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基本転写因子TFIIDの機能発現における天然変性領域の役割

Publicly Offered Research

Project AreaTarget recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein
Project/Area Number 22113517
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

古久保 哲朗  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (10271587)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2011: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2010: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Keywords転写調節 / 転写因子 / 基本転写因子 / 転写開始 / 出芽酵母 / TFIID / TAF / TBP
Research Abstract

近年、単独では構造を持たない天然変性蛋白質(IDP)が、遺伝子発現制御を始め、様々な生命現象に深く関与することが明らかになりつつある。またIDPを特徴付ける天然変性領域(IDR)は、「連結した結合と折り畳み」と呼ばれる新規の結合様式により、複数の標的分子と特異的に相互作用する。この結合様式では、同一の標的分子に結合するIDR間の置換が極めて迅速に起こることから、構造変化を介するシグナル伝達には特に有効であると考えられる。TFIIDは多種類の転写活性化ドメイン(AD)によって活性化されるが、その結合部位は様々であり、AD標的部位も複数存在すると考えられる。またTFIIDと重複した機能を有するメディエーター複合体の場合には、テールドメイン(AD標的部位)やミドルドメイン(構造変化の中心)が特に多数のIDRを含むことから、THIDに存在するIDRについても新規AD標的部位や構造変化に必須の相互作用部位を構成する可能性が高い。本研究では、TFIIDの機能発現におけるIDRの重要性を確認するとともに、それらの分子機能の詳細を明らかにすることを目的とした。平成23年度は、8種類のTHIDサブユニット(Taf3,Taf4,Taf6,Taf7,Taf8,Taf9,Taf10,Taf12)に内包される26箇所のIDRについて解析を進め、酵母の生育に必須の役割を果たすIDRを複数同定することに成功した。興味深いことに、同定した7箇所(2/Taf4,1/Taf6,1/Taf7,1/Taf8,2/Taf12)のIDR領域は、(1)DNAとの相互作用(DNAスライディング)、(2)他のタンパク質(Taf or 転写調節因子)との相互作用、(3)複数の機能ドメインを連結するリンカー、という三種類の機能に大別できることが示された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

生育に必須のIDRを複数同定するとともに、全てのTFIID-IDRを三種類の異なる機能を有するものに大別することができたため。

Strategy for Future Research Activity

転写開始及びその制御における各TFIID-IDRの機能を分子レベルで明らかにする。

Report

(2 results)
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2012 2011 2010

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Hmol directs pre-initiation complex assembly to an appropriate site on its target gene promoters by masking a nucleosome-free region2011

    • Author(s)
      Kasahara K, Ohyama Y, Kokubo T
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 39(10) Issue: 10 Pages: 4136-4150

    • DOI

      10.1093/nar/gkq1334

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rapid cell division contributes to efficient induction of A/T mutations during Ig gene hypermutation2011

    • Author(s)
      Kano C, Ouchida R, Kokubo T, Wane JY
    • Journal Title

      Molecular Immunology

      Volume: 48(15-16) Issue: 15-16 Pages: 1993-1999

    • DOI

      10.1016/j.molimm.2011.06.218

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cell polarity in Saccharomyces cerevisiae depends on proper localization of the Bud9 landmark protein by the EKC/KEOPS complex2011

    • Author(s)
      Kato Y, Kawasaki H, Ohyama Y, Morishita T, Iwasaki H, Kokubo T, Hirano H
    • Journal Title

      Genetics

      Volume: 188(4) Issue: 4 Pages: 871-882

    • DOI

      10.1534/genetics.111.128231

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hmol directs pre-initiation complex assembly to an appropriate site on its target gene promoters by masking a nucleosome-free region.2011

    • Author(s)
      Kasahara K, Ohyama Y, Kokubo T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: (印刷中)

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Highly redundant function of multiple AT-rich sequences as core promoter elements in the TATA-less RPS5 promoter of Saccharomyces cerevisiae.2011

    • Author(s)
      Sugihara F, Kasahara K, Kokubo T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: vol.39 Pages: 59-75

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Saccharomyces cerevisiae Ssd1p promotes CLN2 expression by binding to the 5'-untranslated region of CLN2 mRNA.2010

    • Author(s)
      Ohyama Y, Kasahara K, Kokubo T.
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: vol.15 Pages: 1169-1188

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 出芽酵母のTFIIDとSAGAは細胞の極成長に関わるRAMシグナル経路と遺伝学的に相互作用する2012

    • Author(s)
      大山良文、和田忠士、古久保哲朗
    • Organizer
      新学術領域研究「転写代謝システム」・転写研究会共催「若手ワークショップ@湯河原」
    • Place of Presentation
      湯河原(和光純薬・湯河原研修所)
    • Year and Date
      2012-02-09
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母における新規ハイスループット型プロモーター活性測定法の開発とその応用2012

    • Author(s)
      渡邉清、矢部誠、古久保哲朗
    • Organizer
      新学術領域研究「転写代謝システム」・転写研究会共催「若手ワークショップ@湯河原」
    • Place of Presentation
      湯河原(和光純薬・湯河原研修所)
    • Year and Date
      2012-02-09
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 基本転写因子TFIIDの機能発現における天然変性領域の役割2012

    • Author(s)
      古久保哲朗
    • Organizer
      新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪(千里ライフサイエンスセンター)
    • Year and Date
      2012-01-24
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] TFIID and SAGA regulate the fate of CLN2 mRNA cooperatively with the RAM signaling network2011

    • Author(s)
      大山良文、和田忠士、古久保哲朗
    • Organizer
      日本分子生物学会第34回年会
    • Place of Presentation
      横浜(パシフィコ横浜)
    • Year and Date
      2011-12-15
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Novel regulatory mechanism for transcriptional initiation of ribosomal protein genes in S.cerevisiae2011

    • Author(s)
      笠原浩司、大山良文、古久保哲朗
    • Organizer
      日本分子生物学会第34回年会
    • Place of Presentation
      横浜(パシフィコ横浜)
    • Year and Date
      2011-12-15
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] A novel high-throughput screening system to measure gene expression in Saccharomyces cerevisiae2011

    • Author(s)
      渡邉清、古久保哲朗
    • Organizer
      日本分子生物学会第34回年会
    • Place of Presentation
      横浜(パシフィコ横浜)
    • Year and Date
      2011-12-15
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification of novel core promoter elements within the TATA-less RPS5 promoter in Saccharomyces cerevisiae2010

    • Author(s)
      Sugihara F, Kasahara K, Kokubo T.
    • Organizer
      Keystone Symposia "Dynamics of Eukaryotic Transcription during Development"
    • Place of Presentation
      Big Sky Resort, Montana, USA
    • Year and Date
      2010-04-10
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

URL: 

Published: 2010-08-23   Modified: 2018-03-28  

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