遺伝子のせめぎ合いから遺伝システムへ：制限修飾系を手がかりとする探究

• Project Area: Correlative gene system: establishing next-generation genetics
• Project/Area Number: 24113506
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 小林 一三 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (30126057)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2015-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2013)
• Budget Amount: ¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000); Fiscal Year 2013: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000); Fiscal Year 2012: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
• Keywords: 制限修飾系 / 集団遺伝学 / メタゲノミクス / ゲノム進化 / ピロリ菌 / DNAメチル化 / エピジェネティクス / 制限酵素

Outline of Annual Research Achievements

ピロリ菌は ヒトの胃に感染し胃炎、潰瘍、胃がんを引き起こす細菌であり、高い突然変異率と高い系列間相同組換えによる、ゲノムとエピゲノムの著しい多様性によって知られている。この細菌は幼年期に感染し、一生そこに存続し、遂には胃がんを引き起こす。速い進化の原因は、ピロリ菌がゲノムとエピゲノムを作り替えることによって、新しい小児ホストに適応して、定着することかもしれない。このようなゲノムのミクロ進化と適応を解明するために、私達は、同じ家族内の構成員から得られたピロリ菌で、従来の、７つの遺伝子の配列だけに基づくmulti-locus sequence typingでは、同一あるいはほぼ同一であり、ゲノムがそっくりと考えられるものを選び、全ゲノム配列をIlluminaのショットガンシーケンシングで解読した。まず、塩基突然変異を検出することによって、小児をも含んだ感染経路を詳細にかつ確実に明らかにすることができた。アミノ酸を替える突然変異は、病原性に関与する遺伝子群、外膜タンパク質など細菌細胞表層に関わるタンパク質の遺伝子群、シグナル伝達遺伝子群に起きていた。関与する遺伝子は、小児によって異なっており、これらから、ピロリ菌が新しいホストに適応していく様々な道筋が明らかになった。これらの結果は、病原性に関与する遺伝子が小児への適応に関与する可能性を示唆した。また、アミノ酸を替える突然変異は制限修飾系遺伝子にも起きていた。これらの突然変異は、メチロームを作り替えることによってトランスクリプトームを改変し、適応に関与している可能性がある。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Restriction-modification system with methyl-inhibited base excision and abasic-site cleavage activities (2015)
  • Author(s): Masaki Fukuyo, Toshiaki Nakano, Yingbiao Zhang, Yoshikazu Furuta, Ken Ishikawa, Miki Watanabe-Matsui, Hirokazu Yano, Takeshi Hamakawa, Hiroshi Ide, Ichizo Kobayashi
  • Journal Title: Nucleic Acids Research Volume: Vol. 43, No. 5 Issue: 5 Pages: 2841-2852
  • DOI: 10.1093/nar/gkv116
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Microevolution of virulence-related genes in Helicobacter pylori familial infection. (2015)
  • Author(s): Yoshikazu Furuta, Mutsuko Konno, Takako Osaki, Hideo Yonezawa, Taichiro Ishige, Misaki Imai, Yuh Shiwa, Mari Shibata-Hatta, Yu Kanesaki, Hirofumi Yoshikawa, Shigeru Kamiya, Ichizo Kobayashi
  • Journal Title: PLOS ONE Volume: 印刷中
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] To be or not to be: regulation in restriction-modification systems and other toxin-antitoxin systems (2014)
  • Author(s): Iwona Mruk, Ichizo Kobayashi
  • Journal Title: Nucleic Acids Res. Volume: 42 (1) Issue: 1 Pages: 70-86
  • DOI: 10.1093/nar/gkt711
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A sequence-specific DNA glycosylase mediates restriction-modification in Pyrococcus abyssi. (2014)
  • Author(s): Ken-ichi Miyazono, Yoshikazu Furuta, Miki Watanabe-Matsui, Takuya Miyakawa, Tomoko Ito, Ichizo Kobayashi, Masaru Tanokura
  • Journal Title: Nat. Commun. Volume: 5 Issue: 1 Pages: 3178-3178
  • DOI: 10.1038/ncomms4178
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Methylome diversification through changes in DNA methyltransferase sequence specificity. (2014)
