画像解析を用いた染色体間ドメイン構築ネットワークの解析
Publicly Offered Research
| Project Area | The physicochemical field for genetic activities |
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| Project/Area Number |
23114719
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
斉藤 典子 熊本大学, 発生医学研究所, 准教授 (40398235)
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| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2013-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2012)
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| Budget Amount *help |
¥10,660,000 (Direct Cost: ¥8,200,000、Indirect Cost: ¥2,460,000)
Fiscal Year 2012: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2011: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
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| Keywords | 細胞核内構造体 / エピジェネティクス / 核スペックル / RanBP2 / 核-細胞質間輸送 / SRタンパク質 / 選択的スプライシング / 組織幹細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
細胞核内は遺伝子の転写、複製、RNAのプロセッシングなど生命活動に重要な事象が複雑な制御を受けながら起こるため、高度に組織化され、染色体間領域には様々な核内構造体が存在する。本研究では、核内構造体のひとつである核スペックルの構築過程をモデルとして、核構造形成の意義を解明することを目的として、下記のように研究をすすめた。
1. 核内構造形成ネットワーク機構の解明
核-細胞質間輸送因子群を減弱した細胞では、pre-mRNAスプライシング因子を豊富に含む核内構造体、核スペックルの構築が不全となり、選択的スプライシングが特異的に変化する。核内構造形成ネットワークを調べるために、免疫染色を行った。その結果、この細胞では、核小体や核膜には変化がないものの、PMLボディー、カハールボディーの形成に影響があることを確認した。さらに、染色体ペインティング、ChIP法などの条件検討を行い、染色体構築への影響を調べる環境を整えた。
2. 核構造形態変化の定量・計測およびイメージインフォーマティクスの確立
siRNAライブラリーと組み合わせたセルベースドアッセイスクリーニングを行い、細胞核内構造体形成に関わる因子群のさらなる検索・同定を行った。多数の細胞画像を用いた細胞形態のハイスループット解析と、機械学習法を用いた形態変化の定量解析を行った。
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| Research Progress Status |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(23 results)
