Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
本研究課題では、B リンパ球分化のエピジェネティクス制御の分子機構を解明する。具体的には、B リンパ球分化を担う主要分化制御因子である Pax5 のエピジェネティックな遺伝子発現制御機構の解明を目指し、iChIP 法を利用することで、Pax5 遺伝子プロモーター領域に存在する分子、特に DNA および蛋白質の網羅的同定を行う。同定した分子については、分子生物学的手法を用いて、その機能を解明する。Pax5 遺伝子転写開始点近傍に LexA 結合配列が挿入された DT40 細胞に、タグを付けた LexA DNA 結合ドメイン (3xFNLDD) を恒常的に発現させた細胞株 (DT40/LexA-Pax5/3xFNLDD: DLPF) および、陰性対象として、同程度の3xFNLDDを発現しているが LexA 結合配列を持たない DT40 細胞株 (DT40/3xFNLDD: DF) を用いて、以下の実験を行った。(1) Pax5 遺伝子プロモーター領域に相互作用しているゲノム領域の同定:DLPF 細胞および DF 細胞を用い、iChIP 法と次世代シーケンスを組み合わせることで、Pax5 遺伝子プロモーター領域に相互作用しているエンハンサー等のゲノム領域の同定を試みた。その結果、Pax5 遺伝子プロモーター領域と相互作用しているゲノム領域の同定に成功した。(2) Pax5 遺伝子プロモーター領域に相互作用している蛋白質の同定:DLPF 細胞および DF 細胞を用い、iChIP 法と質量分析法を組み合わせることで、 Pax5 遺伝子プロモーター領域に相互作用している蛋白質の同定を試みた。その結果、Pax5 遺伝子プロモーター領域に結合する蛋白質の同定に成功した。同定した蛋白質の1つについて Pax5 遺伝子発現への作用について調べた結果、転写活性化に必要であることが判明した。
24年度が最終年度であるため、記入しない。
All 2013 2012 2011 Other
All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (4 results) Remarks (2 results)
ISRN Biochem.
Volume: 2013 Pages: 913273-913273
10.1155/2013/913273
Mol. Biol. Rep.
Volume: 39 Issue: 10 Pages: 9613-9619
10.1007/s11033-012-1825-3
Adv. Biosci. Biotechnol.
Volume: 3 Issue: 05 Pages: 626-629
10.4236/abb.2012.35081
PLoS ONE
Volume: 6 Issue: 10 Pages: e26109-e26109
10.1371/journal.pone.0026109
http://www.biken.osaka-u.ac.jp/lab/microimm/fujii/top/index.html
http://www.biken.osaka-u.ac.jp/lab/microimm/fujii/index.html