  • Author(s): Yoshikazu Furuta, Hiroe Namba-Fukuyo, Tomoko F. Shibata, Tomoaki Nishiyama, Shuji Shigenobu, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Mitsuyasu Hasebe, Ichizo Kobayashi
  • Journal Title: PLoS Genetics Volume: 10
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] DNA Double‐strand Breaks and Their Consequences in Bacteria and Their Genomes. (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi, Naofumi Handa, Kohji Kusano
  • Journal Title: Encyclopedia of Life Sciences (eLS) Volume: -
  • Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Alterations in rRNA-mRNA interaction during plastid evolution. (2014)
  • Author(s): Kyungtaek Lim, Ichizo Kobayashi, and Kenta Nakai
  • Journal Title: Molecular Biology and Evolution Volume: 31 Issue: 7 Pages: 1728-1740
  • DOI: 10.1093/molbev/msu120
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Chromosome painting in silico in a bacterial species reveals fine population structure (2013)
  • Author(s): Koji Yahara, Ynshikazu Furuta, Kenshiro Oshima, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Masahira Hattori, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
  • Journal Title: Molecular Biology and Evolution Volume: 30(6) Issue: 6 Pages: 1454-64
  • DOI: 10.1093/molbev/mst055
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] ゲノムからみるピロリ菌 (2013)
  • Author(s): 小林 一三
  • Journal Title: 日本臨牀 Volume: 第71巻・第8号 Pages: 1352-1367
• [Journal Article] Mobility of DNA sequence recognition domains in DNA methyltransferases suggests epigenetics-driven adaptive evolution. (2012)
  • Author(s): Yoshikazu Furuta, Ichizo Kobayashi
  • Journal Title: Mobile Genetic Elements Volume: 2(6) Issue: 6 Pages: 292-296
  • DOI: 10.4161/mge.23371
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Movement of DNAsequence recognition domains between non-orthologous proteins (2012)
  • Author(s): Y Furuta, I Kobayashi
  • Journal Title: Nucleic AcidsRes Volume: 40(18) Issue: 18 Pages: 9218-9232
  • DOI: 10.1093/nar/gks681
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genome-wide survey of mutual homologous recombination in a highly sexual bacterial species (2012)
  • Author(s): K Yahara, et al., I Kobayashi
  • Journal Title: Genome Biol. Evol Volume: 4(5) Issue: 5 Pages: 628-640
  • DOI: 10.1093/gbe/evs043
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Large variations in bacterial ribosomal RNA genes. (2012)
  • Author(s): K Lim, Y Furuta, I Kobayashi
  • Journal Title: Mol. Biol. Evol Volume: 29(10) Issue: 10 Pages: 2937-2948
  • DOI: 10.1093/molbev/mss101
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ピロリ菌の家族内感染におけるゲノム進化 (2015)
  • Author(s): 古田芳一、大崎敬子、米澤英雄、神谷茂、小林一三
  • Organizer: 第88回日本細菌学会
  • Place of Presentation: 長良川国際会議場（岐阜県岐阜市）
  • Year and Date: 2015-03-26 – 2015-03-28
• [Presentation] ゲノムのミクロ進化：ピロリ菌家族内感染の場合 (2015)
  • Author(s): 古田芳一、今野武津子、大崎敬子、米澤英雄、石毛太一郎、今井美咲、志波優、柴田（八田）真理、兼崎友、吉川博文、神谷茂、小林一三
  • Organizer: 第9回日本ゲノム微生物学会
  • Place of Presentation: 神戸大学（兵庫県神戸市）
  • Year and Date: 2015-03-06 – 2015-03-08
• [Presentation] 特定のエピゲノム状態がピロリ菌ストレス耐性を支配する (2015)
