大規模メタゲノムデータを用いた高精度機能未知遺伝子推定手法の開発

• Project Area: Post-Koch Ecology: The next-era microbial ecology that elucidates the super-terrestrial organism system
• Project/Area Number: 22H04891
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Complex systems
• Research Institution: Waseda University
• Principal Investigator: 福永 津嵩 早稲田大学, 高等研究所, 准教授(任期付) (80791433)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2024-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000); Fiscal Year 2023: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000); Fiscal Year 2022: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
• Keywords: 遺伝子機能推定 / 比較ゲノム / メタゲノム / 機械学習

Outline of Research at the Start

本研究では、メタゲノムデータから高精度に機能未知遺伝子の機能を予測するために、(1) All- to-all free 法による超高速オーソログ推定ソフトウェアの開発 (2) Graphical Lasso 法を用いた高 精度メタゲノム系統プロファイル法の開発、という 2 点について研究を行う。