Cross-scale measurement of nuclear pore transport system
Publicly Offered Research
Project Area | New cross-scale biology |
Project/Area Number |
22H05537
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Research Category |
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Review Section |
Transformative Research Areas, Section (III)
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Research Institution | Kanazawa University |
Principal Investigator |
WONG W・R 金沢大学, ナノ生命科学研究所, 教授 (30464035)
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Project Period (FY) |
2022-06-16 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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Budget Amount *help |
¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
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Keywords | 核膜孔 / クロススケール / 高速AFM / 超解像顕微鏡 / 液―液相分離 / ORF6 / 脳腫瘍 / 核膜孔複合体 |
Outline of Research at the Start |
核-細胞質を結ぶ唯一の「メゾ複雑体」輸送孔である核膜孔は、その内部に相分離から成る液滴を形成し、細胞増殖やウイルス感染応答にともなうすべてのDNA情報ネットワークを選択的に制御する。病態で変化する分子輸送の仕組みを理解するには、核膜孔内部の液滴の状態と機能相関のクロススケール核膜孔内分子構造動態の解明が必要である。本研究では、申請者らが確立してきた独自のイメージング技術により、選択的核膜分子輸送システムの基盤となる相分離のメゾ動態と機能化メカニズムを解明する。
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Outline of Annual Research Achievements |
核-細胞質を結ぶ唯一の「メゾ複雑体」輸送孔である核膜孔は、その内部に相分離から成る液滴を形成し、細胞増殖やウイルス感染応答にともなうすべてのDNA情報ネットワークを選択的に制御する。病態で変化する分子輸送の仕組みを理解するには、核膜孔内部の液滴の状態と機能相関のクロススケール核膜孔内分子構造動態の解明が必要である。本研究では、申請者らが確立してきた独自のイメージング技術により、選択的核膜分子輸送システムの基盤となる相分離のメゾ動態と機能化メカニズムを解明する。本年度では、「NUPs発現変化-液滴の変化-脳腫瘍発症」のつながりを示すデータ中から、病態予測に有効な診断マーカーを抽出する。これら診断マーカーについて、申請者と金沢大学・脳神経外科の中田教授が確立した悪性脳腫瘍マウスモデルや、臨床サンプルの提供を受けて、生体レベルにおける検証を行う。また、新型コロナウイルス由来タンパク質ORF6は、NUPsと相互作用し、核膜孔による核-細胞質間分子輸送を破綻させる。また、新型コロナウイルスタンパク質NSP9は宿主細胞内で液滴を形成し、核膜孔の液滴を形成するFG-NUPsを標的とすることで、核内移行を阻害する。これらの予備的な研究データに基づき、ウイルス感染応答にともなう液滴の状態-機能相関を解明するため、ORF6を発現した細胞の核膜孔の液滴のメゾ動態を明らかにする。現在、研究領域内西田先生のIn-cell NMRを研究開発している。。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では、申請者らが確立してきた独自のイメージング技術により、選択的核膜分子輸送システムの基盤となる相分離のメゾ動態と機能化メカニズムを解明する。初年度である今年は、「NUPs発現変化-液滴の変化-脳腫瘍発症」のつながりを示すデータ中から、病態予測に有効な診断マーカーを抽出することができた。さらに、領域内の連携としても公募班である丹羽班との連携テーマを設定することができた。また、研究領域内西田先生のIn-cell NMR共同研究テーマを具体的に設定することができた。一部では観察結果も得られつつあり、初年度の進捗としては、おおむね順調に進展と言える。
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Strategy for Future Research Activity |
順調に進展しており、このまま目標通りに進めていく。
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Report
(1 results)
Research Products
(11 results)
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[Journal Article] Nanoscopic Assessment of Anti-SARS-CoV-2 Spike Neutralizing Antibody Using High-Speed AFM.2023
Author(s)
Keesiang Lim, Goro Nishide, Elma Sakinatus Sajidah, Tomoyoshi Yamano, Yujia Qiu, Takeshi Yoshida, Akiko Kobayashi, Masaharu Hazawa, Toshio Ando, Rikinari Hanayama, Richard W Wong
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Journal Title
Nano letters
Volume: 23
Issue: 2
Pages: 619-628
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Spatiotemporal tracking of small extracellular vesicle nanotopology in response to physicochemical stresses revealed by HS-AFM.2022
Author(s)
Elma Sakinatus Sajidah, Keesiang Lim, Tomoyoshi Yamano, Goro Nishide, Yujia Qiu, Takeshi Yoshida, Hanbo Wang, Akiko Kobayashi, Masaharu Hazawa, Firli R P Dewi, Rikinari Hanayama, Toshio Ando, Richard W Wong
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Journal Title
Journal of extracellular vesicles
Volume: 11
Issue: 11
Pages: 12275-12275
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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