• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Intrinsic periodicity of cellular systems and its modulation as the driving force behind plant development

Publicly Offered Research

Project AreaIntrinsic periodicity of cellular systems and its modulation as the driving force behind plant development
Project/Area Number 22H04712
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

米倉 崇晃  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (60932027)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords植物発生 / 根 / 成長運動 / 回旋 / 回転 / 数理モデル
Outline of Research at the Start

植物の軸性器官は成長しきったあとにはほとんど動けなくなるという制約の中で、屈曲や回旋といった発生に伴う運動を通して取り得る最適な環境に自身の器官を置く。しかし、屈曲についてはそれが地上部でも地下部でも偏差成長によって駆動されていること、またその分子機構も大枠が明らかになりつつあるのに対し、回旋についてはその駆動は不明である。
最近、植物の根は外部から入力される明瞭な刺激のない状況でも、散発的に先端の回転を繰り返すことが分かってきた。そこで、この回転が回旋の駆動に寄与するのではないかと考えた。そこで、根の回転を引き起こす細胞動態を探究し、根の回転が根の運動にどのように寄与するのかを検討する。

Outline of Annual Research Achievements

本年度は、昨年度中に進展が見られた水耕栽培系を確立し、系中でのシロイヌナズナの根の観察を行った。その結果、予想外なことに、そもそもシロイヌナズナの野生型の根は水耕栽培系では二次元的な首振り運動を示していなかった。一方で、spr1-3などの細胞が斜行伸長し根が回転する変異体では首振り運動が見られた。ただし、首振り運動は螺旋成長・回旋運動と対応する現象とは限らないため、証拠としては不十分である。そこで、根の先端運動の追跡に注力した。

本年度は、まず水耕栽培中の根の先端を三次元的に追跡できる観察系を確立し、いくつかの系統において実際に、シロイヌナズナの根の三次元動態を解析した。結果として、シロイヌナズナの野生型Col系統の根は螺旋成長を示すものの、その速度はゲル中・ゲル上に比べると非常に遅いこと、またLer系統の根はそもそも単純な螺旋成長を示さないことも明らかになった。一方で、回転の変異体であるspr1-3は水中でも螺旋成長を示していた。
なお、根の回旋運動が野生型でも明瞭な外部刺激なしに見られた場合に実施することを計画していた、根の回転と回旋の関係についてのシミュレーション研究を停止した。本研究では先行研究で想定されていたように、明瞭な外部刺激がない場合にも根が回転・回旋する理由の考察のために計画していたものだが、回旋がゲルとの接触刺激によって生じる場合にはそもそも仮定が誤りとなるためである。

以上の結果は、回転が回旋の駆動力となり得ることが示しており、また同時にゲル中・ゲル上での根の螺旋成長が、摩擦等によるゲルと根の間の相互作用で引き起こされているものであることを示唆している。これらの結果は従来のシロイヌナズナにおける回旋研究に一石を投じるものである。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] In-Depth Quantification of Cell Division and Elongation Dynamics at the Tip of Growing Arabidopsis Roots Using 4D Microscopy, AI-Assisted Image Processing and Data Sonification2023

    • Author(s)
      Goh Tatsuaki、Song Yu、Yonekura Takaaki、Obushi Noriyasu、Den Zeping、Imizu Katsutoshi、Tomizawa Yoko、Kondo Yohei、Miyashima Shunsuke、Iwamoto Yutaro、Inami Masahiko、Chen Yen-Wei、Nakajima Keiji
    • Journal Title

      Plant And Cell Physiology

      Volume: 64 Issue: 11 Pages: 1262-1278

    • DOI

      10.1093/pcp/pcad105

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A new mathematical model of phyllotaxis to solve the genuine puzzle spiromonostichy2023

    • Author(s)
      Yonekura Takaaki、Sugiyama Munetaka
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 137 Issue: 1 Pages: 143-155

    • DOI

      10.1007/s10265-023-01503-2

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 細胞ダイナミクスの定量解析から探る重力に応答した根の屈曲機構2024

    • Author(s)
      郷 達明,津川 暁,相馬 優輝,米倉 崇晃,笠谷 光流,中島 敬二
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] オーキシン応答を安定に維持する場の選抜によるシロイヌナズナ側根間隔の制御2024

    • Author(s)
      大城 翔平,郷 達明,近藤 洋平,米倉 崇晃,岩田 健太郎,後藤 千恵子,深城 英弘,中島 敬二
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 水耕栽培した根の4Dライブイメージングを用いたシロイヌナズナの根の回旋運動の再考2024

    • Author(s)
      米倉 崇晃,郷 達明,杉山 宗隆,中島 敬二
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 3つの異なる組織培養系における植物細胞の脱分化に伴う核小体の発達の顕微鏡観察と薬理学的解析2024

    • Author(s)
      森川 龍,米倉 崇晃,森中 初音,島津 舜治,近藤 侑貴,大林 祝,杉山 宗隆
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Uncovering the hidden aspects of cell division and elongation dynamics at the tip of growing Arabidopsis roots using 4D-microscopy, AI-assisted image processing, and data sonification2023

    • Author(s)
      Tatsuaki Goh,Yu Song,Takaaki Yonekura,Noriyasu Obushi,Zeping Den,Katsutoshi Imizu,Yoko Tomizawa,Yohei Kondo,Shunsuke Miyashima,Yutaro Iwamoto,Masahiko Inami,Yen-Wei Chen,Keiji Nakajima
    • Organizer
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2023)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular genetic analysis of the role of BTAF1, a TBP-associated factor, in shoot regeneration2023

    • Author(s)
      Takaaki Yonekura,Hatsune Morinaka,Ryu Morikawa,Akihito Mamiya,Munetaka Sugiyama
    • Organizer
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2023)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Two-step regulation of lateral root spacing in Arabidopsis thaliana2023

    • Author(s)
      Shohei Oshiro,Tatsuaki Goh,Yohei Kondo,Takaaki Yonekura,Hidehiro Fukaki,Keiji Nakajima
    • Organizer
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2023)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 螺旋葉序における開度の発生制約と受光効率との関係2023

    • Author(s)
      米倉崇晃,杉山宗隆
    • Organizer
      2023年度数理生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 螺旋葉序における黄金角優越の数学的根拠2023

    • Author(s)
      米倉崇晃,杉山宗隆
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 顕微鏡・AI・人の協働で実現したシロイヌナズナ根端の 4D 細胞動態計測2023

    • Author(s)
      郷 達明,Yu Song,米倉 崇晃,大伏 仙泰,Zeping Den,射水 勝利,富沢 瑶子,近藤 洋平,宮島 俊介,岩本 祐太郎,稲見 昌彦,陳 延偉,中島 敬二
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi