Partying of COVID-19 disasters to be clarified by interdisciplinary research

• Project Area: Human behavioral science for subjectification ("tojisha-ka") by interaction-based & rule-/story-based understanding of the brain & the world
• Project/Area Number: 22H05215
• Research Category: Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Transformative Research Areas, Section (I)
• Research Institution: Nagoya University
• Principal Investigator: 岩見 真吾 名古屋大学, 理学研究科, 教授 (90518119)
• Project Period (FY): 2022-06-16 – 2024-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥7,800,000 (Direct Cost: ¥6,000,000、Indirect Cost: ¥1,800,000); Fiscal Year 2023: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
• Keywords: データ解析 / コロナ禍

Outline of Research at the Start

本研究では、数理モデル、シミュレーション、人工知能などの数理科学技術を駆使して、東京ティーンコホートのCOVID-19前後を含む大規模データを解析する。具体的には、コロナ禍前後のアンケートとGPSを用いた行動履歴データを統合的に分析することで、当事者化（コロナ禍による行動変容の受け入れ）に至る過程の層別化を実現する。また、ゲノム、性ホルモン・コルチゾル、脳構造・機能などの情報と紐づいた各層別化集団に対して、COVID-19というエピソードにより誘発された法則性と物語性をデータサイエンスの観点から定量的かつ定性的に分析する。

