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環境感覚である葉緑体チラコイド膜の形成機構解明をめざしたモルフォローム解析の提案

Publicly Offered Research

Project AreaEnvironmental sensing of plants: Signal perception, processing and cellular responses
Project/Area Number 23120526
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionJapan Women's University

Principal Investigator

永田 典子  日本女子大学, 理学部, 准教授 (40311352)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Fiscal Year 2012: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2011: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Keywords電子顕微鏡 / 葉緑体 / オミクス / シロイヌナズナ / 突然変異体 / 網羅的解析 / アルビノ
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、透過電子顕微鏡を用いて葉緑体形態を網羅的に構造観察すること、すなわち電顕による形態・構造のオミクス解析を行った。
(1) シロイヌナズナ葉緑体突然変異体の網羅的な電子顕微鏡観察
葉緑体タンパク質をコードする核遺伝子1,105遺伝子分のタグラインを収集したところ、アルビノ・ペールグリーン・斑入りといった葉の色に変化が見られる変異体は73遺伝子分見つかった。それら73変異体について、色素体の透過電子顕微鏡観察を行った。色素体内部の異常構造は11クラスに分類でき、構造の特徴には共通の機能的傾向が見られた。また、外見からだけでは分からない新規の異常構造も見つかり、変異体のスクリーニング法として電顕が有用であることも示された。これらの色素体画像は、他の変異体情報と合わせて、データベースChloroplast Function Database II(http://rarge.psc.riken.jp/chloroplast/)上で検索・閲覧することが可能となった。
(2) 広域高解像度の電子顕微鏡画像の取得
外部PCから電顕をプログラム制御し電子ビーム方向と試料位置の制御を組み合わせることで、広域の電顕画像を全自動で撮影することに成功した。また、画像認識プログラムにより糊しろ部分を張り合わせることで、大量の画像を全自動で結合することにも成功した。例えば、3,600枚から成るシロイヌナズナ茎頂画像は、撮影時間3時間半、結合時間10時間弱で取得できた。これまでに、最大37,881枚から成り、面積にして約600μm四方の領域をカバーする1枚画像を取得することができた。このように、細胞や組織全体に渡る広域高解像度の電子顕微鏡画像を取得し、葉緑体の構造変化等を統計学的及び総括的に処理できるようになった。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (17 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The Chloroplast Function Database II : a comprehensive collection of homozygous mutants and their phenotypic/genotypic traits for nuclear-encoded chloroplast proteins2013

    • Author(s)
      Myouga F, Akiyama K, Tomonaga Y, Kato A, Sato Y, Kobayashi M, Nagata N, Sakurai T, Shinozaki K
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol

      Volume: 54: e2 Issue: 2 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs171

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  • [Journal Article] Arabidopsis mitochondrial protein TIM50 affects hypocotyl cell elongation through intracellular ATP level2012

    • Author(s)
      Shailesh Kumar
    • Journal Title

      Plant Science

      Volume: 183 Pages: 212-217

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  • [Presentation] シロイヌナズナ葉緑体突然変異体のデータベース構築に向けた網羅的な透過電子顕微鏡解析2013

    • Author(s)
      加藤綾、明賀史純、秋山顕治、佐藤由佳、小林恵、櫻井哲也、篠崎一雄、永田典子
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第69回学術講演会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク・大阪
    • Year and Date
      2013-05-20
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    • Author(s)
      佐藤繭子、朽名夏麿、澤木史江、若崎眞由美、桧垣匠、吉田拓弘、櫻井哲也、馳澤盛一郎、持田恵一、永田典子、豊岡公徳
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山大、岡山
    • Year and Date
      2013-03-21
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      明賀史純、秋山顕治、朝長優美、加藤綾、佐藤由佳、小林恵、永田典子、櫻井哲也、篠崎一雄
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山大、岡山
    • Year and Date
      2013-03-21
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      澤木史江,小林恵, 佐藤繭子, 朽名夏麿, 桧垣匠, 馳澤盛一郎, 豊岡公徳, 永田典子
    • Organizer
      第37回日本顕微鏡学会関東支部講演会
    • Place of Presentation
      東大・東京
    • Year and Date
      2013-03-06
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      佐藤由佳,藤原誠,明賀史純,吉田茂男,篠崎一雄,本橋令子,永田典子
    • Organizer
      第37回日本顕微鏡学会関東支部講演会
    • Place of Presentation
      東大・東京
    • Year and Date
      2013-03-06
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  • [Presentation] 透過電子顕微鏡における広域高解像度画像取得法の開発とその応用2012

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      澤木 史江, 小林 恵, 佐藤 繭子, 朽名 夏麿, 桧垣 匠, 馳澤 盛一郎, 豊岡 公徳, 永田 典子
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学・兵庫
    • Year and Date
      2012-09-15
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      豊岡公徳、若崎眞由美、朽名夏麿、桧垣匠、永田典子、松岡健、持田恵一、佐藤繭子
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第67回学術講演会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2012-05-14
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      佐藤由佳、小林恵、澤木史江、藤原誠、明賀史純、吉田茂男、篠崎一雄、本橋令子、永田典子
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      日本顕微鏡学会第67回学術講演会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2012-05-14
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    • Author(s)
      M Kobayashi
    • Organizer
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      K Toyooka
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      The 1st International Symposium on Plant Environ mental Sensing
    • Place of Presentation
      Todaiji Culture Center, Nara, Japan
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  • [Presentation] シロイヌナズナ斑入り突然変異体における色素体分布の時空間的解析2011

    • Author(s)
      佐藤由佳
    • Organizer
      日本植物形態学会第23回大会
    • Place of Presentation
      東京・日本女子大
    • Year and Date
      2011-09-16
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    • Author(s)
      秋田佳恵
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学・京都
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 生体顕微マルチスケーリングマッピング:小胞クラスターの分布と超微形態2011

    • Author(s)
      豊岡公徳
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学・京都
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      2011 Annual Research Report
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      Takashi Ito
    • Organizer
      8^<th> Solanaceaeand 2^<nd> Cucubitaceae Joint Conference 2011
    • Place of Presentation
      Kobe Convention Center
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization and utilization of novel functional traits of Capsicum genetic resources conserved in Kihara Institute for Biological Reresearch2011

    • Author(s)
      Kohei Ishii
    • Organizer
      8^<th> Solanaceaeand 2^<nd> Cucubitaceae Joint Conference 2011
    • Place of Presentation
      Kobe Convention Center
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    • Author(s)
      Kenta Shirasawa
    • Organizer
      8^<th> Solanaceaeand 2^<nd> Cucubitaceae Joint Conference 2011
    • Place of Presentation
      Kobe Convention Center
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 斑入り突然変異体thflにおける異常色素体分布の時空間的解析2011

    • Author(s)
      佐藤由佳
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京・東大
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      2011 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://mcm-www.jwu.ac.jp/~n-nagata/

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      2011 Annual Research Report

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Published: 2011-04-06   Modified: 2018-03-28  

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