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Volumetric fluorescence imaging with an ultra-large field-of-view

Publicly Offered Research

Project AreaComprehensive understanding of scattering and fluctuated fields and science of clairvoyance
Project/Area Number 23H04135
Research Category

Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Transformative Research Areas, Section (II)
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

市村 垂生  大阪大学, 先導的学際研究機構, 特任准教授(常勤) (50600748)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2024: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Keywordsバイオイメージング / 蛍光顕微鏡 / 三次元 / 光学 / 蛍光イメージング
Outline of Research at the Start

近年の生命科学における多細胞システム研究では、システム全体の動作と個々の細胞の動作を同時に捉えるために、光学イメージングの大視野化が重要な技術の一つとなっている。従来の生物顕微鏡はレンズの性能、筐体の構造、イメージセンサーの画素数などの制限により、必ずしもその需要に応えられていなかった。申請者は、センチメーターを越える視野全域を1細胞分解能で観察できるイメージング系を開発してきた。このイメージング系を応用展開するために、本研究では、個体や組織などの散乱体内部を細胞観察可能な三次元分解能を実現する新規基盤技術を開発することを目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

近年の生命科学における多細胞システム研究では、システム全体の動作と個々の細胞の動作を同時に捉えるために、光学イメージングの大視野化が重要な技術の一つとなっている。従来の生物顕微鏡はレンズの性能、筐体の構造、イメージセンサーの画素数などの制限により、必ずしもその需要に応えられていなかった。本研究では、研究代表者がこれまでに開発してきた、センチメーターを越える視野全域を1細胞分解能で観察できるイメージング系を基軸として、個体や組織などの散乱体内部を三次元イメージングを実現することを目指す。初年度は、下記の2つの要素技術開発課題を実施した。
(1)多点共焦点ディスクの設計
多点共焦点イメージングのためのピンホールディスクアレイを試作し、共焦点イメージング系を構築し、その深さ選択性を蛍光ビーズによって実証した。共焦点ディスクの透過率を上げるために、ピンホール径とピンホール間隔を変更したピンホールアレイを試作し、光学性能を調べた。高い透過率が必要な場合にピンホール径6um、ピンホール間隔18umのピンホールアレイが有効であることが分かった。
(2)励起光量の向上
現状のピンホールアレイディスクでは、励起光の多くがピンホールアレイのピンホールのない場所で反射されてしまうため、光の利用効率が数%に留まる。そこで、複数のレーザー光源を液体ライトガイドで結合する手法を提案した。これにより、従来よりも数倍の明るさで試料を照明できるようになった。
以上の2つの要素技術開発によって、従来よりも5倍程度の明るいイメージングを実現した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画どおりに研究が進捗している。

Strategy for Future Research Activity

2年度は、これまでの要素技術開発を更に進めながら、並行して、モデル生物の胚発生における三次元タイムラプスイメージングに応用を進める。マウス、鳥類、魚類のモデル生物の観察を予定する。

Report

(1 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2024 2023

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Volumetric trans-scale imaging of massive quantity of heterogeneous cell populations in centimeter-wide tissue and embryo2024

    • Author(s)
      Ichimura Taro、Kakizuka Taishi、Sato Yuki、Itano Keiko、Seiriki Kaoru、Hashimoto Hitoshi、Itoga Hiroya、Onami Shuichi、Nagai Takeharu
    • Journal Title

      eLife

      Volume: -

    • DOI

      10.7554/elife.93633.1

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Strength in numbers: Unleashing the potential of trans-scale scope AMATERAS for massive cell quantification2024

    • Author(s)
      Ichimura Taro、Kakizuka Taishi、Sato Yuki、Fujioka Yoichiro、Ohba Yusuke、Horikawa Kazuki、Nagai Takeharu
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 21 Issue: Supplemental Pages: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v21.s017

    • ISSN
      2189-4779
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 細胞画像ビッグデータによるバイオDX2023

    • Author(s)
      市村垂生, 糸賀裕弥, 垣塚太志, 大浪修一, 永井健治
    • Journal Title

      光アライアンス

      Volume: 34 Pages: 48-52

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Volumetric trans-scale imaging of massive quantity of heterogeneous cell populations in centimeter-wide tissue and embryo2023

    • Author(s)
      Ichimura Taro、Kakizuka Taishi、Sato YuKi、Itano Keiko、Seiriki Kaoru、Hashimoto Hitoshi、Itoga Hiroya、Onami Shuichi、Nagai Takeharu
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2023.08.21.553997

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] センチメートルスケールの多細胞集団内のミクロ現象を捉えるトランススケールスコープ2023

    • Author(s)
      市村垂生, 垣塚太志, 橋本均, 永井健治
    • Journal Title

      光学

      Volume: 52 Pages: 322-331

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] 巨大データを生み出すトランススケールスコープとその取扱いを可能にする情報プラットフォーム2023

    • Author(s)
      市村垂生, 糸賀裕弥, 垣塚太志, 大浪修一, 永井健治
    • Journal Title

      光技術コンタクト

      Volume: 61 Pages: 43-51

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Trans-scale scope for volumetric imaging of micrometer-scale cellular dynamics in centimeter-scale multicellular systems2023

    • Author(s)
      Taro Ichimura, T. Kakizuka, K. Itano, K. Seiriki, H. Hashimoto, Y. Sato, T. Nagai
    • Organizer
      The 20th International Microscopy Congress (IMC20)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Three-dimensional imaging of micrometer-scale cellular dynamics in centimeter-scale multicellular systems2023

    • Author(s)
      Taro Ichimura
    • Organizer
      EMBO Satellite Meeting “New Approaches for the Properties of Bio-materials”
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 大視野細胞イメージング法と生命科学への応用展開2023

    • Author(s)
      市村垂生
    • Organizer
      第17回日本分子イメージング学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited

URL: 

Published: 2023-04-13   Modified: 2024-12-25  

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