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神経活動評価のための顕微鏡オートフォーカスと蛍光画像解析

Publicly Offered Research

Project AreaSystems molecular ethology to understand the operating principle of the nervous system
Project/Area Number 23115703
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

橋本 浩一  東北大学, 情報科学研究科, 教授 (80228410)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2012: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2011: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Keywordsビジュアルサーボ / 蛍光画像処理 / トラッキング顕微鏡 / オートフォーカス / オプトジェネティクス / 線虫 / ゼブラフィッシュ / 神経活動解析
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、生物が持つ「神経系の活動状態」とそのアウトプットとしての「行動」を高い時間・空間分解能で計測する装置を開発することである。生物の行動を理解するためには、それを作り出している神経系の複雑な情報処理過程を解明することが必要不可欠である。しかし、近年の行動遺伝学の進展にもかかわらず多段階の情報処理過程はいまだにほとんど明らかにされていない。その最も大きな原因は、観察倍率と視野サイズがトレードオフの関係にあり、運動する生物を高い空間分解能で長時間観察することができないことにある。そこで本研究では、「顕微鏡画像のフィードバックにより顕微鏡ステージを制御して生物の行動を追跡する」という、本質的な解決策により、高い時間分解能を保ったまま神経活動を長時間記録・解析可能なシステムを開発する。
とくに、モデル生物として盛んに研究されている線虫(C. elegans)やゼブラフィッシュ(Danio rerio)の神経部位を明視野像と蛍光像を用いてリアルタイム追跡し、同時に神経細胞の蛍光像を定量計測できる顕微鏡の実現を目指す。
本年度は、線虫の変形やZ軸方向のズレにロバストな画像処理アルゴリズムとその高速化手法の開発、高精度な三次元追跡システムの実現、神経細胞レベルで光刺激可能な光学プロジェクタシステムの実現、1600fps超高速カメラを用いたゼブラフィッシュトラッキングシステムの実現などを実施した。
これらの成果は、埼玉大学中井教授、大阪大学木村准教授、名古屋大学森教授、東京大学飯野教授などの研究室に導入され、今年度はシステムハードウェア・ソフトウェアの改良を行いつつ、いくつかの重要な共同研究成果を発表するに至った。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Estimating Deformation of Neurons in Fluorescent Images2012

    • Author(s)
      Fei, X., Teramoto, T., Ishihara, T. and Hashimoto, K.
    • Journal Title

      Interdisciplinary Information Sciences

      Volume: 18 Issue: 2 Pages: 113-122

    • DOI

      10.4036/iis.2012.113

    • NAID

      130002531672

    • ISSN
      1340-9050, 1347-6157
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GPU Acceleration in a Visual Servo System2012

    • Author(s)
      Chuantao Zang, Koichi Hashimoto
    • Journal Title

      Journal of Robotics and Mechatronics

      Volume: 24 Pages: 105-114

    • NAID

      110009957683

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fast Sensor Scheduling for Spatially Distributed Sensors2011

    • Author(s)
      Arai, S., Iwatani Y. and Hashimoto, K.
    • Journal Title

      IEEE Transactions on Automatic Control

      Volume: 56(8) Issue: 8 Pages: 1900-1905

    • DOI

      10.1109/tac.2011.2141450

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞の個体差に適応する高速オートフォーカス顕微鏡2011

    • Author(s)
      小原健、五十嵐康伸、橋本浩一
    • Journal Title

      計測自動制御学会論文集

      Volume: 47 Pages: 31-39

    • NAID

      10027787549

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Exploration of brain function through behavior, neural activity observation, and optogenetic manipulation2012

    • Author(s)
      Hashimoto, K., and Xianfeng Fei
    • Organizer
      2012 International Symposium on Optomechatronic Technologies (ISOT)
    • Place of Presentation
      Paris, France
    • Year and Date
      2012-10-29
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Neurite fluorescence imaging of freely moving individual C. elegans animals with high-speed tracking and autofocus system2012

    • Author(s)
      Genta Yokoyama, Yuki Tsukada, Chen Min, Koichi Hashimoto, Ikue Mori
    • Organizer
      5th East Asia C. elegans Meeting
    • Place of Presentation
      Taipei, Taiwan
    • Year and Date
      2012-06-27
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] High-speed tracking system for neurite fluorescence imaging during freely moving C. elegans2012

    • Author(s)
      Yuki Tsukada, Chen Min, Genta Yokoyama, Koichiro Hashimoto, Ikue Mori
    • Organizer
      EMBO Conference Series: C. elegans Neurobiology
    • Place of Presentation
      Heidelberg, Germany
    • Year and Date
      2012-06-14
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] A virtual reality running machine for worms - a highly integrated tracking system for olfactory behavior2012

    • Author(s)
      Yuki Tanimoto, Akiko Yamazoe, Koichiro Hashimoto, Kotaro Kimura
    • Organizer
      EMBO Conference Series: C. elegans Neurobiology
    • Place of Presentation
      Heidelberg, Germany
    • Year and Date
      2012-06-14
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Visual Servo Microscope for Locking on Single Neuron of a Worm2011

    • Author(s)
      Mitsunori Maru, Min Chen, Koichi Hashimoto
    • Organizer
      IEEE Int.Conf.Robotics and Biomimetics
    • Place of Presentation
      Thailand
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Remarks] ロックオントラッキング顕微鏡

    • URL

      http://www.ic.is.tohoku.ac.jp/ja/sysbio/

    • Related Report
      2012 Annual Research Report

URL: 

Published: 2011-04-06   Modified: 2018-03-28  

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