Development of food identification method by coprolite genome analysis

Publicly Offered Research

Project Area	A New Archaeology Initiative to Elucidate the Formation Process of Chinese Civilization
Project/Area Number	21H05362
Research Category	Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Transformative Research Areas, Section (I)
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	太田博樹東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (40401228)
Project Period (FY)	2021-09-10 – 2023-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help	¥10,400,000 (Direct Cost: ¥8,000,000、Indirect Cost: ¥2,400,000) Fiscal Year 2022: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000) Fiscal Year 2021: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Keywords	糞石 / ゲノム解析 / 摂食物 / 古代DNA / キャプチャー法 / ゲノム / 古代ゲノム / NGS / 食性
Outline of Research at the Start	糞便には、その糞便をした生物（ホスト）由来のDNAの他に、腸内細菌由来DNAおよび摂食物由来DNAなどが含まれている。糞便に含まれるDNAを次世代シークエンサー（next generation sequencer：NGS）を用いて網羅的ゲノム解析することにより得られる情報は、その糞便をした生物を取り巻く環境や生態系をも反映している。糞石は、過去の生物の糞便が形状を維持して残存しているものである。糞石ゲノム解析を行うことができれば、過去の環境や生態系の情報をも獲得できる。本研究は、私達の研究グループがもつ古代ゲノム解析技術を応用し、糞石ゲノム解析による摂食物同定法の確立を目指す。