非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係
Publicly Offered Research
| Project Area | Biology of Non-domain Biopolymer |
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| Project/Area Number |
22H05593
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Transformative Research Areas, Section (III)
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| Research Institution | University of Fukui |
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Principal Investigator |
本田 信治 福井大学, 学術研究院医学系部門, 准教授 (90632167)
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| Project Period (FY) |
2022-06-16 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥8,450,000 (Direct Cost: ¥6,500,000、Indirect Cost: ¥1,950,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
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| Keywords | アカパンカビ / ウイルス |
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| Outline of Research at the Start |
菌類のカプシド無しウイルスはゲノムの区画化も細胞外への出芽もできず、宿主の免疫機構を常活性化させながら、特定の宿主内で持続感染する。ウイルスゲノム情報、各々の菌類ウイルスが有する機能未知の「非ドメイン型バイオポリマー」が特殊な生活環を支えていることが推測されるが、その研究は未開拓なままである。本研究では、構築したモデル生物アカパンカビのウイルス感染系（Honda et al, Nature Comm, 2020）を用いて菌類ウイルスの非ドメイン型バイオポリマーがどのように独自の生活環に貢献しているのかを分子レベルで謎解く。
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| Outline of Annual Research Achievements |
菌類のカプシド無しウイルスはゲノムの区画化も細胞外への出芽もできず、宿主の免疫機構を常活性化させながら、特定の宿主内で持続感染する。ウイルスゲノム情報、各々の菌類ウイルスが有する機能未知の「非ドメイン型バイオポリマー」が特殊な生活環を支えていることが推測されるが、その研究は未開拓なままである。本研究では、構築したモデル生物アカパンカビのウイルス感染系（Honda et al, Nature Comm, 2020）を用いて菌類ウイルスの非ドメイン型バイオポリマーがどのように独自の生活環に貢献しているのかを分子レベルで謎解くことを目的としている。
まず、RNA-seqのライブラリー作製時の違い、Oligo-dTの逆転写では検出されず、ランダムプライマーを用いた逆転写では検出されたNcFV1のLncRNAをストランド特異的なノーザン解析により検出した。また、NcFV1がコードするP2とGFPの融合タンパク質を過剰発現する遺伝子組換え株を作製し、in vivo解析を行ったところ、NcFV1感染時のみに顆粒構造を形成し、この顆粒構造はカプシド有りウイルスNcPV１感染時には形成されないことを確認した。これらの結果から、カプシド無しウイルスNcFV1は、ドメイン型バイオポリマーであるRNA複製酵素以外に、２種類の非ドメイン型バイオポリマーを有していることが強く示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
当初計画していた、①人為的に遺伝子操作したRNAウイルスの導入法、②FISH法の両者ともにアカパンカビを含めた糸状菌で極めて困難であるため、この実験系の構築により時間がかかることが判明したため。
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| Strategy for Future Research Activity |
上記の実験系構築の推進とともに、新たに同定したカプシド無しウイルスNcFV1感染時に誘導される宿主側の非ドメイン型バイオポリマーの機能解析を行い、菌類ウイルスとの関係解明を目指す。
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Report
(1 results)
Research Products
(3 results)
