Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
独自技術であるChIL-seqをベースとした単一細胞エピゲノム―トランスクリプトーム同時計測データの取得と、組合せ論的ホッジ分解を用いた単一細胞データの時間構造推定法を組み合わせ、分化における段階的な遺伝子発現を決定付けるクロマチン構成因子の同定を目指す。まず、一細胞マルチオミクスデータの分化経路解析を行うための計測技術の確立を目指す。さらに、取得したマルチオミクスデータと細胞の分化経路を解析する手法の開発を通し、分化時の段階的な遺伝子発現制御に必要なクロマチン構成因子の同定を目指す。
本計画では、独自技術であるChIL-seqをベースとした単一細胞マルチオミクスデータの取得と、組合せ論的ホッジ分解を用いた単一細胞データの時間構造推定法を組み合わせ、分化における段階的な遺伝子発現を決定付けるクロマチン構成因子の同定を目指す。まず、単一細胞マルチオミクスデータの分化経路解析を行うための計測技術の確立を目指す。さらに、取得したマルチオミクスデータと細胞の分化経路を解析する手法の開発を通し、分化時の段階的な遺伝子発現制御に必要なクロマチン構成因子の同定を目指す。マルチオミクス計測の計画については、空間オミクス技術の開発（論文公開予定）および、細胞分化におけるクロマチンのダイナミクスをシングルセル・レベルで解析した（論文投稿中）。またクロマチン分野の共同研究では、ゲノムワイドなヌクレオソーム配置の解析を行い論文発表を行った。
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results, Peer Reviewed: 2 results, Open Access: 2 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results, Invited: 6 results) Remarks (1 results)
Communications Biology
Volume: 7 Issue: 1 Pages: 61-61
10.1038/s42003-023-05694-1
STAR Protocols
Volume: 3 Issue: 2 Pages: 101346-101346
10.1016/j.xpro.2022.101346
https://tx.bioreg.kyushu-u.ac.jp/
