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疑似細胞環境下における発動分子のゆらぎに誘導される運動特性の解析

Publicly Offered Research

Project AreaMolecular Engine: Design of Autonomous Functions through Energy Conversion
Project/Area Number 21H00405
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionYamaguchi University

Principal Investigator

有賀 隆行  山口大学, 大学院医学系研究科, 准教授(特命) (30452262)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywords生体分子モーター / エネルギー変換 / 1分子計測・操作 / 非平衡物理学 / 生物物理
Outline of Research at the Start

前回の公募研究において我々は、in vitro で運動中の1分子のキネシンに細胞内でみられる非熱的なゆらぎを人工的に外力として与えることで、キネシンは外力のゆらぎに誘導されて加速することを見出した。そこで本研究では、これまでの実験と数理モデルで予想された、細胞内のアクティブなゆらぎに誘導される運動特性を、より細胞内に近い疑似細胞環境下で確かめることを目的とする。普遍性のある理論予測により、様々な発動分子が非熱的なゆらぎを積極的に利用することでより効率の良い機能を発現していると期待され、また人工モーターの設計への応用等を通じて、当該領域の発展に寄与できる。

Outline of Annual Research Achievements

細胞内で小胞などを輸送する並進型発動分子であるkinesin 1(以下キネシン)は、ATPの加水分解をエネルギー源として、微小管の上を 歩きながら力学的な仕事を行っている。我々は以前の研究において、そのエネルギー入出力をin vitroで定量したところ、入力された多くの化学的エネルギーが見えない形で散逸しており、あたかも効率の悪いモーターのように見えた。そこで私は、実際に彼らが働く環境である生きた細胞の中に最適化されているのだろうと仮説を立て、細胞内と同等の環境をin vitroで人工的に構築し、その中でキネシンの運動を観察することで、その仮説を実証する研究を続けてきた。
昨年度までに、細胞内で見られる非熱的なゆらぎを人工的に生成し、光ピンセットを用いて外力のゆらぎとしてキネシンに与えながらその運動の解析を行った結果、キネシンは特に高い負荷において外力のゆらぎに誘導されて加速することを見出した。これにより細胞内のように混雑して粘性の高い環境下においても in vitroでの無負荷時と同程度の速さが実現できることが示唆された。
本年度は、これまで非熱的なゆらぎのみを再現したin vitroの計測環境をさらに実際に生きた細胞の内部に近づけるべく、混雑した環境の構築を行った。粒径や粘度のコントロールが容易な混雑物質としてポリエチレングリコールを選択し、細胞内のように混雑した環境をin vitroで構築したうえで、光ピンセットを用いたキネシンの1分子力学操作を行った。その結果、1分子のキネシンが通常のin vitro環境とは異なる外力速度関係を示すことを見出した。
また、これらの成果を解説する日本語総説と雑誌記事をそれぞれ発表し、2件の国内招待講演と1件の国際会議での招待講演を行った。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Nonthermal Fluctuation Accelerates Molecular Motor Kinesin2023

    • Author(s)
      有賀隆行 , 立石圭人 , 富重道雄 , 水野大介
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 63 Issue: 2 Pages: 86-90

    • DOI

      10.2142/biophys.63.86

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 非熱的なゆらぎで加速する分子モーター2023

    • Author(s)
      有賀隆行
    • Journal Title

      月刊「細胞」

      Volume: 55

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] Noise-Induced Acceleration of Single Molecule Kinesin-12021

    • Author(s)
      Ariga Takayuki、Tateishi Keito、Tomishige Michio、Mizuno Daisuke
    • Journal Title

      Physical Review Letters

      Volume: 127 Issue: 17 Pages: 178101-178101

    • DOI

      10.1103/physrevlett.127.178101

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Feedback Microrheology in Soft Matter2021

    • Author(s)
      Kenji Nishizawa, Natsuki Honda, Masahiro Ikenaga, Shono Inokuchi, Yujiro Sugino, Takayuki Ariga, Daisuke Mizuno
    • Journal Title

      arXiv preprint

      Volume: -

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Presentation] 非熱的にゆらぐ細胞内環境に最適化する生体分子モーター2023

    • Author(s)
      有賀隆行
    • Organizer
      Workshop OT 2023 最適輸送とその周辺
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 生体分子モーターキネシンのエネルギー論とゆらぎによる加速現象2023

    • Author(s)
      有賀 隆行
    • Organizer
      第10回ソフトマター研究会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Single-molecule energetics and nonthermal manipulation of molecular motor kinesin2022

    • Author(s)
      Takayuki Ariga
    • Organizer
      2022 East Asian Single-Molecule Biophysics Symposium (EASMB 2022)
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 分子モーターキネシン1のゆらぎ誘導加速現象2021

    • Author(s)
      有賀隆行, 立石圭人, 富重道雄, 水野大介
    • Organizer
      第59回 日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工的な疑似細胞内アクティブ環境 におけるキネシンの運動2021

    • Author(s)
      立石圭人, 有賀隆行
    • Organizer
      日本物理学会2021年秋季大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Motion of molecular motors reflecting rheological properties in cells2021

    • Author(s)
      Takayuki Ariga
    • Organizer
      The 2nd Joint Meeting of The European Society for Clinical Hemorheology and Microcirculation, The International Society for Clinical Hemorheology, and The International Society of Biorheology
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 山口大学大学院医学系研究科 微生物学講座|有賀隆行

    • URL

      http://mb.med.yamaguchi-u.ac.jp/ariga/index.html

    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2023-12-25  

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