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Regulatory mechanism of aquatic photosynthesis under fluctuating CO2 environment

Publicly Offered Research

Project AreaMulti-layered regulatory system of plant resilience under fluctuating environment
Project/Area Number 21H05660
Research Category

Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Transformative Research Areas, Section (III)
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

山野 隆志  京都大学, 生命科学研究科, 准教授 (70570167)

Project Period (FY) 2021-09-10 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
KeywordsCO2濃縮機構 / ピレノイド / 無機炭素輸送体 / CO2不均一環境 / 光合成 / クラミドモナス / 炭酸脱水酵素 / CO2不均一性 / 葉緑体 / タンパク質局在変化
Outline of Research at the Start

水圏に生息する多くの藻類は、変動するCO2不均一環境においても光合成を維持するための多段階の生存戦略を持つが、その制御機構の分子メカニズムは全く分かっていない。本研究は、モデル緑藻クラミドモナスを用いた順遺伝学的アプローチにより、CO2不均一環境における植物のレジリエンスの一端を明らかにする。水圏における光合成順化機構と、当該研究領域において中心となる陸上植物が持つ光合成順化機構との比較から、不均一環境における光合成維持のためのCO2獲得の制御機構の多様性と共通性について明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、モデル緑藻クラミドモナスを用いた順遺伝学的アプローチにより、変動するCO2不均一環境において光合成を柔軟かつ頑健に維持するための多段階の生存戦略を分子レベルで明らかにすることを目的としている。この研究を通して、CO2不均一環境における植物のレジリエンスの一端を解明するとともに、水圏における光合成順化機構と陸上植物が持つ光合成順化機構との比較から、不均一環境における光合成維持のためのCO2獲得の制御機構の多様性と共通性について明らかにすることを目指した。
本年度は、CO2濃度変化に応答して無機炭素輸送機構が切り替わる仕組みを分子レベルで解明することに焦点を当て、特に変動するCO2環境における光合成に不可欠なCO2濃縮機構を抑制する因子の同定を目指した。その結果、以下のことが明らかになった。まず、これまでCO2濃縮機構のマスター制御因子として同定されていたタンパク質の相互作用因子が抑制因子として働くことが示された。さらに、その相同性タンパク質もまた抑制因子として機能することが明らかになった。加えて、CO2濃縮機構の駆動に伴うATPのエネルギーロスを回避するために、抑制因子が必要であることが示唆された。さらに、CO2不均一環境におけるタンパク質の局在変化によって、柔軟かつ頑健に光合成を維持するメカニズムの一端が明らかになった。
これらの成果は、変動するCO2環境下における植物の光合成制御機構の理解に重要な知見を提供するものであり、将来的には植物の環境適応戦略の解明につながることが期待される。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (28 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 6 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Periplasmic carbonic anhydrase CAH1 contributes to high inorganic carbon affinity in<i>Chlamydomonas reinhardtii</i>2024

    • Author(s)
      Shimamura Daisuke、Ikeuchi Tomoaki、Tsuji Yoshinori、Fukuzawa Hideya、Yamano Takashi
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2024.03.04.583368

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] A pyrenoid-localized protein SAGA1 is necessary for Ca2+-binding protein CAS-dependent expression of nuclear genes encoding inorganic carbon transporters in Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      Shimamura Daisuke、Yamano Takashi、Niikawa Yuki、Hu Donghui、Fukuzawa Hideya
    • Journal Title

      Photosynthesis Research

      Volume: - Issue: 2 Pages: 181-192

    • DOI

      10.1007/s11120-022-00996-7

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pyrenoids: Cutting Edge of Phase-separated Organelles in Plants2023

    • Author(s)
      Yamano Takashi、Hirakawa Yoshihisa、Matsuzaki Ryo
    • Journal Title

      PLANT MORPHOLOGY

      Volume: 35 Issue: 1 Pages: 1-2

    • DOI

      10.5685/plmorphol.35.1

    • ISSN
      0918-9726, 1884-4154
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Understanding of green algal pyrenoid as a phase-separating and CO<sub>2</sub>-concentrating organelle2023

    • Author(s)
      Yamano Takashi
    • Journal Title

      PLANT MORPHOLOGY

      Volume: 35 Issue: 1 Pages: 3-8

    • DOI

      10.5685/plmorphol.35.3

    • ISSN
      0918-9726, 1884-4154
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms2023

    • Author(s)
      Yoshizawa Susumu、Azuma Tomonori、Kojima Keiichi、Inomura Keisuke、Hasegawa Masumi、Nishimura Yosuke、Kikuchi Masuzu、Armin Gabrielle、Tsukamoto Yuya、Miyashita Hideaki、Ifuku Kentaro、Yamano Takashi、Marchetti Adrian、Fukuzawa Hideya、Sudo Yuki、Kamikawa Ryoma
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: 38 Issue: 2 Pages: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME23015

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Hyperosmotic stress-induced microtubule disassembly in Chlamydomonas reinhardtii2022

    • Author(s)
      Ng Lee Mei、Komaki Shinichiro、Takahashi Hideyuki、Yamano Takashi、Fukuzawa Hideya、Hashimoto Takashi
    • Journal Title

      BMC Plant Biology

      Volume: 22 Issue: 1 Pages: 46-46

    • DOI

      10.1186/s12870-022-03439-6

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] CO2-dependent migration and relocation of LCIB, a pyrenoid-peripheral protein in <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>2021

