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線虫の生殖細胞における新規小分子RNAの作用マシナリーの解析

Publicly Offered Research

Project AreaFunctional machinery for non-coding RNAs
Project/Area Number 22115509
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

田原 浩昭  筑波大学, 医学医療系, 研究員 (90362524)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥8,320,000 (Direct Cost: ¥6,400,000、Indirect Cost: ¥1,920,000)
Fiscal Year 2011: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2010: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Keywords小分子RNA / 生殖細胞 / RNAi / Argonaute蛋白
Research Abstract

遺伝子発現抑制の一形態であるRNA interference(RNAi)は、幾つかの内在性の遺伝子発現制御と反応経路の一部を共有している。それらの発現制御においては、小分子RNAと一緒に複合体を形成するArgonaute蛋白が制御因子として機能していることが一般的である。一部のArgonaute蛋白はRNA切断活性(Slicer)を示し、重要性が特に高い。筆者は線虫C.elegansをモデルとして、Slicer活性を示すArgonaute蛋白をこれまでに2つ同定してきた。Slicer活性を持つArgonaute蛋白の解析を通じて小分子RNAが関与する遺伝子発現制御について新たな知見を得たいと考え、それらの蛋白と相互作用する内在性小分子RNAについて解析を行った。どちらのSlicer蛋白もRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRP)産物であると考えられる内在性のトリ燐酸化siRNA(small interfering RNA)と相互作用していた。
それらのSlicer蛋白と相互作用している内在性siRNAについて大規模な配列測定を本研究の初年度後期に行っており、更にコンピュータ解析を進めることによって得られた配列データに存在する特徴を抽出した。相互作用しているsiRNAの90%の5'末端がグアニンで始まっており、RdRPによってプライマー非依存的に合成されたsiRNAの特徴を反映しているものと考えられた。又、相互作用しているsiRNAの大部分は、mRNA集団に相補的な配列もしくはゲノムの非コード領域の配列に対応していた。後者に含まれるsiRNA集団には、性染色体の特定領域の配列が高頻度に確認され、ゲノム全体に分布する反復配列も中頻度に確認された。2つのSlicer蛋白を欠失した二重変異体を作製して表現型を解析してみたところ、生殖細胞における性染色体の不活化現象の顕著な異常が確認された。

Report

(2 results)
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2011 2010

All Presentation (3 results)

  • [Presentation] Argonaute proteins possessing Slicer activity and their interacting small RNAs in C.elegans2011

    • Author(s)
      田原浩昭、三谷昌平、望月めぐみ
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2011-12-16
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Biochemical genetic analysis of RNA interference in C.elegans2011

    • Author(s)
      Hiroaki Tabara
    • Organizer
      NTU-JST Joint Meeting on RNA & Biofunctions-Asia Studies
    • Place of Presentation
      台北(台湾)
    • Year and Date
      2011-11-11
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 線虫の内在性遺伝子制御におけるSlicer活性を持つArgonaute蛋白の役割2010

    • Author(s)
      田原浩昭、三谷昌平、望月めぐみ
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • Year and Date
      2010-12-10
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

URL: 

Published: 2010-08-23   Modified: 2018-03-28  

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