  • Author(s): 矢野大和、Md.Zobaidul Alam, 林原絵美子、古田芳一、鈴木穣、菅野純夫、柴山恵吾、小林一三
  • Organizer: 第9回日本ゲノム微生物学会
  • Place of Presentation: 神戸大学（兵庫県神戸市）
  • Year and Date: 2015-03-06 – 2015-03-08
• [Presentation] Epigenetics Driven Evolution (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: Baylor College での講演
  • Place of Presentation: ヒューストン（米国）
  • Year and Date: 2014-12-08
  • Invited
• [Presentation] H. pylori evolution (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: VI International Symposium of Helicobacter pylori: natural history and implications for human health
  • Place of Presentation: サンホセ（コスタリカ）
  • Year and Date: 2014-12-03
  • Invited
• [Presentation] Epigenetics Driven Evolution (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: Emory Universityにおける講演
  • Place of Presentation: アトランタ（米国）
  • Year and Date: 2014-11-17
  • Invited
• [Presentation] 細菌エピゲノムの進化：PacBioマ シンによるピロリ菌メチローム解読から (2014)
  • Author(s): 小林一三
  • Organizer: 第97回日本細菌学会関東支部総会
  • Place of Presentation: 東京ドームホテル（東京都文京区）
  • Year and Date: 2014-10-30 – 2014-10-31
• [Presentation] Genome/methylome evolution in H. pylori: oncogenic bacteria (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: Center for Disease Control of China における講演
  • Place of Presentation: 北京（中国）
  • Year and Date: 2014-10-10
  • Invited
• [Presentation] Methylome dynamics in H. pylori (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: XXVIIth International Workshop on Helicobacter and Microbiota in Chronic Digestive Inflammation and Gastric Cancer
  • Place of Presentation: ローマ（イタリア）
  • Year and Date: 2014-09-11 – 2014-09-13
• [Presentation] Epigenetics-driven evolution? (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: 16th Annual Meeting of the Society of Evolutionary Studies
  • Place of Presentation: 高槻現代劇場（大阪府高槻市）
  • Year and Date: 2014-08-22
• [Presentation] 配列特異的ＤＮＡメチル化酵素によるエピゲノム工学：合成生物学・ゲノム工学の拡張へ (2014)
  • Author(s): 小林一三
  • Organizer: ゲノム支援拡大班会議
  • Place of Presentation: 神戸国際会議場(兵庫県神戸市）
  • Year and Date: 2014-08-20 – 2014-08-21
• [Presentation] Evolution of H. pylori (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: 11th International Workshop on Pathogenesis and Host Response in Helicobacter Infections
  • Place of Presentation: ヘルシンゴー（デンマーク）
  • Year and Date: 2014-07-02
  • Invited
• [Presentation] Evolution of H. pylori (2014)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: University of Gdaｎsk での講演
  • Place of Presentation: グダンスク（ポーランド）
  • Year and Date: 2014-07-01
  • Invited
• [Presentation] 種内集団構造のインシリコ染色体ペインティングによる解明
  • Author(s): 矢原耕史、古田芳一、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、○小林一三
  • Organizer: 日本遺伝学会第85回大会
  • Place of Presentation: 慶應大学、横浜市
• [Presentation] 一分子リアルタイム(SMRT)シークエンシングによるメチローム解読と「エピジェネティクス駆動進化」仮説
  • Author(s): ○古田芳一、南波宏枝、柴田朋子、西山智明、重信秀治、鈴木 穣、菅野純夫、長谷部光泰、小林一三
  • Organizer: 日本遺伝学会第85回大会
  • Place of Presentation: 慶應大学、横浜市
• [Presentation] Chromosome painting in silico in a bacterial species reveals fine population structure
  • Author(s): 〇K Yahara, Y Furuta, K Oshima, M Yoshida, Ti Azuma, M Hattori, I Uchiyama, and I Kobayashi
