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piRNAの機能解析に基づくカイコの性決定機構の解明

Publicly Offered Research

Project AreaFunctional machinery for non-coding RNAs
Project/Area Number 22115502
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

勝間 進  東京大学, 大学院・農学生命科学研究所, 准教授 (20378863)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥8,840,000 (Direct Cost: ¥6,800,000、Indirect Cost: ¥2,040,000)
Fiscal Year 2011: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2010: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
KeywordspiRNA / カイコ / トランスポゾン / piRNA生合成系 / 低分子RNA / 生殖細胞 / PIWIタンパク質 / 昆虫培養細胞
Research Abstract

Piwi-interactingRNA(piRNA)は、siRNAやmiRNAに続く第3の低分子非コードRNAであり、その名の通りRNA結合タンパク質Piwiサブファミリーに結合する低分子RNAとして発見された。piRNAは生殖細胞特異的に存在するという点で、他の2種類の低分子RNAと異なっている。piRNAの生理学的研究、および生化学的機能解析に関する直接的な研究例はあまりないが、その主たる原因は、piRNAを発現している培養細胞系がいずれの生物からも見つかっておらず、piRNAの生合成系の解析が困難であった、ことにある。本研究では、カイコを用いて、piRNAと性決定・性分化との関係を解明することを試みた。またPiwi/piRNA複合体を発現するカイコ培養細胞を用いて、piRNAの生合成メカニズムや染色体外因子認識システムに関する研究も行った。最終年度である今年は以下の研究を実施し、成果を発表した。
(1)カイコの胚発生ステージ段階別のpiRNAプロファイルを精査し、母性遺伝するpiRNAの存在、およびセンス鎖のトランズポゾンRNAがpiRNAの前駆体であり、ping-pongサイクルによってpiRNAが増幅することを可視化した。
(2)カイコの性染色体変異系統を用いて、雌性決定染色体であるW染色体から産生される
piRNAを同定した。
(3)W染色体上の変異が原因で雌の一部が雄化する間性系統の解析を行い、piRNAや精巣特異的遺伝子の発現が異常になっていることを発見した。
(4)カイコBmN4細胞を用いたpiRNA生合成系のin vitroアッセイシステムの構築に成功した。
(5)カイコBmN4細胞を用いてpiRNAのde novo合成に関わるローカスを同定した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

カイコの性染色体変異系統を用いて、雌性決定染色体であるW染色体から産生されるpiRNAを同定することができた。また、W染色体上の変異が原因で雌の一部が雄化する間性系統において、piRNAや精巣特異的遺伝子の発現が異常になっていることを見いだした。一方、カイコ培養細胞を用いて、プライマリーpiRNA産生経路を解明するとともに、染色体外因子の認識システムの一部を解明することに成功した。これらの結果のほとんどは論文発表済み、あるいは論文投稿中であり、当初の計画以上に進展したと言える。

Strategy for Future Research Activity

本研究課題の遂行によって、カイコをpiRNA研究のモデルシステムとして整備することができた。今後は、"piRNAの機能解析"へ移行できるようカイコ生体を用いた機能解析システムを構築する必要があると考えている。

Report

(3 results)
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Products Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2019 2012 2011 2010 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (10 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] A role for transcription from a piRNA cluster in de novo piRNA production2012

    • Author(s)
      Kawaoka S
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 18(2) Issue: 2 Pages: 265-273

    • DOI

      10.1261/rna.029777.111

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The silkworm W chromosome is a source of female-enriched piRNAs2011

    • Author(s)
      Kawaoka Shinpei
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 17 Issue: 12 Pages: 2144-2151

    • DOI

      10.1261/rna.027565.111

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 3' end formation of PIWI-interacting RNAs in vitro2011

    • Author(s)
      Kawaoka S, Izumi N, Katsuma S, Tomari Y
    • Journal Title

      Mol Cell

      Volume: 16 Issue: 6 Pages: 1015-1022

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2011.07.029

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Zygotic amplification of secondary piRNAs during the silkworm embryogenesis2011

    • Author(s)
      Shinpei Kawaoka
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 17 Issue: 7 Pages: 1401-1407

    • DOI

      10.1261/rna.2709411

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] De novo piRNA production against a protein-coding transgene in silkworm cultured cells2011

    • Author(s)
      Shinpei Kawaoka
    • Organizer
      RNA2011 (Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society)
    • Place of Presentation
      Kyoto Internatinal Conferenee Center(招待講演)
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 3' end formation of PIWI-interacting RNAs in vitro2011

    • Author(s)
      Shinpei Kawaoka
    • Organizer
      RNA2011 (Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society)
    • Place of Presentation
      Kyoto Internatinal Conferenee Center(招待講演)
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis on chromatin and DNA modifications in the silkworm genome2011

    • Author(s)
      Kahori Hara
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(招待講演)
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] カイコ卵巣とBmN4細胞におけるpiRNAの性状比較2010

    • Author(s)
      新井祐二
    • Organizer
      日本蚕糸学会関東支部第61回大会
    • Place of Presentation
      蚕糸会館
    • Year and Date
      2010-11-18
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] カイコpiRNA関連遺伝子群の機能解析2010

    • Author(s)
      安原聡
    • Organizer
      日本蚕糸学会第80回記念大会
    • Place of Presentation
      信州大学繊維学部
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] カイコW染色体から産生されるpiRNA2010

    • Author(s)
      河岡慎平
    • Organizer
      日本蚕糸学会第80回記念大会
    • Place of Presentation
      信州大学繊維学部
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Silkworm gonadal transcriptome reveals piRNAs derived from the sex determining region of W chromosome and their possible targets2010

    • Author(s)
      Shinpei Kawaoka
    • Organizer
      The 19th CDB Meeting "RNA Sciences in Cell and Developmental Biology"
    • Place of Presentation
      理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] W chromosome derived female-specific piRNAs and their possible contribution to sex determination in the silkworm gonads2010

    • Author(s)
      河岡慎平
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis on chromatin and DNA modifications in the silkworm genome2010

    • Author(s)
      原加保里
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Transposon silencing in the silkworm ovary-derived cell line BmN42010

    • Author(s)
      安原聡
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://papilio.ab.a.u-tokyo.ac.jp/igb/index-J.html

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://papilio.ab.a.u-tokyo.ac.jp/igb/index-J.html

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 雌蚕致死カイコ系統2019

    • Inventor(s)
      勝間進, 他
    • Industrial Property Rights Holder
      東京大学、農研機構
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2014-232218
    • Acquisition Date
      2019
    • Related Report
      Products Report

URL: 

Published: 2010-08-23   Modified: 2020-07-03  

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