Publicly Offered Research
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
急性骨髄性白血病の原因の1つに， AML1-MTG8 融合タンパク質の発現がある．この融合タンパク質は DNA 結合ドメインである Runt ドメインをもつ．この Runt に対して標的 DNA より強く結合するRNA アプタマー（Apt1とApt2）が埼玉県立がんセンターの神津博士らによって作成された．Apt1とApt2は，両者ともSELEXで得られた共通配列を持つが，他の部分については配列も二次構造も異なる．本研究では，これらのアプタマーと Runt ドメインの相互作用を NMR 法および変異体を用いて解析し，そのメカニズムを明らかにすることを目的とした．Runt と DNA の複合体について，永田らのNMR 解析結果をもとに138 残基中102 残基の主鎖NH に由来するシグナルを帰属した．次に Runt/DNAと Runt/Apt1およびRunt/Apt2の複合体の1H-15N HSQC スペクトルを比較した．さらに，シグナルが消失あるいは大きくシフトしたアミノ酸残基を立体構造上にマッピングし，X 線結晶構造解析により明らかにされているDNA の結合部位と比較した．Apt1およびApt2の結合により，C 末端の近傍のDNA 結合部位と同じ領域に化学シフトの変化がみられた．アプタマーの共通配列とDNA の構造が似ていることから，これらのアプタマーは DNA と同様に Runt のC 末端近傍に結合していると考えられる．一方，Apt1およびApt2の結合により，それぞれDNA 結合部位と異なる部位にNMRシグナルの変化がみられた．シグナルが変かしたアミノ酸残基に変異を導入したところ，結合活性が低下した．Apt1およびApt2はDNA よりRunt と広い範囲で相互作用して，Runtドメインに結合している可能性が考えられる．
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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RNA
Volume: 19
