Genome instability induced by spatial positions in the nucleus

• Project Area: Genome modality: understanding physical properties of the genome
• Project/Area Number: 23H04274
• Research Category: Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Transformative Research Areas, Section (III)
• Research Institution: Kyoto University (2024); The University of Tokyo (2023)
• Principal Investigator: 安原 崇哲 京都大学, 生命科学研究科, 教授 (90757056)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥13,000,000 (Direct Cost: ¥10,000,000、Indirect Cost: ¥3,000,000); Fiscal Year 2024: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000); Fiscal Year 2023: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
• Keywords: ゲノム脆弱部位 / 核内位置空間 / マッピング法

Outline of Research at the Start

我々のゲノムに生じる異常は疾患を発生させる。広大なゲノムの中で異常が生じやすい部分、つまり脆弱部位が存在することは知られていたが、核内での位置空間情報がゲノム脆弱性に与える影響は不明である。これは、過去の研究において1次元ゲノム配列へのマッピング情報だけの解析にとどまり、位置空間情報が欠落していたことが原因と考えられる。従って当研究では、核内での位置空間情報とDNA損傷を同時にマッピングする手法の開発を目指し、核内位置空間によって変化するゲノム脆弱性の解析を通してメゾスケールのゲノム構造とゲノム脆弱性の関係性の解明を目指す。