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試験管内アッセイ系による小胞体膜タンパク質の逆行輸送メカニズムの解明

Publicly Offered Research

Project AreaProtein community: organization and maintenance of protein functions
Project/Area Number 22020017
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

中務 邦雄  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (90547522)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥6,400,000 (Direct Cost: ¥6,400,000)
Fiscal Year 2011: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2010: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Keywords小胞体 / タンパク質分解 / 膜タンパク質
Research Abstract

小胞体の構造異常タンパク質はERADと呼ばれる分解系によって除去される。しかし、小胞体内の基質がどのように膜を越えて、サイトゾルのユビキチン・プロテアソーム系に輸送されるのか、全く明らかにされていない。我々はこのレトロトランスロケーションと呼ばれる現象について、in vitroおよびin vivoの両面から解析を進めてきた。本研究の前に、in vitro解析系によって、疎水性アミノ酸に富む膜貫通タンパク質でさえも、サイトゾルへ逆行輸送されるという有力な証拠を得ていた。本研究期間中このモデルを検証すべく、(1)新しいin vitro解析系の構築、および(2)徹底したショ糖密度勾配遠心による逆行輸送中間体の生化学的解析、を行った。
(1)では最初に、in vitroで合成した膜貫通型基質をミクロソーム画分に取り込ませた。その後、ユビキチン化反応に必要な因子を添加し、逆行輸送を観察した。しかしながら、取り込み反応はある程度進んだものの、ユビキチン化と逆行輸送を有意に検出することは困難であった。本研究を進めている途中、海外のグループから、基質のアセチル化がユビキチンリガーゼによる認識に必要であるという驚くべき報告がなされた。我々のin vitro解析系で扱っていたユビキチンリガーゼは、まさに基質のアセチル化を認識に必要とするものであった。ユビキチン化を有意に検出するには、アセチル化とその認識のステップを系に組み込む必要があるものと考えられた。平成24年度は、アセチル化酵素などユビキチンリガーゼによる基質の認識に必要なコンポーネントの精製方法を検討した。
(2)では逆行輸送を促進するCdc48/p97の変異によって、逆行輸送中間体を蓄積させることに成功した。その結果、プロテアソーム、E3リガーゼ、基質認識因子からなる巨大中間複合体の同定に成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ERADのin vitro再構成は、本分野で残された疑問を解決へ導く、最終課題である。一連の反応を高効率で再構成するのにはブレイクスルーが必要であると思われるが、ユビキチンリガーゼによる認識メカニズムが徐々に明らかにされてきたので、今後反応系をさらに洗練できると期待している。一方で、逆行輸送中間体の解析に成功し、論文として出版することができた。

Strategy for Future Research Activity

生化学反応のin vitro再構成では、活性の高い精製タンパク質を得ることが重要である。本研究では困難を極めたため細胞レベルの研究にシフトした。しかしERADのin vitro再構成は世界的にも誰も達成できていない。素反応の解明には必要不可欠な技術である。因子の同定と精製というアプローチを今後も続ける必要があるものと考えられる。

Report

(2 results)
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2013 2012 2011 2010

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] A stalled retrotranslocation complex reveals physical linkage between substrate recognition and proteasomal degradation during ER associated degradation2013

    • Author(s)
      Kunio Nakatsukasa. Jeffrey L. Brodsky, Takumi Kamura
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: (印刷中) Issue: 11 Pages: 1765-1775

    • DOI

      10.1091/mbc.e12-12-0907

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of cellular functions by Elongin BC based E3 ubiquitin ligase2013

    • Author(s)
      Okumura F, Okumura A, Nakatsukasa K, Kamura T.
    • Journal Title

      Seikagaku

      Volume: 85 Pages: 76-88

    • NAID

      10031156446

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Journal Article] The Role of Elongin BC-Containing Ubiquitin Ligases.2012

    • Author(s)
      Fumihiko Okumura, Mariko Matsuzaki, Kunio Nakatsukasa, Takumi Kamura
    • Journal Title

      Regulation of cellular functions by Elongin BC based E3 ubiquitin ligase

      Volume: 2 Pages: 1-13

    • DOI

      10.3389/fonc.2012.00010

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Non-SCF type F-box protein Roy1/Ymr258c interacts with a Rab5-like GTPase Ypt52 and inhibits Ypt52 function.2011

    • Author(s)
      Liu Y, Nakatsukasa K, Kotera M, Kanada A, Nishimura T, Kishi T, Mimura S, Kamura T
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: (印刷中 未定)

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] The dynamic and controlled assembly of the Hrdl ubiquitin ligase complex is essential to maintain ER homeostasis2012

    • Author(s)
      Kunio Nakatsukasa, Jeffrey L. Brodsky, Takumi Kamura
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県)
    • Year and Date
      2012-12-14
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulatory mechanisms for the membrane extraction of ERAD substrates at a post-ubiquitination step2010

    • Author(s)
      中務邦雄・嘉村巧
    • Organizer
      特定領域研究・タンパク質社会国際班会議
    • Place of Presentation
      奈良
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulatory mechanisms for the membrane extraction of ERAD substrates at a post-ubiquitination step2010

    • Author(s)
      中務邦雄・嘉村巧
    • Organizer
      特定領域研究・タンパク質分解班会議
    • Place of Presentation
      札幌
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulatory mechanisms for the membrane extraction of ERAD substrates at a post-ubiquitination step2010

    • Author(s)
      中務邦雄・嘉村巧
    • Organizer
      BMB2010
    • Place of Presentation
      札幌
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

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Published: 2010-08-23   Modified: 2018-03-28  

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