    • Author(s)
      Yamano Takashi、Toyokawa Chihana、Shimamura Daisuke、Matsuoka Toshiki、Fukuzawa Hideya
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 188 Issue: 2 Pages: 1081-1094

    • DOI

      10.1093/plphys/kiab528

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The <i>Chlamydomonas</i> bZIP transcription factor BLZ8 confers oxidative stress tolerance by inducing the carbon-concentrating mechanism2021

    • Author(s)
      Choi Bae Young、Kim Hanul、Shim Donghwan、Jang Sunghoon、Yamaoka Yasuyo、Shin Seungjun、Yamano Takashi、Kajikawa Masataka、Jin EonSeon、Fukuzawa Hideya、Lee Youngsook
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 34 Issue: 2 Pages: 910-926

    • DOI

      10.1093/plcell/koab293

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functional analysis of LCI15, which suppresses the CO2-concentrating mechanism in the green algae Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      Shizuka Miichi, Daisuke Shimamura, Junko Yasuda, Takashi Yamano, Hideya Fukuzawa
    • Organizer
      19th International Student Seminar
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Isolation and Characterization of Liquid-Liquid Phase Separated Pyrenoid Mutants with the Aberrant Morphology in the Green Alga Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      Yumeka Masuda, Tatsuhiro Kotoge, Hideya Fukuzawa, Takashi Yamano
    • Organizer
      19th International Student Seminar
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] クラミドモナスのCO2濃縮機構を抑制するCobW-WWドメインタンパク質の局在と機能2023

    • Author(s)
      見市 静香、嶋村 大亮、安田 詢子、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会 ジオラマ行動力学 共催
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] クラミドモナスにおけるピレノイド形成異常変異株の単離と解析2023

    • Author(s)
      増田 夢佳、小峠 達大、福澤 秀哉、山野 隆志
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会 ジオラマ行動力学 共催
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑藻のMYB型転写因子LCR1が制御する炭酸脱水酵素とCO2チャネルによるCO2濃縮機構の駆動2023

    • Author(s)
      池内 友彰、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会 ジオラマ行動力学 共催
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ピレノイドに局在するSAGA1タンパク質はCa2+結合性タンパク質CASによる無機炭素輸送体の遺伝子発現に必要である2023

    • Author(s)
      嶋村 大亮、新川友貴、HU Donghui、山野隆志、福澤秀哉
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会 ジオラマ行動力学 共催
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスのピレノイドに局在するタンパク質SAGA1はCa2+結合性タンパク質CASによる無機炭素輸送体の遺伝子発現に必要である2023

    • Author(s)
      嶋村 大亮、新川 友貴、Donghui Hu、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] CO2-dependent migration and relocation of LCIB, a pyrenoid-peripheral protein in Chlamydomonas reinhardtii2022

    • Author(s)
      Takashi Yamano
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Inorganic Carbon Utilization by Aquatic Photosynthetic Organisms
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Abnormal pyrenoid morphology due to the SAGA1 mutation affects CAS-dependent gene expression and CAS localization in Chlamydomonas reinhardtii2022

    • Author(s)
      Daisuke Shimamura, Takashi Yamano, Yuuki Niikawa, Hu Donghui, Hideya Fukuzawa
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Inorganic Carbon Utilization by Aquatic Photosynthetic Organisms
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 緑藻ピレノイドの相分離現象とCO2濃縮2022

    • Author(s)
      山野 隆志
    • Organizer
      日本植物学会 第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CO2濃縮機構を制御する緑藻クラミドモナスのWWドメイン含有タンパク質2022

    • Author(s)
      嶋村 大亮、安田 詢子、大垣 美萌、山原 洋佑、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      日本植物学会 第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 液-液相分離する緑藻ピレノイドの1細胞高解像度観察2022

    • Author(s)
      山野 隆志、小峠 達大、 福澤 秀哉
    • Organizer
      ユーグレナ研究会第37回研究集会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] CO2濃縮機構を制御する緑藻クラミドモナスのWWドメイン含有タンパク質2022

    • Author(s)
      嶋村 大亮、安田 詢子、大垣 美萌、山原 洋佑、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第18回京大植物縦横無尽の会ワークショップ
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスのCO2濃縮機構を制御するCCM1/CBP1複合体の機能2022

    • Author(s)
      安田 詢子、嶋村 大亮、大垣 美萌、山原 洋佑、中野 博文、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスが持つピレノイドの形態変化はCO2濃縮機構に関わる遺伝子の発現に影響を与える2022

    • Author(s)
      嶋村 大亮、新川 友貴、胡 東輝、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 液-液相分離する緑藻ピレノイドのCO2濃度変化における動態解析2022

    • Author(s)
      小峠 達大、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスのCO2濃縮機構を制御するCCM1の新規機能ドメインとモチーフの探索2022

    • Author(s)
      大垣 美萌、嶋村大亮、山野隆志、福澤秀哉
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Pyrenoid-localized protein SAGA1 is required for the expression of some CCM-related genes2021

    • Author(s)
      Daisuke Shimamura, Yuki Niikawa, Donghui HU, Takashi Yamano, Hideya Fukuzawa
    • Organizer
      19th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] FRAP法を用いた液-液相分離する緑藻ピレノイドの動態解析2021

    • Author(s)
      小峠 達大、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第17回京大植物縦横無尽の会ワークショップ
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスのCO2濃縮機構を制御するCCM1/CBP1複合体の機能解析2021

    • Author(s)
      安田 詢子、嶋村 大亮、山原 洋佑、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第17回京大植物縦横無尽の会ワークショップ
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-10-22   Modified: 2024-12-25  

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