク質 (G4BP) と相互作用することで複製、転写、翻訳など重要な生命現象に関与すると考えられている1)。しかし、G4BPがG4に結合することで生じる生物学的機能は不明な点が多い。最近、PhanらはE3(ユビキチンリガーゼ)リガンドで修飾したG4形成オリゴヌクレオチドをHela細胞に導入することでG4BPがプロテアソーム分解されることを報告した2)。本手法では外部から加えたG4がG4BPをリクルートするため、細胞内で自然に形成されたG4に結合するG4BPの機能解析が困難である。そこで本研究では、細胞内でのG4-G4BP相互作用解析を指向し、細胞内G4に結合するG4リガンドに、E3リガンドを連結したG4-PROTACリガンドを開発した。
E3ユビキチンリガーゼであるセレブロン (CRBN) のリガンドであるポマリドミドとG4リガンド (L2H2-6OTD) を連結したG4-PROTACリガンド1aを合成した。CRBN結合のネガティブコントロールとなるメチル化ポマリドミドを導入したG4-PROTACリガンド類1bも合成した (Figure 1a)。次に、合成したG4-PROTACリガンド類をHela細胞に添加し、G4BPの一つであるDHX36に着目しそのタンパク質量を定量した。その結果、1aを添加した場合に細胞内のDHX36が顕著に減少することがわかった (Figure 1b)。このことから、細胞内G4に結合したDHX36のG4-PROTACリガンドによる分解が示唆された。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Regulation of thrombin activity by ligand-induced topological alteration in a thrombin-binding aptamer2023

    • Author(s)
      Sasaki Shogo、Ma Yue、Hirokawa Takatsugu、Ikebukuro Kazunori、Tera Masayuki、Nagasawa Kazuo
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 59 Issue: 57 Pages: 8862-8865

    • DOI

      10.1039/d3cc02308g

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ion-Pair-Enhanced Double-Click Driven Cell Adhesion and Altered Expression of Related Genes2023

    • Author(s)
      Kitagawa Kohei、Okuma Nao、Yoshinaga Moeka、Takemae Hitoshi、Sato Fumiya、Sato Shoma、Nakabayashi Seiichiro、Yoshikawa Hiroshi Y.、Suganuma Masami、Luedtke Nathan、Matsuzaki Takahisa、Tera Masayuki
    • Journal Title

      Bioconjugate Chemistry

      Volume: 34 Pages: 638-644

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.2c00569

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  • [Journal Article] Synthesis of C2-Alkoxy-Substituted 19-Nor Vitamin D3 Derivatives: Stereoselectivity and Biological Activity2022

    • Author(s)
      Mizumoto Yuka、Sakamoto Ryota、Nagata Akiko、Sakane Suzuka、Kittaka Atsushi、Odagi Minami、Tera Masayuki、Nagasawa Kazuo
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 69-69

    • DOI

      10.3390/biom12010069

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      野原玲奈、白石慧、北村純也、佐々木捷悟、寺正行
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      柳田和輝、佐々木捷悟、馬悦、池袋一典、広川貴次、寺正行、長澤和夫
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  • [Presentation] 大環状ヘキサオキサゾール型G4リガンド類を用いた液-液相分離誘起能の解析2022

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    • Organizer
      第16回バイオ関連化学シンポジウム
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      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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