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微生物が駆動し、ヒトと環境を繋ぐセレノダイナミクス

Publicly Offered Research

Project AreaIntegrated Biometal Science: Research to Explore Dynamics of Metals in Cellular System
Project/Area Number 22H04823
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

三原 久明  立命館大学, 生命科学部, 教授 (30324693)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Keywordsセレン / 微生物 / 代謝
Outline of Research at the Start

本研究では、微生物が駆動するセレンの動態を「ヒトと環境を繋ぐセレノダイナミクス」と捉え、ヒト尿中に排泄される主要な有機態セレンを対象とし、微生物駆動型セレノダイナミクス研究のさきがけとなる研究課題に取り組む。哺乳動物が排出したセレンが滞留することなく生態系で拡散・循環するメカニズムやセレン欠乏・蓄積環境における微生物のはたらきを解明することを目的としている。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、微生物が駆動するセレンの動態を「ヒトと環境を繋ぐセレノダイナミクス」と捉え、哺乳動物が排出したセレンが滞留することなく生態系で拡散・循環するメカニズムやセレン欠乏・蓄積環境における微生物のはたらきを解明することを目的として研究を実施した。セレノシュガーの酸化生成物であるメタンセレニン酸 (MSeIA) は様々な細菌に毒性を示すことが分かった。そこで、様々な土壌試料を用い、MSeIAを添加した培地で集積培養し、スクリーニングを行った結果、高濃度のMSeIA存在下で良好に生育するMSeIA耐性菌候補24菌株を取得した。16S rRNAシーケンシングの結果、Bullucella属3種、Achromobacter属2種、Pseudomonas属2種であることが分かった。これら7菌株をMSeIA添加培地で8日間培養し、培地上清中の可溶性セレン濃度を調べたところ、全ての株において可溶性セレンが減少しており、揮発性または不溶性セレン化合物が生成していることが示唆された。また、Aminobacter sp. 由来TmsAをN末端Hisタグ融合タンパク質として大量発現させ、Ni-NTAカラムを用いて精製した。メチル基転移活性を調べた結果、TmsAはトリメチルセレノニウムイオン (TMSe) およびその構造類似体であるトリメチルスルホニウムイオン (TMS) に対して高い活性を示した。分子系統解析の結果、TmsAはジメチルスルホニオプロピオン酸 (DMSP)-テトラヒドロ葉酸 (THF) メチル基転移酵素 (DmdA) とは異なる系統群を形成することが明らかとなった。TmsAはDmdAとの共通祖先からTMSeを基質とするように進化したと考えられた。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (37 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (30 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Thapar Inst. Eng. Technol.(インド)

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      Ochi, A., Mihara, H.
    • Journal Title

      Metallomics Research

      Volume: 4 Issue: 1 Pages: reg14-reg20

    • DOI

      10.11299/metallomicsresearch.MR202401

    • ISSN
      2436-5173
    • Year and Date
      2024-04-03
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      Singh, A., Jaiswal, S. K., Prakash, R., Mihara, H., Prakash, N. T.
    • Journal Title

      Journal of Cluster Science

      Volume: - Issue: 5 Pages: 1425-1437

    • DOI

      10.1007/s10876-024-02600-5

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      三原久明
    • Journal Title

      ビタミン

      Volume: 97 Pages: 325-331

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      青野陸、井上真男、三原久明
    • Journal Title

      Farumashia

      Volume: 59 Issue: 3 Pages: 185-189

    • DOI

      10.14894/faruawpsj.59.3_185

    • ISSN
      0014-8601, 2189-7026
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      越智杏奈、井上真男、青野陸、三原久明
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      Volume: 93 Pages: 162-168

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      井上真男, 伊豆由記子, 青野陸, 越智杏奈, 三原久明
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      第7回日本セレン研究会
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      三原久明
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      青野陸, 植田響輝, 井上真男, 坂本暁紀, 牧村康平, 上出遥, 越智杏奈, 戸部隆太, N.T. Prakash, 三原久明
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      越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 植田響輝, 三原久明
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      芝本佳永, 越智杏奈, 豊竹洋佑, 藤岡大毅, 青野陸, 井上真男, 今井友也, 三原久明
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      上出遥, 芝本佳永, 越智杏奈, 藤岡大毅, 井上真男, 青野陸, 今井友也, N.T. Prakash, 三原久明
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      三原久明, 吉澤拓也, 伊豆由記子, 井上真男, 青野陸, 松村浩由
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Substrate specificity of NAD(P)H-dependent succinic semialdehyde reductase from Gluconobacter oxydans 621H2023

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      T.R. Majumder, R. Aono, M. Inoue, H. Matsumura, H. Mihara
    • Organizer
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  • [Presentation] Molecular mechanism in microbial degradation of trimethylselenonium2023

    • Author(s)
      M. Inoue, A. Ochi, T. Uchida, R. Kayaba, C. Terabe, M. Tanaka, R. Aono, S. Sato, Y. Ogra, H. Mihara
    • Organizer
      9th International Selenium Conference Focused on Selenium in Chemistry, Biology, and Medicine
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      R. Aono, K. Kusakabe, M. Inoue, R. Tobe, H. Mihara
    • Organizer
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] バクテリアが駆動するカルコゲン元素循環の分子メカニズム2022

    • Author(s)
      三原久明
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    • Invited
  • [Presentation] 微生物が駆動し、ヒトと環境をつなぐセレノダイナミクス2022

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      三原久明
    • Organizer
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      K. Shibamoto, A. Ochi, Y. Toyotake, R. Aono, M. Inoue, T. Imai, H. Mihara
    • Organizer
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    • Author(s)
      A. Ochi, M. Inoue, R. Aono, H. Mihara
    • Organizer
      The 8th International Symposium on Metallomic
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  • [Presentation] Aminobacter属細菌に新たに見つかったトリメチルセレノニウム・トリメチルスルフォニウム資化遺伝子群2022

    • Author(s)
      越智杏奈, 寺部千夏, 井上真男, 田中麻衣, 青野陸, 北山香織, 栗原達夫, 佐藤総一, 小椋康光, 三原久明
    • Organizer
      日本ビタミン学会第74回大会
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  • [Presentation] トリメチルセレノニウム資化に関与する遺伝子クラスターの転写制御機構の解明2022

    • Author(s)
      萱場亮太, 越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 寺部千夏, 田中麻衣, 佐藤総一, 小椋康光, 三原久明
    • Organizer
      メタルバイオサイエンス研究会2022
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  • [Presentation] 土壌微生物由来トリメチルセレノニウム脱メチル化酵素の発見と機能解析2022

    • Author(s)
      内田透梧, 越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 寺部千夏, 田中麻衣, 佐藤総一, 小椋康光, 三原久明
    • Organizer
      メタルバイオサイエンス研究会2022
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Novel pathway for assimilation of trimethylselenonium in soil microorganisms2022

    • Author(s)
      M. Inoue, A. Ochi, C. Terabe, M. Tanaka, R. Aono, S. Sato, Y. Ogra, H. Mihara
    • Organizer
      The 8th International Symposium on Metallomics
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 立命館大学 研究者学術情報データベース

    • URL

      https://research-db.ritsumei.ac.jp/rithp/k03/resid/S000676

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      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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