Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
本研究では，学習によって次第に機能を獲得する「知能システム」を，DNAなどの生体分子の化学反応を利用して設計するための工学的な設計原理や方法論を探究する．特に，環境からの報酬フィードバックを手掛かりに適応的に振る舞いを変化させる生体分子システムが満たすべき複数の特徴に着目し，それらの性質を発現するための反応系の条件をシステム制御理論の観点から解析するための数理的な方法論の構築を行う．また，研究によって明らかになった反応条件を満たす概念実証用の小規模な生体分子反応系を構築し，実験を通して理論の検証を行う．
本年度は，(1)膜などで囲まれた単一の閉じた反応系で再帰性と可塑性を発現させるためのローカルな視点での解析と実験，および(2)反応系の間で分子拡散による情報交換（分子通信）を行う場合のネットワークの視点で反応系のダイナミクスの解析を実施した．(1)については，具体的なDNA反応系を検討し，可塑性を実現するためのDNA回路の一部を切り出して実験データに基づく数理モデルの同定，および同定モデルに基づくパラメタ（塩基配列）の調整を実施した．具体的には，ヘアピン型DNAの温度依存的な開裂反応を組み込んだDNA反応系に対して，反応完了後に溶液温度を制御することで，外部との熱交換のみでDNA反応系の応答強度が更新される学習反応系を考案した．応答強度の更新則が重要であるため，ヘアピン型DNAの温度に対する応答特性（溶融曲線）に着目した数理モデルを構築し，実験データに基づいてモデルのパラメタ同定を行い，塩基配列の調整を実施した．しかし，モデルの予測精度が低く塩基配列の調整が難しいため，今後は緩衝液の条件などを詳細に加味して精度を向上させた上で，所望の挙動の実現を目指す．(2)については，まず，昨年度までに得られた分子通信ネットワーク系のモデル表現をさらに一般化したシステム論的なモデル表現を提案した．具体的には， 2つの反応系間の通信伝送路は膜通過と分子拡散を接続した2端子対回路としてモデル化でき，通信分子の膜通過メカニズムに応じて回路の終端条件や伝達関数を系統的に決定できることを明らかにした．さらに，このモデルに対して，実験系の文献から得たパラメタを代入し，反応系の安定性解析や周波数応答解析を行うことで，膜通過メカニズムの違いによる情報伝達や制御のしやすさや難しさを理論解析的に明らかにした．主に(2)の研究成果を取りまとめ，国内外での学会発表，および論文投稿を行った．
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
All 2023 2022 2021
All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results, Invited: 2 results)
Proceedings of the 22nd IFAC World Congress
Volume: -
Proceedings of European Control Conference
