• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

ナノボディーによる標的ユビキチンリガーゼ複合体の細胞内動態の理解と応用

Publicly Offered Research

Project AreaNew frontier for ubiquitin biology driven by chemo-technologies
Project/Area Number 21H00288
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionOsaka University (2022)
Kyushu University (2021)

Principal Investigator

池田 史代  大阪大学, 大学院生命機能研究科, 教授 (50837151)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥7,280,000 (Direct Cost: ¥5,600,000、Indirect Cost: ¥1,680,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Keywordsナノボディ / LUBAC / 直鎖型ユビキチン鎖 / 生化学的手法 / タンパク質精製 / ナノボディー / 細胞内動態 / ナノトラップ法
Outline of Research at the Start

タンパク質の翻訳後修飾の一つであるユビキチン化はあらゆる生物学的効果に重要である。複数のユビキチン分子は、8つの型で結合することにより鎖ができる。その中で、直鎖型ユビキチン鎖は、炎症、感染や免疫の制御に重要な役割を果たす。この直鎖型ユビキチン鎖は、ユビキチンリガーゼ複合体LUBAC により誘導されるが、LUBAC構成因子の細胞内動態、組織や細胞種特異的なシグナルネットワークの形成とその生物学的効果については不明な部分が多い。本研究では、申請者のチームが独自に取得した単量体、単一ドメインの小分子であるナノボディーを基盤とした分子ツールの開発とLUBAC の新規制御メカニズムの解明を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、炎症、細胞死、選択的オートファジーや免疫制御に重要な直鎖型ユビキチン鎖を誘導する、ユビキチンリガーゼ複合体LUBACに着眼した。LUBACを構成する分子の細胞内動態、組織や細胞腫特異的なシグナルネットワークの形成とその生物学的効果を解明するのに適した分子ツールの開発することによるLUBAC の新規制御メカニズムの解明を目指して、申請者のチームが取得した単量体、単一ドメインの小分子であるナノボディーを利用した。期間中に、各LUBAC 構成因子を抗原とするラマ由来ナノボディークローンの精製法、ナノボディークローンのユビキチン化に対する影響の解析法、および細胞内における発現誘導法、ナノボディークローンによる免疫沈降法の各手法について確立した。ナノボディーのクローンは、anti-HOIP, anti-SHARPIN, anti-HOIL-1の全てにおいて、e.coliから効率的にリコンビナントタンパク質を得ることができた。特にanti-HOIL-1ナノボディークローンについては、in vitro ユビキチン化再構築系の実験により、LUBAC依存性のユビキチン化誘導を促進、もしくは抑制するクローンを得た。さらに、各クローンが免疫ブロッティング、免疫沈降において機能するかについても解析を行った。これらの解析結果を基に3クローンを選択し、抗原タンパク質との結合能、エピトープの解析を行った。さらに、細胞内においてGFP-tagナノボディーを発現し、細胞死に対する影響も解析した。本研究成果を基盤として、今後もanti-HOIP, anti-SHARPINの残りのクローン解析、細胞内動態と新規結合分子の解析について解析を進めていく。これらの研究成果および関連する概念について、当該年度中に国内および国際学会、国際雑誌に総説(査読あり)として発表している。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 9 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] IMBA/IMP(オーストリア)

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] University of Oxford(英国)

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] The university of British Columbia(カナダ)

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] Protein and non-protein targets of ubiquitin modification2023

    • Author(s)
      Ikeda Fumiyo
    • Journal Title

      American Journal of Physiology-Cell Physiology

      Volume: - Issue: 5 Pages: C1053-C1060

    • DOI

      10.1152/ajpcell.00069.2023

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Linear ubiquitination in immune and neurodegenerative diseases, and beyond2022

    • Author(s)
      Tokunaga Fuminori、Ikeda Fumiyo
    • Journal Title

      Biochemical Society Transactions

      Volume: 50 Issue: 2 Pages: 799-811

    • DOI

      10.1042/bst20211078

    • Related Report
      2022 Annual Research Report 2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The ubiquitin ligase HOIL-1L regulates immune responses by interacting with linear ubiquitin chains2021

    • Author(s)
      Gomez-Diaz Carlos、Jonsson Gustav、Schodl Katrin、Deszcz Luiza、Bestehorn Annika、Eislmayr Kevin、Almagro Jorge、Kavirayani Anoop、Seida Mayu、Fennell Lilian M.、Hagelkruys Astrid、Kovarik Pavel、Penninger Josef M.、Ikeda Fumiyo
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 24 Issue: 11 Pages: 103241-103241

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.103241

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The linear ubiquitin chain assembly complex (LUBAC) generates heterotypic ubiquitin chains2021

    • Author(s)
      Rodriguez Carvajal Alan、Grishkovskaya Irina、Gomez Diaz Carlos、Vogel Antonia、Sonn-Segev Adar、Kushwah Manish S、Schodl Katrin、Deszcz Luiza、Orban-Nemeth Zsuzsanna、Sakamoto Shinji、Mechtler Karl、Kukura Philipp、Clausen Tim、Haselbach David、Ikeda Fumiyo
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 10

    • DOI

      10.7554/elife.60660

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 炎症性シグナルにおけるユビキチンの役割2022

    • Author(s)
      池田 史代
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] The linear ubiquitin chain assembly complex (LUBAC) generates heterotypic ubiquitin chains2022

    • Author(s)
      Fumiyo Ikeda
    • Organizer
      The international symposium Ubiquitin New Frontier
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ユビキチンシステムによる細胞死と炎症反応性シグナルの制御2022

    • Author(s)
      池田 史代
    • Organizer
      第16回日本臨床ストレス応答学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ユビキチンによる炎症反応シグナルの制御2022

    • Author(s)
      池田史代
    • Organizer
      令和3年度 全国共同研究拠点シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 新規ユビキチンコードとその生理学的役割2021

    • Author(s)
      池田史代
    • Organizer
      第29回日本Cell Death学会学術集会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Linear ubiquitin chains and its variants generated by Linear Ubiquitin chain Assembly Complex (LUBAC) in the inflammatory responses.2021

    • Author(s)
      池田史代
    • Organizer
      9th PROTEASOME and AUTOPHAGY CONGRESS
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 新規ユビキチンコードを誘導するユビキチンリガーゼによる炎症制御機構2021

    • Author(s)
      池田史代
    • Organizer
      第33回日本神経免疫学会学術集会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] RBR型ユビキチンリガーゼHOIL-1Lによる炎症反応制御2021

    • Author(s)
      池田史代
    • Organizer
      第94回日本生化学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] RBR型ユビキチンリガーゼHOIL-1Lによるユビキチンエステル化と炎症反応制御2021

    • Author(s)
      池田 史代
    • Organizer
      第44回 日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Linear ubiquitin chains and its variants generated by Linear Ubiquitin chain Assembly Complex (LUBAC)2021

    • Author(s)
      池田史代
    • Organizer
      Pacifichem 2021
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] Ikeda Lab_Publications

    • URL

      https://ikedalab.bioreg.kyushu-u.ac.jp/publications/

    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi