• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

新規一分子FRET計測技術によるABCトランスポーターのATP加水分解機構の解析

Publicly Offered Research

Project AreaWater plays a key role in ATP hydrolysis and ATP-driven functions of proteins
Project/Area Number 23118702
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Complex systems
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

七谷 圭  東北大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (00547333)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2012: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2011: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
KeywordsABCトランスポーター / ATP加水分解 / コンフォメーション変化 / FRET / 蛍光一分子観察 / 一分子FRET / リポソーム
Research Abstract

ABCトランスポーターのATP加水分解とエネルギー変換のメカニズムについて、様々な生化学的手法、結晶学的手法を用いて解析が行われてきたが、その全容は未だ解明されていない。本研究では、ATP加水分解反応メカニズムの解明をめざし研究を推進した。
1.FRETによるATP加水分解メカニズムの解析:任意のアミノ酸残基をCys残基に置換したSingle Cysteine変異体を作製した。導入したCys残基をAlexa532で修飾し、ATP有・無の条件下で自作の高感度蛍光分光光度計を用いて蛍光強度の変化を観察し、ATP存在下で優位な蛍光強度の増強が観察された。さらに、AMP-PNP, ATP-γS, ADP-ViなどのATPアナログを用いて、ATP加水分解の各ステップにおける蛍光強度の変化を観察した。その結果、蛍光強度がATPの加水分解の各ステップで変化し、ATPの結合と加水分解により誘発されるABCトランスポーターの構造変化を示していることが明らかとなった。
2.一分子蛍光観察装置による解析:Alexa532で修飾したABCトランスポーターを一分子蛍光観察装置に流し、ATP有・無において、一分子蛍光強度の時系列データを取得した。一分子蛍光強度分布から、ATPの添加により50-100 a.u. 程度の強光側へのピークのシフトが観察された。また、LES (Local equilibrium state) 解析から、複数の構造状態が存在することが示唆された。
3.昆虫細胞由来無細胞蛋白質合成系を用いた非天然アミノ酸導入による2色導入法の開発:ABCトランスポーターのダイナミックな構造変化の観察には、2色の蛍光色素を導入し2光子間でのFRETの観察が必要である。そこで、昆虫細胞由来の無細胞蛋白質合成系を用いてアンバーコドンと4塩基コドンを用いた非天然アミノ酸導入系による2色導入法を開発した。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2014 2013 2011 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Defining membrane spanning domains and crucial membrane-localized acidic amino acid residues for K+ transport of a Kup/HAK/KT-type Escherichia coli potassium transporter2014

    • Author(s)
      Yoko Sato, Kei Nanatani,Shin Hamamoto, Makoto Shimizu, Miho Takahashi, Mayumi Tabuchi-Kobayashi, Akifumi Mizutani, Julian I. Schroeder, Satoshi Souma and Nobuyuki Uozumi
    • Journal Title

      J. Biochem.

      Volume: 印刷中

    • NAID

      40020056344

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] GxxxG motif of transmembrane region 3 (TM3) is critical for the function of bacterial L-Aspartate : Alanine Antiporter AspT2013

    • Author(s)
      鈴木聡美、木村拓哉、笹原綾子、七谷圭、阿部敬悦
    • Organizer
      第8回トランスポーター研究会
    • Place of Presentation
      熊本市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 昆虫培養細胞由来無細胞蛋白質合成システムを用いた膜蛋白質の合成2013

    • Author(s)
      江連徹、七谷圭、鈴木聡美、佐藤陽子、相澤圭師、相馬聡、阿部敬悦、内海俊彦、安藤英治、魚住信之
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Functional analysis of the amino acid residues in the transmembrane domain (TM3) of the L-Aspartate : L-Alanine Antiporter AspT-Functional analysis of the amino acid exchanger AspT2013

    • Author(s)
      鈴木聡美、木村拓哉、笹原綾子、七谷圭、阿部敬悦
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 昆虫培養細胞由来無細胞系を用いた膜蛋白質の合成と機能解析2013

    • Author(s)
      七谷圭、江連徹、佐藤陽子、相澤圭師、相馬聡、安藤英治、魚住信之
    • Organizer
      第65回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      広島市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 産業細菌由来 L-Aspartate : L-Alanine 交換輸送体 AspT の基質輸送における機能解析2013

    • Author(s)
      鈴木聡美、木村拓哉、笹原綾子、七谷圭、阿部敬悦
    • Organizer
      第65回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      広島市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Use of an insect cell-free translation and translocation system for membrane proteins production2013

    • Author(s)
      相馬聡、江連徹、七谷圭、佐藤陽子、相澤圭師、安藤英治、魚住信之
    • Organizer
      平成25年度化学系学協会東北大会
    • Place of Presentation
      仙台市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Studies of Transport Mechanism of The Bacterial Aspartate : Alanine Antiporter (AspT) -Functional Analysis of The Amino Acid Residues in The Transmembrane Domain 3 (TM3) of AspT2013

    • Author(s)
      鈴木聡美、木村拓哉、笹原綾子、七谷圭、阿部敬悦
    • Organizer
      Tenth International Conference on Flow Dynamics
    • Place of Presentation
      仙台市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Cell-free membrane protein synthesis using insect cell-free system for functional studies2013

    • Author(s)
      Kei Nanatani, Toru Ezure, Satoshi Souma, Yoko Sato, Keishi Aizawa, Eiji Ando, Nobuyuki Uozumi
    • Organizer
      The Gordon Research Conference
    • Place of Presentation
      Ventura, CA, USA
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] ABCトランスポーターのATP加水分解機構2013

    • Author(s)
      小池悠斗、七谷圭、高橋聡、鎌形清人、魚住信之
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度大会
    • Place of Presentation
      川崎市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 一分子FRETを用いたABCトランスポーターの動的構造変化観察システムの開発2011

    • Author(s)
      七谷圭、鎌形清人、高橋聡、魚住信之
    • Organizer
      第6回トランスポーター研究会年会
    • Place of Presentation
      仙台市
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-Molecule Dynamics of MsbA, a member of ABC transporter2011

    • Author(s)
      中野駿介、七谷圭、鎌形清人、魚住信之、高橋聡
    • Organizer
      グローバルCOEサマースクールシンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台市
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 産業微生物由来生体膜輸送体の作動機構と産業応用

    • Author(s)
      七谷圭
    • Organizer
      ioJapan2013 発酵と代謝研究奨励賞受賞講演
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 大腸菌トランスポーターMsbAの一分子計測

    • Author(s)
      中野駿介、七谷圭、鎌形清人、魚住信之、高橋聡
    • Organizer
      第37回日本生体エネルギー研究会シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都市
    • Related Report
      2011 Annual Research Report

URL: 

Published: 2011-04-06   Modified: 2019-07-29  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi