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蛍光色素を利用したイオンチャネルの開閉機構の可視化

Publicly Offered Research

Project AreaMutli-dimensional fluorescence live imaging of cellular function and molecular activity
Project/Area Number 23113519
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe Graduate School for the Creation of New Photonics Industries (2012)
The Institute of Physical and Chemical Research (2011)

Principal Investigator

平野 美奈子  光産業創成大学院大学, その他の研究科, 講師 (80585167)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥11,440,000 (Direct Cost: ¥8,800,000、Indirect Cost: ¥2,640,000)
Fiscal Year 2012: ¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Fiscal Year 2011: ¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Keywordsイオンチャネル / 1分子計測 / 蛍光色素 / 全反射顕微鏡
Outline of Annual Research Achievements

イオンチャネルの機能は、イオンの流れを電流として捉えることで、1分子レベルで詳細に測定できる。しかしながら、チャネルの構造に関する情報は構造解析などからの特定の状態でのスナップショットしかなく、機能しているチャネルの構造の遷移は未だ明らかではない。本研究では、チャネルの分子実体を理解するために、以前我々が開発した構造・機能同時計測装置を用いて、機能しているチャネルの構造状態を1分子レベルで計測し、その構造機能相関を明らかにすることを目的とし、以下の4つを行った。
1.蛍光色素を用いたKcsAチャネルの構造変化の検出. 以前多分子系でKcsAチャネルの開・閉状態を蛍光色素、テトラメチルローダミン(TMR)を用いて捉えることに成功した。今回、不活性化条件でも活性を示す開状態模倣変異体、E146Q、の構造状態を同様に調べた結果、E146Qの構造状態は野生型の開状態と異なるものであったことから、KcsAには中間状態が存在することが示唆された。
2.KcsAチャネルの1分子レベルでの構造変化の可視化. 以前多分子系でTMRを用いてKcsAチャネルの開閉を明らかにした標識部位で、今回1分子レベルでも固体支持膜に再構成したKcsAの開閉を蛍光のオン・オフとして明確に捉えることができた。
3. 同時計測系の改良. 最近、構造・機能同時計測装置に、新たなチャネル再構成法を組み込み、改良した。本研究では、事前にチャネルの疎水部を保護剤で保護することで、さらにチャネルの膜への組み込み効率を上げることに成功した。
4. 1分子、実時間でのKcsAチャネルの構造変化と機能変化の同時計測. 3.で改良した同時計測装置を用い、膜に再構成されたTMR標識KcsAチャネルの電気的・光学的計測を行った。その結果、チャネル活性が見られ、TMRの蛍光を輝点として捉えることができた。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2013 2012 2011

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Uncovering the Protein Translocon at the Chloroplast Inner Envelope Membrane2013

    • Author(s)
      Shingo Kikuchi
    • Journal Title

      SCIENCE

      Volume: 339 Issue: 6119 Pages: 571-574

    • DOI

      10.1126/science.1229262

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 「ちから」でイオンチャネルの機能を制御する2012

    • Author(s)
      井出 徹、平野 美奈子、奥野 大地
    • Journal Title

      生物物理学会誌

      Volume: 52(6) Pages: 289-290

    • NAID

      10031126103

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Journal Article] Channels formed by amphotericin B covalent dimers exhibit rectification2011

    • Author(s)
      M.Hirano, Y.Takeuchi, N.Matsumori, M.Murata, T.Ide
    • Journal Title

      J Membr Biol

      Volume: 240 Issue: 3 Pages: 159-164

    • DOI

      10.1007/s00232-011-9354-x

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Direct Manipulation of a Single Potassium Channel Gate with an Atomic Force Microscope Probe2011

    • Author(s)
      M.Kitta, T.Ide, M.Hirano, H.Tanaka, T.Yanagida, T.Kawai
    • Journal Title

      Small

      Volume: 7(16) Issue: 16 Pages: 2379-2383

    • DOI

      10.1002/smll.201002337

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The role of the KcsA channel cytoplasimic domain in pH-dependent gating2011

    • Author(s)
      M.Hirano, Y.Onishi, T.Yanagida, T.Ide
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 101(9) Issue: 9 Pages: 2157-2162

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2011.09.024

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] M. Hirano, Y. Onishi, D. Okuno, T. Ide2013

    • Author(s)
      The KcsA channel cytoplasmic domain effects on the inactivation gating
    • Organizer
      Biophysical Society 57th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      フィラデルフィア(アメリカ合衆国)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] M. Hirano, Y. Onishi, D. Okuno, T. Ide2012

    • Author(s)
      The KcsA channel cytoplasmic domain effects on the inactivation gating
    • Organizer
      Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions, The 6th International Symposium
    • Place of Presentation
      京都
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] The KcsA channel cytoplasmic domain effects on the inactivation gating2012

    • Author(s)
      M. Hirano, Y. Onishi, D. Okuno, T. Ide
    • Organizer
      第50回 日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Mechanism for opening and closing by the KcsA channel2011

    • Author(s)
      M.Hirano. Y.Onishi, T.Yanagida, T.Ide
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2011-09-18
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] The KcsA channel opening and closing mechanism2011

    • Author(s)
      Minako Hirano
    • Organizer
      QBiC Retreat 2011 : How to achieve "Whole Cell Modeling"
    • Place of Presentation
      ゆにとぴあ篠山(兵庫県)
    • Year and Date
      2011-09-10
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛍光色素を利用したイオンチャネルの開閉機構の可視化2011

    • Author(s)
      平野美奈子
    • Organizer
      新学術領域研究「細胞機能と分子活性の多次元蛍光生体イメージング」第1回研究代表者会議
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      2011-06-30
    • Related Report
      2011 Annual Research Report

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Published: 2011-04-06   Modified: 2018-03-28  

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