  • Organizer: Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms (CHRO) 2013
  • Place of Presentation: Aberdeen, UK
• [Presentation] Mobility of DNA sequence recognition domains in DNA methyltransferases suggests epigenetics-driven adaptive evolution (poster presentation)
  • Author(s): Yoshikazu Furuta and 〇Ichizo Kobayashi
  • Organizer: Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms (CHRO) 2013
  • Place of Presentation: Aberdeen, UK
• [Presentation] Chromosome painting in silico in a bacterial species reveals fine population structure
  • Author(s): K. Yahara, Y. Furuta, K. Oshima, M. Yoshida, T. Azuma, M. Hattori, I. Uchiyama, 〇I. Kobayashi
  • Organizer: EHSG XXVth International Workshop on Helicobacter and related bacteria in chronic digestive inflammation and gastric cancer
  • Place of Presentation: Madrid, Spain
  • Invited
• [Presentation] 第三世代シーケンサー（PacBio社）１分子リアルタイム（SMRT）シーケンシングでのメチローム解読による制限修飾系の認識配列の決定
  • Author(s): ○南波宏枝、古田芳一、柴田朋子、西山智明、重信秀治、Desirazu N. Rao、長谷部光泰、小林一三
  • Organizer: 日本進化学会第15回つくば大会
  • Place of Presentation: 筑波大学、筑波
• [Presentation] DNAメチル化系の認識配列変換によるメチローム多様化：種内複数株でのメチローム解読からの証拠
  • Author(s): ○古田芳一、南波宏枝、柴田朋子、西山智明、重信秀治、鈴木 穣、菅野純夫、長谷部光泰、小林一三
  • Organizer: 日本進化学会第15回つくば大会
  • Place of Presentation: 筑波大学、筑波
• [Presentation] 矢原耕史、古田芳一、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、○小林一三
  • Author(s): 矢原耕史、古田芳一、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、○小林一三
  • Organizer: 日本進化学会第15回つくば大会
  • Place of Presentation: 筑波大学、筑波
• [Presentation] DNAメチル化酵素のドメイン移動によるピロリ菌のエピゲノム多様化
  • Author(s): ○古田芳一、小林一三
  • Organizer: 第19回日本ヘリコバクター学会学術集会
  • Place of Presentation: 長崎大学、長崎市
  • Invited
• [Presentation] インシリコ染色体ペインティングでわかるピロリ菌の詳細な集団構造
  • Author(s): 矢原耕史、古田芳一、 吉田優、東健、○小林一三
  • Organizer: 第19回日本ヘリコバクター学会学術集会
  • Place of Presentation: 長崎大学、長崎市
• [Presentation] Mobility of restriction-modification systems and their domains
  • Author(s): Ichizo Kobayashi
  • Organizer: International Conference on Nucleic Acid Enzymes and Enzymes in Human Diseases (NAEEHD)
  • Place of Presentation: The Chinese Univ., Hong Kong
  • Invited
• [Presentation] 系統間の遺伝情報フローとそのバリアー
  • Author(s): 小林一三
  • Organizer: 日本農芸化学会２０１３年度大会
  • Place of Presentation: 東北大学、仙台市
• [Presentation] Movement of DNA sequence recognition domains between non-orthologous proteins（ポスター発表）
  • Author(s): ○古田芳一、小林一三
  • Organizer: 第８６回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 幕張メッセ、千葉市
• [Presentation] Genome-wide Survey of Mutual Homologous Recombination and Diversifying Selection in H. pylori（ポスター発表）
  • Author(s): Koji Yahara, Yoshikazu Furuta, ○Ichizo Kobayashi
  • Organizer: 第８６回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 幕張メッセ、千葉市
• [Presentation] 種内系列間相同組換えと適応進化の関連のゲノムワイド解析
  • Author(s): 矢原耕史、et al., ○小林一三（15/15）
  • Organizer: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • Place of Presentation: 長浜バイオ大学、滋賀県長浜市
• [Presentation] DNA配列認識ドメインの非オーソロガス遺伝子間の移動（ポスター発表）
  • Author(s): ○古田芳一、小林一三
  • Organizer: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • Place of Presentation: 長浜バイオ大学、滋賀県長浜市
