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ウリ科植物の苦味配糖体サポニン生合成系酵素遺伝子群の機能解析

Publicly Offered Research

Project AreaBiosynthetic machinery: Deciphering and regulating the system for bioactive metabolite diversification
Project/Area Number 23108528
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionKazusa DNA Research Institute

Principal Investigator

鈴木 秀幸  公益財団法人かずさDNA研究所, 産業基盤開発研究部, 主席研究員 (80276162)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Fiscal Year 2012: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2011: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Keywordsオミックス統合解析 / サポニン生合成 / 酸化酵素 / オキシドスクアレン環化酵素 / 次世代シークエンサー / EST解析 / ウリ科植物 / 苦味配糖体
Outline of Annual Research Achievements

ウリ科植物ニガウリ(Momordica charantia)の苦味配糖体サポニン生合成経路と生合成酵素(OSC 、水酸化酵素、配糖化酵素など)の全貌を解明することを目指し、次世代シークエンサーを用いて、ニガウリの10種類の器官(葉、茎、果実、根など)のRNA-Seq解析を行い、4種類のoxidosqualene環化酵素(OSC)遺伝子を見出した。それらの全長配列を取得後、酵母GIL77株を用いて発現機能解析を行った結果、それぞれcucurbitadienol、cycloartenol、β-amyrinおよびisomultiflorenolを単一生成物として与えるOSCであることが明らかとなった。
キュウリゲノム情報から、cucurubitadienol骨格を直接酸化する酵素にCYP81が関与している可能性が示唆されたことより、ニガウリ由来のcucurubitadienol合成酵素(McCBS)遺伝子及びMcCYP81遺伝子がトリテルペン生合成遺伝子クラスターを形成すると仮定すると、同じ遺伝子発現制御を受ける事が推測される。そこで、RNA-Seq解析での各植物器官のRPKM(Reads per kilo base per million)を利用した相関解析により、ニガウリ由来のMcCBS遺伝子と同じ遺伝子共発現パターンを示すMcCYP81-6の遺伝子クローニングを行った。
McCYP81-6遺伝子機能解析に関しては、cucurubitadienol 生産酵母に導入して、質量分析機器分析を行った。LC-MS分析結果により、m/z=441[M+H]のcucurubitadienol の酸化物と思われる酵素反応生成物を検出した。現在、酵素反応生成物詳細な構造解析中である。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2012 2011

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Plant expressed sequence tags databases: practical uses and the improvement of their searches using network module analysis2011

    • Author(s)
      Ogata Yoshiyuki, Suzuki Hideyuki
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 28 Issue: 4 Pages: 351-360

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.11.0818a

    • NAID

      10029707208

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ウリ科植物の苦味配糖体サポニン生合成系酵素遺伝子群の機能解析2012

    • Author(s)
      鈴木秀幸
    • Organizer
      新学術領域研究 生合成マシナリー 第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2012-12-08
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Metabolomics-oriented molecular cloning and functional characterization of flavonoid 8-hydroxylase from Lotus japonicus2012

    • Author(s)
      Kota Kera, Norimoto Shimada, Tomoyoshi Akashi, Toshio Aoki, Tina Kanamori, Daisaku Ohta, Koh Aoki, Daisuke Shibata, Hideyuki Suzuki
    • Organizer
      International Conference of Natural Products Biosynthesis (ICNPB)
    • Place of Presentation
      Awaji Yumebutai
    • Year and Date
      2012-06-17
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] An expressed sequence tag (EST) data mining for triterpenoid saponin biosynthesis in Momordica charantia using next-generation sequencing2012

    • Author(s)
      Hideyuki Suzuki,Yoshiyuki Ogata, Tsutomu Hosouchi, Kota Kera, Norimoto Shimada, Yuuki Shirasaka, Daisuke Shibata, Tetsuo Kushiro
    • Organizer
      International Conference of Natural Products Biosynthesis (ICNPB)
    • Place of Presentation
      Awaji Yumebutai
    • Year and Date
      2012-06-17
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 大量に得られる次世代シークエンスデータを如何に効率的に生合成酵素遺伝子単離に活用できるのか?2011

    • Author(s)
      鈴木秀幸, 尾形善之
    • Organizer
      新学術領域「生合成マシナリー」第3回若手シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパスディジタルホール
    • Year and Date
      2011-12-26
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] ウリ科植物の苦味配糖体サポニン生合成系酵素遺伝子群の機能解析2011

    • Author(s)
      鈴木秀幸
    • Organizer
      新学術領域「生合成マシナリー」第3回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学大学院農学生命科学研究科・農学部フードサイエンス棟
    • Year and Date
      2011-12-03
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] ネットワーク解析を用いた(植物)生合成研究2011

    • Author(s)
      鈴木秀幸
    • Organizer
      新学術領域「生合成マシナリー」第2回若手シンポジウム
    • Place of Presentation
      理化学研究所鈴木梅太郎ホール
    • Year and Date
      2011-07-02
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] ウリ科植物の苦味配糖体サポニン生合成系酵素遺伝子群の機能解析2011

    • Author(s)
      鈴木秀幸
    • Organizer
      新学術領域「生合成マシナリー」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学大学院薬学系研究科薬学部大講堂
    • Year and Date
      2011-06-04
    • Related Report
      2011 Annual Research Report

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Published: 2011-04-06   Modified: 2018-03-28  

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