ありえる細胞間通信システムの機械学習による具現化とこれを用いた微生物集団の制御

Publicly Offered Research

Project Area	Post-Koch Ecology: The next-era microbial ecology that elucidates the super-terrestrial organism system
Project/Area Number	22H04892
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Complex systems
Research Institution	Waseda University
Principal Investigator	木賀大介早稲田大学, 理工学術院, 教授 (30376587)
Project Period (FY)	2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help	¥8,710,000 (Direct Cost: ¥6,700,000、Indirect Cost: ¥2,010,000) Fiscal Year 2023: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000) Fiscal Year 2022: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Keywords	合成生物学 / 深層学習 / 細胞間相互作用 / 細胞間通信 / 転写制御
Outline of Research at the Start	同一機能を持つタンパク質についての多数の野生型アミノ酸配列を学習させることで、活性を持つ可能性が高い配列を生成できる。本研究では、これを細胞間通信系のタンパク質に適用する。機械学習によって生成された新規細胞間通信タンパク質群は、大腸菌内または無細胞系でその活性を確認する。続いて、これらタンパク質を導入した「デザイナー細胞」を構築し、天然微生物の挙動を制御する。