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天然変性タンパク質の折り畳みに伴う水和状態と構造揺らぎの変化

Publicly Offered Research

Project AreaTarget recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein
Project/Area Number 22113521
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionJapan Atomic Energy Agency

Principal Investigator

中川 洋  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究員 (20379598)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2011: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2010: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Keywords生物物理 / 天然変性蛋白質 / 中性子 / シミュレーション / ダイナミクス
Research Abstract

天然変性タンパク質は標的分子との結合に伴い、不規則に揺らぐ構造から高次の立体構造に折り畳まれる。結合折り畳みでは、構造の揺らぎが標的分子の認識に重要な役割を担う。また生理的な溶液条件下では、タンパク質構造の安定性や揺らぎは水和水に著しく影響を受けるほか、標的分子結合に伴い結合部位では脱水和が起こる。変性構造の水和状態や、結合折り畳みにおける水和状態の変化を理解することは、天然変性タンパク質の機能発現を理解するための重要な構造基盤となる。本研究では、結合折り畳み時のタンパク質の構造揺らぎと水和状態の変化を、中性子非弾性散乱によって解明することを目的とした。スタフィロコッカルヌクレアーゼ(SNase)の欠損変異体は、生理的条件下で非天然構造を取り、標的分子との結合により折り畳むなどの特徴を持ち、結合折り畳みに伴う動的構造変化や水和状態の変化など、天然変性タンパク質研究の優れたモデル系である。溶液中の野生型と変異体の中性子非弾性散乱データの解析を行ったところ、変異体の方がより強い準弾性散乱が観測された。準弾性散乱の解析により、蛋白質の折り畳みにより、~40psの構造揺らぎがより狭い空間に制限されるようになることが示された。またポリペプチドが大きく揺らいだ天然変性状態での水和状態や、結合に誘導される折り畳みによる水和状態の変化を調べることは、天然変性タンパク質の動的構造の理解に重要であると考えられる。本年度の研究の結果、変性構造では、その大きな揺らぎのために折り畳み状態で形成されているような水和構造が壊れており、変性構造の水和水は天然構造の水和水より運動性が高いことが分かった。以上の結果より、IDPの折り畳みにより構造の揺らぎは空間的に小さくなり、その変化が水和水の揺らぎとカップルしていることが示唆される。

Report

(2 results)
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (21 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (15 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

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    • Author(s)
      中川洋
    • Journal Title

      波紋

      Volume: 22 Pages: 46-47

    • NAID

      130007516854

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      中川洋
    • Journal Title

      高分子

      Volume: 60 Pages: 195-196

    • NAID

      10027971886

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    • Journal Title

      Journal of Physical Society of Japan

      Volume: 79

    • NAID

      40017245105

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      Budapest, Hungary
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      2011-08-26
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      新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」平成23年度第2回領域会議
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      宮崎
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      2011-06-30
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      2011-03-03
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      仙台
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      2011-02-25
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      東京
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      2011-01-27
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      2011-01-10
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      東京
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      東海
    • Year and Date
      2010-10-29
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      草津
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      2010-09-25
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      日本物理学会2010年秋季大会
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      大阪
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      2010-09-23
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      仙台
    • Year and Date
      2010-09-20
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      中川洋
    • Organizer
      第29回タンパク質・核酸構造理論勉強会
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      つくば
    • Year and Date
      2010-07-09
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  • [Presentation] Dynamics of biomolecule and its hydration water studied by neutron scattering2010

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      中川洋
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      岡山
    • Year and Date
      2010-05-29
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    • Author(s)
      H.Nakagawa (M.Kataoka)
    • Publisher
      Pan Stanford Publishing
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  • [Book] Neutrons in Soft Matter2011

    • Author(s)
      H.Nakagawa (M.Kataoka)
    • Publisher
      John Wiley
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  • [Remarks]

    • URL

      http://www.jaea.go.jp/02/press2010/p10072801/index.html

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Published: 2010-08-23   Modified: 2018-03-28  

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