Outline of Annual Research Achievements

当事者研究では、これまで本人でもわからなかった自身の苦悩や苦痛のパターンについて、客観的に観察するような視点を持つことで、それらが回復・軽減されることが報告されている。今日まで、精神疾患、発達障害、依存症などに対するさまざまな当事者研究がとりわけ精神医学領域で行われてきたが、COVID-19のパンデミックは法則性(日常の生活行動)の急激な改変を生み、物語性(コロナ禍)を構築し続けている。本研究では、数理モデル、シミュレーション、人工知能などの数理科学技術を駆使して、東京ティーンコホートのCOVID-19前後を含む大規模データを解析する。具体的には、コロナ禍前後のアンケートとGPSを用いた行動履歴データを統合的に分析することで、当事者化（コロナ禍による行動変容の受け入れ）に至る過程の層別化を実現する。また、ゲノム、性ホルモン・コルチゾル、脳構造・機能などの情報と紐づいた各層別化集団に対して、COVID-19というエピソードにより誘発された法則性と物語性をデータサイエンスの観点から定量的かつ定性的に分析する。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Analysis of the risk and pre-emptive control of viral outbreaks accounting for within-host dynamics: SARS-CoV-2 as a case study (2023)
  • Author(s): Hart William S.、Park Hyeongki、Jeong Yong Dam、Kim Kwang Su、Yoshimura Raiki、Thompson Robin N.、Iwami Shingo
  • Journal Title: Proceedings of the National Academy of Sciences Volume: 120 Issue: 41
  • DOI: 10.1073/pnas.2305451120
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Isolation may select for earlier and higher peak viral load but shorter duration in SARS-CoV-2 evolution (2023)
  • Author(s): Sunagawa Junya、Park Hyeongki、Kim Kwang Su、Komorizono Ryo、Choi Sooyoun、Ramirez Torres Lucia、Woo Joohyeon、Jeong Yong Dam、Hart William S.、Thompson Robin N.、Aihara Kazuyuki、Iwami Shingo、Yamaguchi Ryo
  • Journal Title: Nature Communications Volume: 14 Issue: 1 Pages: 7395-7395
  • DOI: 10.1038/s41467-023-43043-2
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Modeling COVID-19 vaccine booster-elicited antibody response and impact of infection history (2023)
  • Author(s): Nishiyama Takara、Miyamatsu Yuichiro、Park Hyeongki、Nakamura Naotoshi、Yokokawa Shibata Risa、Iwami Shingo、Nagasaki Yoji
  • Journal Title: Vaccine Volume: 41 Issue: 52 Pages: 7655-7662
  • DOI: 10.1016/j.vaccine.2023.11.040
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Infectious virus shedding duration reflects secretory IgA antibody response latency after SARS-CoV-2 infection (2023)
  • Author(s): Miyamoto S, Nishiyama T et al.
  • Journal Title: Proceedings of the National Academy of Sciences Volume: 120 Issue: 52 Pages: 1-10
  • DOI: 10.1073/pnas.2314808120
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Relationship between the inclusion/exclusion criteria and sample size in randomized controlled trials for SARS-CoV-2 entry inhibitors (2023)
  • Author(s): Tatematsu Daiki、Akao Marwa、Park Hyeongki、Iwami Shingo、Ejima Keisuke、Iwanami Shoya
  • Journal Title: Journal of Theoretical Biology Volume: 561 Pages: 111403-111403
  • DOI: 10.1016/j.jtbi.2022.111403
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Increased flexibility of the SARS-CoV-2 RNA-binding site causes resistance to remdesivir (2023)
  • Author(s): Torii Shiho、Kim Kwang Su、Koseki Jun、Suzuki Rigel、Iwanami Shoya、Fujita Yasuhisa、Jeong Yong Dam、Ito Jumpei、Asakura Hiroyuki、Nagashima Mami、Sadamasu Kenji、Yoshimura Kazuhisa、Sato Kei、Matsuura Yoshiharu、Shimamura Teppei、Iwami Shingo、Fukuhara Takasuke、The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium
  • Journal Title: PLOS Pathogens Volume: 19 Issue: 3 Pages: e1011231-e1011231
  • DOI: 10.1371/journal.ppat.1011231
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Antithetic effect of interferon-α on cell-free and cell-to-cell HIV-1 infection. (2022)
  • Author(s): Kumata R, Iwanami S, Mar KB, Kakizoe Y, Misawa N, Nakaoka S, Koyanagi Y, Perelson A, Schoggins J, Iwami S, Sato K
  • Journal Title: PLoS Computational Biology Volume: 18 Issue: 4 Pages: 1010053-1010053
  • DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010053
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Maternal embryonic leucine zipper kinase (MELK) optimally regulates the HIV-1 uncoating process (2022)
  • Author(s): Nishiyama Takara、Takada Toru、Takeuchi Hiroaki、Iwami Shingo
  • Journal Title: Journal of Theoretical Biology Volume: 545 Pages: 111152-111152
  • DOI: 10.1016/j.jtbi.2022.111152
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Estimation of timing of infection from longitudinal SARS-CoV-2 viral load data: class FormattedString { value: mathematical modelling study } (2022)
  • Author(s): Ejima Keisuke、Kim Kwang Su、Bento Ana I.、Iwanami Shoya、Fujita Yasuhisa、Aihara Kazuyuki、Shibuya Kenji、Iwami Shingo
  • Journal Title: BMC Infectious Diseases Volume: 22 Issue: 1 Pages: 656-656
  • DOI: 10.1186/s12879-022-07646-2
  • URL: https://localhost/en/publications/13a4057b-2852-4e70-95e1-b8c04e819366
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Designing isolation guidelines for COVID-19 patients with rapid antigen tests (2022)
  • Author(s): Jeong Yong Dam、Ejima Keisuke、Kim Kwang Su、Joohyeon Woo、Iwanami Shoya、Fujita Yasuhisa、Jung Il Hyo、Aihara Kazuyuki、Shibuya Kenji、Iwami Shingo、Bento Ana I.、Ajelli Marco
  • Journal Title: Nature Communications Volume: 13 Issue: 1 Pages: 4910-4910
  • DOI: 10.1038/s41467-022-32663-9
  • URL: https://localhost/en/publications/7b499c5e-f21c-4404-87d3-f00403191749
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Presentation] 新興感染症の異分野融合研究：時系列バイオマーカーのデータサイエンス (2023)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 第97回日本感染症学会総会・学術講演会 第71回日本化学療法学会学術集会 合同学会
  • Invited
• [Presentation] A case study of Fukushima vaccination cohort - Real world application (II) (2023)
  • Author(s): Shingo Iwami
  • Organizer: 2023 China-India-Japan-Korea International Conference on Mathematical and Theoretical Biology
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Modeling and characterizing vaccine-elicited antibody responses (2023)
  • Author(s): Shingo Iwami
  • Organizer: ICIAM 2023 TOKYO Computational Biology: Session I
  • Invited
• [Presentation] 急性肝不全の未来予測 (2023)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 2023年 日本数理生物学会年会
• [Presentation] ウイルス学におけるデジタルツインアプローチの役割 (2023)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 第70回日本ウイルス学会学術集会
  • Invited
• [Presentation] 異分野融合アプローチを駆使した創薬DX研究 (2023)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 第97回 日本薬理学会年会, 2023/12/15
  • Invited
• [Presentation] Modeling clade I mpox lesion transition dynamics - A retrospective analysis of clinical data in DRC - (2023)
  • Author(s): Shingo Iwami
  • Organizer: U.S.-Japan Cooperative Medical Sciences Program (USJCMSP) International Conference on Emerging Infectious Diseases (EID) in the Pacific Rim
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 数理モデルを駆使した定量的データ解析の役割 (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 第58回 日本肝臓学会総会 特別企画4 テクニカルセミナー
• [Presentation] 異分野融合研究で挑む定量的疾患研究 (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 日本生化学会 北陸支部 第40回大会 シンポジウム
• [Presentation] デジタルツイン時代の感染症創薬研 (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 日本臨床ウイルス学会 シンポジウム4
• [Presentation] デジタルツイン時代のCOVID-19研究 (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 第49回 日本毒性学会学術年会 シンポジウム
• [Presentation] 数理モデル駆動型のデータ解析 (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 2022年度 日本数理生物学会
• [Presentation] Stratifying elicited antibody dynamics after two doses of SARS-CoV-2 vaccine in a community-based cohort in Fukushima, Japan, (2022)
  • Author(s): Shingo Iwami
  • Organizer: The 20th Awaji International Forum on Infection and Immunity, Research Institute for Microbial Diseases
• [Presentation] デジタルツイン時代の医薬品の橋渡し研究 (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 創薬薬理フォーラム第30回シンポジウム
• [Presentation] ウイルス排出量の不均一性を考慮したCOVID-19感染者隔離戦略の定量的分析 (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 第69回日本ウイルス学会学術集会
• [Presentation] 福島ワクチンコホートのデータ解析 (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 現場からの医療改革推進協議会 第17回シンポジウム
• [Presentation] 数理モデル駆動型の未病研究 -不均一性と層別化- (2022)
  • Author(s): 岩見真吾
  • Organizer: 日本生理学会第100回記念大会
• [Book] 新型コロナウイルスワクチンのブースター接種による誘導抗体動態の定量的解析 (2023)
  • Author(s): 西山尚来，宮松雄一郎，朴炯基，横川理沙，長崎洋司，岩見真吾
  • Total Pages: 222
  • Publisher: 実験医学
• [Book] ウイルス感染の数理モデルとシミュレーション ―データを定量的に理解する― (2023)
  • Author(s): 岩見 真吾, 中岡 慎治, 岩波 翔也
  • Total Pages: 304
  • Publisher: 共立出版
• [Book] 実験医学「感染症のデータサイエンス-いかに感染を制御するのか？どうやって治療をデザインするのか？」 (2022)
  • Author(s): 川上英良，岩見真吾／企画
  • Total Pages: 5
  • Publisher: 羊土社