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ビーズテクノロジーを用いた脂質結合タンパク質の網羅的解析

Publicly Offered Research

Project AreaChemical Biology using bioactive natural products as specific ligands: identification of molecular targets and regulation of bioactivity
Project/Area Number 24102517
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

松森 信明  大阪大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (50314357)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
Fiscal Year 2013: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2012: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Keywordsスフィンゴミエリン / 脂質ラフト / 膜タンパク質 / ビーズテクノロジー / ケミカルバイオロジー / 生体膜
Research Abstract

近年脂質ラフトが注目を集めている。この脂質ラフトにはシグナル伝達に関与する膜タンパク質が集積するとされているが、実際にどのタンパク質がラフトに集積しているのかについての報告は多くなく、さらには脂質分子と膜タンパク質間の相互作用についは不明な点が多い。そこで本研究では、ビーズ上にラフトなどの脂質膜表面を再現し、脂質膜に結合する膜表在性タンパク質を網羅的にプロテオーム解析することを目的とした。
ラフト構成脂質であるスフィンゴミエリンと、通常のリン脂質について、アルキル鎖末端をアミノ化した誘導体を調製し、これらを半田ビーズ上にアミド結合を介して固定化した。その際、固体化法を工夫することで90%程度の高い固定化率を達成した。次に、これらのビーズに対して、マウス脳可溶化液を混合し、脂質に特異的に結合するタンパク質を回収した。その結果、スフィンゴミエリンに特異的に結合した2種類のタンパクを回収し、質量分析によってそれらを同定した。さらに、これらのタンパク質について、スフィンゴミエリンとの結合性を確認する実験を行い、そのうち1種類についてはスフィンゴミエリン特異性が高いことが明らかとなった。このタンパク質は、神経伝達物質の放出の際に重要な働きをしている1回膜貫通型の膜タンパク質であるが、脂質ラフトとの関連についてはこれまで報告がない。したがって、今回の結果は、脂質ラフトが神経伝達にも関与している可能性を示唆している。今後、このタンパク質とラフトとの関連についてさらに詳細に検討していく。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Detailed Comparison of Deuterium Quadrupole Profiles between Sphingomyelin and Phosphatidylcholine Bilayers2014

    • Author(s)
      Yasuda, T. ; Kinoshita, M. ; Murata, M. ; Matsumori, N
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 106 Issue: 3 Pages: 631-638

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2013.12.034

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and biological activity of 8-deoxyheronamide C from a marine-derived Streptomyces sp.: heronamides target saturated hydrocarbon chains in lipid membranes.2014

    • Author(s)
      Sugiyama, R., Nishimura, S., Matsumori, N., Tsunematsu, Y., Hattori, A. & Kakeya, H.
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 136 Issue: 14 Pages: 5209-5212

    • DOI

      10.1021/ja500128u

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Coexistence of two liquid crystalline phases in dihydrosphingomyelin and dioleoylphosphatidylcholine binary mixtures2014

    • Author(s)
      M. Kinoshita, N. Matsumori, M. Murata
    • Journal Title

      Biophsy. Biochem. Acta Biomembranes

      Volume: 1838 Pages: 1372-1381

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of the ordered phase formed by sphingomyelin analogues and cholesterol binary mixtures2013

    • Author(s)
      M. Kinoshita, S. Goretta, H. Tsuchikawa, N. Matsumori, M. Murata
    • Journal Title

      Biophysics

      Volume: 9 Pages: 37-49

    • NAID

      130003366028

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis and structure revision of the C43-C67 part of amphidinol 32013

    • Author(s)
      M. Ebine, M. Kanemoto, Y. Manabe, Y. Konno, K. Sakai, N. Matsumori, M. Murata, T. Oish
    • Journal Title

      Org. Lett.

      Volume: 15 Issue: 11 Pages: 2846-2849

    • DOI

      10.1021/ol401176a

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interaction between the marine sponge cyclic peptide theonellamide A and sterols in lipid bilayers as viewed by surface plasmon resonance and solid state 2H NMR.2013

    • Author(s)
      Espiritu, R. A., Matsumori, N., Murata, M., Nishimura, S., Kakeya, H., Matsunaga, S. & Yoshida, M.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 52 Issue: 14 Pages: 2410-2418

    • DOI

      10.1021/bi4000854

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Possible conformation of amphotericin B dimer in membrane-bound assembly as deduced from solid-state NMR2012

    • Author(s)
      Umegawa, Y., Adachi, T., Matsumori, N., Murata, M.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem

      Volume: 20巻 Issue: 19 Pages: 5699-5704

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2012.08.016

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comprehensive Molecular Motion Capture for Sphingomyelin by Site-Specific Deuterium Labeling2012

    • Author(s)
      Nobuaki Matsumori
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 51 Issue: 42 Pages: 8363-8370

    • DOI

      10.1021/bi3009399

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] NMR investigations of organic molecules in lipid bilayers: application to amphotericin B and lipid rafts2013

    • Author(s)
      Nobuaki Matsumori
    • Organizer
      Atomic View of Biomolecular Function
    • Place of Presentation
      Ann Arbor, USA
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] NMRによる生体膜ならびに膜作用生理活性物質の解析2013

    • Author(s)
      松森 信明
    • Organizer
      日本分光学会NMR分光部会講習会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 生体膜ケミカルバイオロジーを目指したバイオ分析2013

    • Author(s)
      松森信明
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀県草津市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 膜脂質スフィンゴミエリン結合タンパク質の探索2013

    • Author(s)
      森 祥子
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀県草津市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 光親和性標識によるスフィンゴミエリンとタンパク質の相互作用解析2012

    • Author(s)
      森 祥子
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第7回年会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Book] タンパク質結晶の最前線2013

    • Author(s)
      松森信明
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks] 大阪大学 研究者総覧

    • URL

      http://www.dma.jim.osaka-u.ac.jp/view?l=jau=4002

    • Related Report
      2012 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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