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Fengycin構造混乱の終結:生合成経路の矛盾解消

Publicly Offered Research

Project AreaBiosynthetic machinery: Deciphering and regulating the system for bioactive metabolite diversification
Project/Area Number 23108504
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionHirosaki University

Principal Investigator

橋本 勝  弘前大学, 農学生命科学部, 教授 (40212138)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2012: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2011: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Keywordsfengycin / plipastatin / 構造混乱 / 構造確定 / NMR / NMRスペクトル / 構造解析 / 分解反応 / CDスペクトル / ダンシル化
Outline of Annual Research Achievements

Bacillus subtilis H336Bの培養液は強い抗菌活性を示し、その培養抽出液から活性物質を単離したところ、報告されているfengycinと同一のスペクトルを示す環状デプシペプチドであることが判明した。しかし、その構造を詳細に調べたところ、その異性体として報告されているplipastatinと同一であることが判明した。plipastatinとfengycinはともに一対の鏡像体チロシンを含んでおり、その配列が異なるというものであった。調査したところ、両者の生合成クラスターはほとんど一致しており、論文上同一物質とみなしているもの、さらに異なった異性体と判断しているものなど多数あり、構造に混乱が見られた。本研究課題では、この構造混乱の終結を目指した。
まず、fengycinとplipastatinのスペクトルは異なると報告されており、単離したサンプルはfengycinのそれとのみ一致したが、このサンプルを酢酸ナトリウムと処理後、ゲル濾過を行ったところ、報告されているplipastatinのスペクトルとほぼ一致した。したがって、両者は同一物質であることが明らかになった。次に、分解反応や、部分構造を合成するなど、可能な限り演繹的な方法で構造を解析したところ、この化合物は、報告されているplipastatinの構造が正しいということが判明した。この構造であれば、整合性クラスターにも矛盾がなく都合がよいといえる。
今回の結論を完全に証明するにはFengycinとして報告されていた構造を合成し、そのスペクトルが天然物とは異なることを示す必要がある。そこで、旧fengycin構造の合成を検討した。2012年度で環状デプシペプチドの構築法を確立した。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (19 results)

  • [Journal Article] Structural corrections of photinides A, B and their novel derivatives2012

    • Author(s)
      Yasumura R
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 68 Issue: 38 Pages: 7991-7996

    • DOI

      10.1016/j.tet.2012.06.108

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    • Author(s)
      M. Honma, K. Tanaka, K. Konno, K. Tsuge, T. Okuno, M. Hashimoto
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem

      Volume: 20 Issue: 12 Pages: 3793-3798

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2012.04.040

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  • [Journal Article] Absolute Stereochemistry of Altersolanol A and Alterporriols2012

    • Author(s)
      S.Kanamaru, M.Honma, T.Murakami, T.Tsushima, S.Kudo, K.Tanaka, K.Nihei, T.Nehira, M.Hashimoto
    • Journal Title

      Chrality

      Volume: 24 Issue: 2 Pages: 137-146

    • DOI

      10.1002/chir.21035

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  • [Journal Article] A Novel Bisretinoid of Retina Is an Adduct on Glycerophosphoethanolamine2011

    • Author(s)
      K.Yamamoto, K.Yoon, K.Ueda, M.Hashimoto, J.R.Sparrow
    • Journal Title

      Investigative Ophthalmology & Visual Science

      Volume: 51 Issue: 12 Pages: 9084-9090

    • DOI

      10.1167/iovs.11-8632

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      W.C.Tayone, S.Kanamaru, M.Honma, K.Tanaka, T.Nehira, M.Hashimoto
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 75 Issue: 12 Pages: 2390-2393

    • DOI

      10.1271/bbb.110621

    • NAID

      10030397917

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
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      S.Noguchi, S.Takemoto, S.Kidokoro, K..Yamamoto, M.Hashimoto
    • Journal Title

      Bloorg.Med.Chem

      Volume: 19 Issue: 12 Pages: 3812-3830

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2011.04.048

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    • Author(s)
      N.Akiyama, S.Noguchi, M.Hashimoto
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 75 Issue: 7 Pages: 1380-1382

    • DOI

      10.1271/bbb.110120

    • NAID

      10029329535

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
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      2013-03-24
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    • Organizer
      第54 天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2012-09-18
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    • Organizer
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    • Place of Presentation
      New York
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      2012-07-26
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      Masaru Hashimoto
    • Organizer
      International Conference of Natural Product Biosynthesis
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    • Year and Date
      2012-06-17
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      六車美沙、本間美保、橋本勝
    • Organizer
      日本農芸化学会東北支部第147回大会
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      弘前大学
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      橋本勝
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      熊本大学
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      鶴岡
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      2011-10-08
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      金丸沙樹、坂元君年、橋本勝
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      日本農芸化学会東北支部第146回大会
    • Place of Presentation
      鶴岡
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      2011-10-08
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      日本農芸化学会東北支部第146回大会
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      鶴岡
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      2011-10-08
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      本間美保、田中和明、紺野勝弘、柘植謙爾、橋本勝
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      日本農芸化学会東北支部第146回大会
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      鶴岡
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      2011-10-08
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      橋本勝
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      大阪
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      2011-06-17
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      東京
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      日本農芸化学会2011年度大会
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  • [Presentation] 抗菌性デプシペプチドの単離と構造決定

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      京都(震災のため中止、発表は成立)
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Published: 2011-04-06   Modified: 2018-03-28  

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