• [Presentation] From epigenetics-driven evolution to epigenome engineering
  • Author(s): 小林一三
  • Organizer: フランスー日本セミナー：BioInspired Methods & Applications
  • Place of Presentation: フランス大使館、東京
  • Invited
• [Presentation] DNA配列認識ドメインの非オーソロガスたんぱく質間の移動
  • Author(s): 古田芳一、○小林一三
  • Organizer: 第85回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場、福岡市
• [Presentation] 系列間の遺伝情報フラックスとそのバリアー
  • Author(s): 小林一三
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場、福岡市
• [Presentation] なぜ死ぬ/進化する？「感染防御戦略としての個体死」仮説の実験進化による検証
  • Author(s): ○福世真樹、佐々木顕、小林一三
  • Organizer: 第35回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場、福岡市
• [Presentation] 多様なエピゲノムからの選択によって進化が実現する：細菌の配列特異的DNAメチル化にもとづく仮説
  • Author(s): 小林一三
  • Organizer: 第４４回種生物学シンポジウム
  • Place of Presentation: 奥琵琶湖マキノパークホテル、滋賀県高島市マキノ町
  • Invited
• [Presentation] Epigenetics-driven adaptive evolution
  • Author(s): 小林一三
  • Organizer: 名無し進化セミナー
  • Place of Presentation: 琉球大学、沖縄
  • Invited
• [Presentation] Genome-wide survey of homologous recombination and diversifying selection in H. pylori, a highly sexual bacterial species
  • Author(s): ○K Yahara, M Kawai, Y Furuta, J Bujnicki, I Uchiyama, I Kobayashi
  • Organizer: 11th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases
  • Place of Presentation: New Orleans, USA
• [Presentation] Genome-wide Survey of Homologous Recombination and Diversifying Selection in H. pylori, a Highly Sexual Bacterial Species （poster presentation）
  • Author(s): ○K Yahara, et al., I Kobayashi (15/15)
  • Organizer: Infectious Disease Genomics & Global Health Conference
  • Place of Presentation: Cambridge, UK
• [Presentation] エピゲノムのディジタルな進化とデザイン
  • Author(s): 小林一三
  • Organizer: 日本遺伝学会第84回大会
  • Place of Presentation: 九州大学、福岡市
• [Presentation] 相同組換え率の分布と多様化選択：細菌でのゲノムワイド解析
  • Author(s): ○矢原耕史、et al.、小林一三（15/15）
  • Organizer: 日本遺伝学会第84回大会
  • Place of Presentation: 九州大学、福岡市
• [Presentation] 「感染防御戦略としての利他的な死」仮説の検討
  • Author(s): ○福世真樹，佐々木顕，小林一三
  • Organizer: 第22回日本数理生物学会大会
  • Place of Presentation: 岡山大学、岡山市
• [Presentation] Epigenome evolution―Two mechanisms in alteration of DNA sequence recognition domains in restriction-modification systems
  • Author(s): ○Yoshikazu Furuta, Ichizo Kobayashi
  • Organizer: Bacteria, Archaea & Phages
  • Place of Presentation: Cold Spring Harbor, USA
• [Presentation] Why do we die from infection?
  • Author(s): Masaki Fukuyo, Akira Sasaki, ○Ichizo Kobayashi
  • Organizer: SESJ2012
  • Place of Presentation: Tokyo Metropolitan University, Hachioji
• [Presentation] 相同組換えから見た種
  • Author(s): 矢原耕史
  • Organizer: 日本進化学会第１４回大会
  • Place of Presentation: 首都大学東京、八王子市
• [Presentation] なぜ感染で死ぬのか？ 利他的感染防御としての死の集団実験と数理モデルによる検討 （ポスター発表）
  • Author(s): ○福世真樹、佐々木顕、小林一三
  • Organizer: 日本進化学会第１４回大会
  • Place of Presentation: 首都大学東京、八王子市
• [Presentation] Why do we die from infection? Success of an altruistic suicidal defense strategy in a structured habitat（poster presentation）
  • Author(s): ○Masaki Fukuyo, Akira Sasaki, Ichizo Kobayashi
  • Organizer: Evolution
  • Place of Presentation: Ottawa, Canada.
