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オートリソソーム形成における脂質修飾型ATG8の機能解明

Publicly Offered Research

Project AreaMultimode autophagy: Diverse pathways and selectivity
Project/Area Number 22H04635
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

本田 郁子 (小山郁子)  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 准教授 (10447948)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywordsオートファジー / リソソーム / 膜融合 / 繋留因子 / ATG8 / オートファゴソーム / オートリソソーム
Outline of Research at the Start

主要な細胞内分解機構であるマクロオートファジーが誘導されると、細胞内で細胞質やオルガネラの一部を取り囲んだオートファゴソームが形成される。オートファゴソームは消化酵素を含んだリソソームと融合し、オートリソソームとなることで、取り囲んだ基質が分解される。オートファジー関連(ATG)タンパク質ATG8は、脂質ホスファチジルエタノールアミン修飾を受けることで、オートファジーにおける機能を獲得することが知られているが、どのような機能をもつかその全貌は不明である。本研究では、オートリソソーム形成過程に焦点を当て、哺乳類マクロオートファジーにおける脂質修飾型ATG8の機能を解明する。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、オートリソソーム形成過程に焦点を当て、哺乳類マクロオートファジーにおけるオートファジー関連(ATG)タンパク質ATG8のホスファチジルエタノールアミン(PE)修飾(以下、ATG8-PEと示す)の機能を解明することを目的とした。ATG8-PE化不全細胞でオートリソソーム形成が少ない理由が、リソソームの融合効率が低いためではないかという仮説を立て、これについて複数の繋留因子の関与を評価した。その結果、ATG8-PE化不全細胞においてEPG5とPLEKHM1の局在に変化が見られた。続いて、両繋留因子の同時欠損細胞を作製したところ、オートリソソーム形成が抑制されていることが分かった。これらの結果から、ATG8-PE化不全細胞におけるオートリソソーム形成不全の理由は、繋留因子EPG5, PLEKHM1のリクルート不足によるリソソーム融合不全であることが示唆された。また、オートファゴソームと他のオルガネラの位置関係を、アレイトモグラフフィーを用いた3次元電子顕微鏡画像から統計的に計測した。その結果、小胞体がもっとも近位に存在するオルガネラであることが分かった。これらの結果をまとめて論文発表した(Takahashi S. et al., Cell Struct Funct. 47:89-99 (2022) )。さらに、形成過程のオートファゴソームの形を、アレイトモグラフフィーを用いた3次元電子顕微鏡画像から統計的に解析し、それを基にオートファゴソームの形態を数理モデルで説明した。この研究をまとめて論文発表した(Sakai Y. et al., Nat Commun. 15:91 (2024))。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Experimental determination and mathematical modeling of standard shapes of forming autophagosomes2024

    • Author(s)
      Sakai Yuji、Takahashi Satoru、Koyama-Honda Ikuko、Saito Chieko、Mizushima Noboru
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 15 Issue: 1 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1038/s41467-023-44442-1

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Quantitative 3D correlative light and electron microscopy of organelle association during autophagy2022

    • Author(s)
      Takahashi Satoru、Saito Chieko、Koyama-Honda Ikuko、Mizushima Noboru
    • Journal Title

      Cell Structure and Function

      Volume: 47 Issue: 2 Pages: 89-99

    • DOI

      10.1247/csf.22071

    • ISSN
      0386-7196, 1347-3700
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transient visit of STX17 (syntaxin 17) to autophagosomes2022

    • Author(s)
      Koyama-Honda Ikuko、Mizushima Noboru
    • Journal Title

      Autophagy

      Volume: 18 Issue: 6 Pages: 1213-1215

    • DOI

      10.1080/15548627.2022.2079337

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] マクロオートファジーにおける細胞質ゾーニング2023

    • Author(s)
      小山-本田郁子、境 祐二、高橋 暁、齊藤 知恵子、立川 正志、水島 昇
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] アレイトモグラフィー法をオートファジー研究に応用する2023

    • Author(s)
      小山‐本田郁子、髙橋 暁、境 祐二、齊藤 知恵子、水島 昇
    • Organizer
      第129回日本解剖学会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] オートファゴソーム内膜の分解におけるATG8と繋留因子の役割2023

    • Author(s)
      小山-本田郁子、高橋暁、水島昇
    • Organizer
      第15回オートファジー研究会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Quantitative 3D correlative light and electron microscopy of autophagosome-organelle contacts and autophagosomal contents2023

    • Author(s)
      Satoru Takahashi, Chieko Saito, Ikuko Koyama-Honda, Noboru Mizushima
    • Organizer
      Ubiquitin & Friends Symposium
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] オートファジー実験デザインのいろは~そこにオートファジーはあるのか?ないのか?~2023

    • Author(s)
      小山ー本田郁子
    • Organizer
      日本顕微鏡学会 第78回学術講演会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] オートリソソーム形成における脂質修飾型ATG8の機能解明2022

    • Author(s)
      小山ー本田郁子
    • Organizer
      新学術領域「マルチモードオートファジー」第4回班会議
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization of the highly-curved rim of forming autophagosomes2022

    • Author(s)
      Ikuko Koyama-Honda, Masashi Tachikawa, Yuji Sakai, Noboru Mizushima
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Integrating the molecular, mechanistic and physiological diversity of autophagy2022

    • Author(s)
      Ikuko Koyama-Honda, Masashi Tachikawa, Yuji Sakai, Noboru Mizushima
    • Organizer
      EMBO Workshop, Integrating the molecular, mechanistic and physiological diversity of autophagy
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of the highly-curved rim of phagophore during autophagosome formation2022

    • Author(s)
      Ikuko Koyama-Honda, Masashi Tachikawa, Yuji Sakai, Noboru Mizushima
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Autophagy
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Morphological and molecular analysis on the relationship between autophagosome-lysosome fusion and autophagosomal inner membrane degradation2022

    • Author(s)
      Satoru Takahashi, Willa Wen-You Yim, Chieko Saito, Ikuko Koyama-Honda, Noboru Mizushima
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Autophagy
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 3D-CLEM using array tomography for quantification in autophagy research2022

    • Author(s)
      Satoru Takahashi, Willa Wen-You Yim, Chieko Saito, Yuji Sakai, Hayashi Yamamoto, Ikuko Koyama-Honda, and Noboru Mizushima
    • Organizer
      日本顕微鏡学会 第78回学術講演会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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