Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
SMCタンパク質ファミリーはバクテリアからヒトまで広く保存されており、ゲノムの構造化において重要な役割を果たしている。興味深いことに、真核生物の起源となった原核生物ドメイン「アーキア」には、既知のSMCタンパク質をもたない代わりに機能未知のSMC様タンパク質を有する種が存在する。本研究は、この機能未知SMC様タンパク質の機能を解明することで、SMCファミリーによるゲノムモダリティ制御の多様性と共通原理の解明を目指す。
SMC(Structural Maintenance of Chromosomes)はゲノムモダリティ制御の中枢を担うDNA結合性ATPaseファミリーであり、バクテリアから真核生物まで広く保存されている。しかし、真核生物の起源となった原核生物ドメインであるアーキアでは、既知のSMCタンパク質をもたない種が少なからず存在する。また、このようなアーキアの一群であるテルモプロテウス目アーキアは、Arcadin-4と呼ばれる機能未知のSMC様タンパク質を有する。本研究は、Arcadin-4の機能解明を通じて SMCファミリーによるゲノムモダリティ制御の多様性を明らかにするとともに、多様性の裏返しとして存在する共通原理の解明を目指す。具体的には、テルモプロテウス目に属するアーキアPyrobaculum calidifontisがもつArcadin-4の機能を生化学やNGS技術を駆使して明らかにする。今年度の研究内容は以下の通りである。Arcadin-4の生化学的性質を解析するため、組換え型Arcadin-4タンパク質の発現・精製を行った。得られた組換えタンパク質をHS-AFMで観察したところ（国立遺伝学研究所との共同研究）、SMC タンパク質に特徴的なリング状のダイマー構造がみられた。一方、Arcadin-4では2つのダイマーが八の字型に会合したユニークな複合体構造も観察された。続いて、組換えArcadin-4タンパク質をDNAと混合した条件でHS-AFM解析を行ったところ、Arcadin-4が一本鎖DNAに特異的に結合することを示唆する結果が得られた。これらの結果は、Arcadin-4が他のSMCタンパク質とは異なったユニークな分子機能を有する可能性を示唆している。
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
All 2023 2022
All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results, Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results, Invited: 5 results)
Nucleic Acids Research
Volume: 50 Issue: 7 Pages: 3727-3744
10.1093/nar/gkac175