• [Presentation] Genome-wide survey of mutual homologous recombination in H. pylori
  • Author(s): K Yahara, et al., ○I Kobayashi (15/15)
  • Organizer: 10th International Workshop on Pathogenesis and Host Response in Helicobacter Infections
  • Place of Presentation: Helsingor, Denmark
• [Presentation] 「超悪玉発がん細菌」ピロリ菌のゲノム比較から種内進化の新しいしくみへ（ポスター発表）
  • Author(s): 河合幹彦、古田芳一、矢原耕史、○南波宏枝、鶴剛史、高橋規子、半田直史、吉田優、大島健志朗、内山郁夫、東健、服部正平、小林一三
  • Organizer: 第12回東京大学生命科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京大学医科学研究所、東京
• [Presentation] なぜ死ぬのか？ 利他的な「感染防御としての死」仮説の検証（ポスター発表）
  • Author(s): ○福世真樹、佐々木顕、小林一三
  • Organizer: 第12回東京大学生命科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京大学医科学研究所、東京
• [Presentation] ピロリ菌CagA発がんタンパクのDNA組換えによる進化
  • Author(s): ○古田芳一、小林一三
  • Organizer: 第18回日本ヘリコバクター学会学術集会
  • Place of Presentation: 岡山コンベンションセンター、岡山市
• [Presentation] ピロリ菌ゲノムに残された相同組換えの痕跡
  • Author(s): ○小林一三、古田芳一、吉田優、東健
  • Organizer: 第18回日本ヘリコバクター学会学術集会
  • Place of Presentation: 岡山コンベンションセンター、岡山市
• [Presentation] ピロリ菌日本株の全ゲノム比較解析から見る発癌細菌の適応進化メカニズム
  • Author(s): 古田芳一
  • Organizer: 岡山大学 第368回 生物科学セミナー
  • Place of Presentation: 岡山大学、岡山
• [Presentation] Genome-wide survey of homologous recombination and diversifying selection in an extremely sexual bacterial species（poster presentation）
  • Author(s): ○K Yahara, M Kawai, Y Furuta, N Takahashi, N Handa, T Tsuru, K Oshima, M Yoshida, T Azuma, M Hattori, I Uchiyama, I Kobayashi
  • Organizer: Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution 2012
  • Place of Presentation: Dublin, Ireland
• [Presentation] 遺伝子内ドメイン移動(DoMo)によるタンパク質多様化の新しいしくみ（ポスター発表）
  • Author(s): 古田芳一
  • Organizer: NGS現場の会第二回研究会
  • Place of Presentation: ホテル阪急エキスポパーク、大阪市
• [Book] Environmental Control of Gene Expression in Bacteria, (2016)
  • Author(s): Iwona Mruk and Ichizo Kobayashi、Frans J. de Bruijn (editor)
  • Publisher: Wiley
• [Book] Helicobacter pylori Research: From Bench to Bedside (2015)
  • Author(s): Ichizo Kobayashi、Steffen Backert, Yoshio Yamaoka (editors)
  • Publisher: Springer Japan
• [Book] 「種生物学研究」第39号「エコロジカル・エピジェネティクス－生物の柔軟性の分子生態学－」 (2015)
  • Author(s): 小林一三 (責任編集者：荒木希和子・土畑重人）
  • Publisher: 文一総合出版
• [Remarks] 小林研究室ホームページ
  • URL: http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/ikobaya/index.html
• [Remarks] Kobayashi Laboratory: Publication in English
  • URL: http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/ikobaya/publication_en.html
• [Remarks] Kobayashi Laboratory: 日本語文献（研究室メンバーによる）
  • URL: http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/ikobaya/publication_ja.html