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哺乳類MHC領域の多型の進化

Publicly Offered Research

Project AreaHLA polymorphism, disease and evolution
Project/Area Number 23133503
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

野中 勝  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (40115259)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2013-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Fiscal Year 2012: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2011: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
KeywordsPSMB8 / 免疫プロテアソーム / 二型性 / MHC / プロテアソーム / クラスI抗原提示 / 平衡淘汰 / 多型性 / 有袋類 / 単孔類
Outline of Annual Research Achievements

免疫プロテアソームのプロテアーゼ活性を有するサブユニットの一つをコードするPSMB8遺伝子は、多くの顎口類において切断特異性を決定すると考えられる31番目の残基がアラニンのA型と、フェニルアラニンのF型の二種類のアレルが知られている。ところがこれまでに知られている真獣類のPSMB8は全てA型であり、当研究では有袋類、単孔類を調べることにより、哺乳類の進化過程のどの段階でF型の消失が生じたかを明らかにすることを目標にした。昨年は有袋類のワラビー、オポッサムおよび単孔類のカモノハシを解析し、A型しか存在しないと言う結果を得た。今年度は有袋類のタスマニアデビル、ウォンバット、コアラ、クァッカワラビー、セスジキノボリカンガルー、リングテイル、ハリモグラを解析した。オーストラリアの研究者から提供された、各種1から数個体の血球よりDNAを抽出し、PSMB8の様々なエクソン上に設計したuniversal primerを用いてPCRを行い、direct sequencingにより31番目のアミノ酸を推定することによりタイピングした。PCRでバンドが検出できなかったハリモグラを除く全ての種でPSMB8遺伝子の配列を得ることができたが、全てA型であった。半数以上の個体でイントロンに多型を検出することができ、両方のアリルともにA型であることが確認できた。以上より、F型の喪失は哺乳類の共通祖先で生じたと結論した。また、有袋類、単孔類のいくつかの種において、PSMB8とクラスI遺伝子の緊密な連鎖がたもたれていることから、真獣類に見られる両者の連鎖の喪失は、PSMB8遺伝子の二型の喪失にはるかに遅れて生じたことが明らかになった。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2012 2011

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Highly divergent dimorphic alleles of the proteasome subunit beta type-8 (PSMB8) gene of the bichir Polypterus senegalus : implication for evolution of the PSMB8 gene of jawed vertebrates2012

    • Author(s)
      Fujito NT, Nonaka M
    • Journal Title

      Immunogenetics

      Volume: (in press) Issue: 6 Pages: 447-453

    • DOI

      10.1007/s00251-012-0602-8

    • Related Report
      2012 Annual Research Report 2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Long-lived dichotomous lineages of the proteasome subunit beta type 8 (PSMB8) gene surviving more than 500 million years as alleles or paralogs2012

    • Author(s)
      Tsukamoto, K.
    • Journal Title

      Mol. Biol. Evol.

      Volume: 29 Issue: 10 Pages: 3071-3079

    • DOI

      10.1093/molbev/mss113

    • Related Report
      2012 Annual Research Report 2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A population genetic study on the relationship between medaka fish and wet-rice-cultivation spreads over the Japanese archipelago2012

    • Author(s)
      Katsumura, T.
    • Journal Title

      Anthropol. Sci.

      Volume: 120 Pages: 81-89

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Retained orthologous relationships of the MHC class I genes during euteleost evolution2011

    • Author(s)
      Nonaka, et al
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 28 Pages: 3099-3112

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] The evolution of The Proteasome Subunit Beta Type 8 (PSMB8) Gene in Non-eutherian Mammals2012

    • Author(s)
      Ming-Hsuan Yu
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      マリンメッセ福岡(福岡)
    • Year and Date
      2012-12-11
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 鱗移植片の急性拒絶反応に関わるメダカMHC遺伝子の同定2012

    • Author(s)
      坂内英美
    • Organizer
      第21回日本組織適合性学会大会
    • Place of Presentation
      明治大学駿河台キャンパス(東京)
    • Year and Date
      2012-09-15
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] フグ目におけるPSMB8遺伝子の二型性の進化2012

    • Author(s)
      源島裕祐
    • Organizer
      日本進化学会第14回東京大会
    • Place of Presentation
      首都大学東京(東京)
    • Year and Date
      2012-08-21
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Long-term trans-species dimorphism of the PSMB8 gene in the actinopterygian MHC region2012

    • Author(s)
      藤戸尚子
    • Organizer
      The 12th international congress of International Society of Developmental and Comparative Immunology
    • Place of Presentation
      ヒルトン福岡シーホーク(福岡)
    • Year and Date
      2012-07-09
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Recurrent revival of dimorphism of the PSMB8 gene during tetrapod evolution2012

    • Author(s)
      Ching-Huei Huang
    • Organizer
      The 12th international congress of International Society of Developmental and Comparative Immunology
    • Place of Presentation
      ヒルトン福岡シーホーク(福岡)
    • Year and Date
      2012-07-09
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Long-term Transspecies Dimorphism of the PSMB8 gene in Actinopterygii2011

    • Author(s)
      藤戸尚子
    • Organizer
      Society for Molecular Biology and Evolution
    • Place of Presentation
      京都大学(京都)
    • Year and Date
      2011-07-28
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Recurrent Revival of Dimorphism of the PSMB8 Gene During Tetrapod Evolution2011

    • Author(s)
      Ching-Huei Huang
    • Organizer
      Society for Molecular Biology and Evolution
    • Place of Presentation
      京都大学(京都)
    • Year and Date
      2011-07-28
    • Related Report
      2011 Annual Research Report

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Published: 2011-04-06   Modified: 2018-03-28  

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