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Adaptive molecular evolution of metalloproteins/metal transporters in metal hyperaccumulator plants

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrated Biometal Science: Research to Explore Dynamics of Metals in Cellular System
Project/Area Number 22H04815
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionSaga University

Principal Investigator

西田 翔  佐賀大学, 農学部, 准教授 (40647781)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywords金属トランスポーター / 金属タンパク質 / 超集積植物 / 重金属超集積植物
Outline of Research at the Start

ZnやNiといった重金属は生命維持において必須や役割を担う一方で、許容濃度を超えると毒性を発揮する。しかし、鉱山などの重金属汚染土壌には重金属を超集積する植物種が自生することが知られており、これらの植物種は進化の過程で特殊な重金属集積/耐性能を獲得したと考えられている。本研究では、重金属超集積植物であるNoccaea属植物が独自に獲得した金属タンパク質あるいは金属輸送タンパク質における構造変化を生物情報学的解析により網羅的に同定し、その変化が重金属集積/耐性能に与える影響を解析することで、植物の金属環境適応における金属タンパク質・金属輸送タンパク質の分子進化を明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

本研究は重金属超集積植物であるNoccaea属植物をモデルとし、超集積植物が独自に獲得した金属トランスポーターにおける一次構造の変化を同定し、その変化が重金属集積性および耐性に与える影響を解析することで、植物の金属環境適応戦略における金属トランスポーターの分子進化を明らかにすることを目的とする。
1)昨年度までに、Ni吸収に関わるFe輸送トランスポーターIRT1が、高Ni適応種であるNoccaea japonicaにおいて極めて得意的な構造変異が生じていることを明らかにしてきた。今年度は、N. japonicaおよび近縁種より単離したIRT1の金属輸送試験を酵母を用いて実施した。その結果、N. japonica由来のIRT1は他種由来のIRT1と同様にFe輸送能を持つ一方で、Ni輸送能は他のIRT1よりも低いことが明らかとなった。これはN. japonicaが高Ni土壌に適応する過程で過度なNi吸収を抑制するために起きた分子進化であると予想された。今後はN. japonica由来のIRT1を利用した作物のNi集積低減技術への応用が期待される。
2)集積種のN. caerulescensとモデル植物のシロイヌナズナを対象に、全ゲノムでのスプライシングパターンの詳細な解析を進めた。その結果、約4000個の遺伝子においてシロイヌナズナと比較しN. caerulescensでRNAアイソフォームが増加していることが明らかとなり、さらにこの遺伝子群には金属輸送に関わる遺伝子が濃縮されていた。これは、スプライシングを介して金属輸送関連タンパク質の構造的多様性が拡大したことを示している。今後、これらのタンパク質の機能を明らかにすることで植物の重金属耐性や作物のミネラル栄養価強化につながることが期待できる。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

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      Takuo Enomoto, Nobuhiro Tanaka, Toru Fujiwara, Sho Nishida
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 64 Issue: 10 Pages: 1159-1166

    • DOI

      10.1093/pcp/pcad080

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    • Author(s)
      Qin Dong、Nishida Sho、Tominaga Rumi、Ueda Akihiro、Raboy Victor、Saneoka Hirofumi
    • Journal Title

      Soil Science and Plant Nutrition

      Volume: 68 Issue: 5-6 Pages: 553-562

    • DOI

      10.1080/00380768.2022.2111191

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    • Journal Title

      Soil Science and Plant Nutrition

      Volume: - Issue: 3 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1080/00380768.2022.2050662

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      日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会
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      Takuo Enomoto, Nobuhiro Tanaka, Toru Fujiwara, Sho Nishida
    • Organizer
      The 8th International Symposium on Metallomics
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  • [Remarks] 佐賀大学農学部植物栄養学分野

    • URL

      http://nishida.ag.saga-u.ac.jp/home.html

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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