• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

出芽酵母の天然変性タンパク質の細胞内動態の解明

Publicly Offered Research

Project AreaTarget recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein
Project/Area Number 24113705
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

田口 英樹  東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (40272710)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥11,310,000 (Direct Cost: ¥8,700,000、Indirect Cost: ¥2,610,000)
Fiscal Year 2013: ¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Fiscal Year 2012: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Keywords天然変性タンパク質
Research Abstract

【研究目的】本研究は天然変性タンパク質(IDP)、天然変性領域(IDR)の細胞内での動態に迫るものである。IDPの概念の確立にはバイオインフォマティクスと核磁気共鳴法やX線小角散乱法など試験管内でタンパク質構造のゆらぎを測定する分光学が貢献してきた。これらの分野に加えてタンパク質の構造状態を知るための生化学的な手法でもIDPの研究を行うことは可能である。しかし、細胞内でのIDPや天然変 性領域(IDR)の役割や動態についてはほとんどわかっていない。 例えば、IDP/IDRのどのくらいの割合がターゲットと結合しているのか? IDP/IDRとシャペロンの相互作用は? 本研究は、細胞内でのIDP/IDR研究を開拓することで従来の試験管内レベルでのIDP/IDR研究をin vivoのレベルに展開することを目的とした。
【成果1:IDRとしての酵母プリオンSup35】Sup35のN末ドメインは(プリオン凝集を形成する前は)典型的なIDRである。そのIDRを介してパートナーであるSup45タンパク質と相互作用するらしい。本研究から、Sup35のIDRは溶液中で単量体として存在するのではなく凝集状態にあること、さらにその凝集体が酵母のシャペロンによって脱凝集されるらしいことがin vivo、および組み換えSup35を用いたin vitroの研究からわかった。
【成果2:IDPのインタラクトーム解析】出芽酵母内に人工的なIDPを発現させ、その動態および相互作用タンパク質を網羅的に調べた。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2013 2012

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 3 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Biomolecular Robotics for Chemomechanically Driven Guest Delivery Fuelled by Intracellular ATP2013

    • Author(s)
      S.Biswas, K.Kinbara, T.Niwa, H.Taguchi, N.Ishii, S.Watanabe, K.Miyata, K.Kataoka and T.Aida
    • Journal Title

      Nature Chemistry

      Volume: 5 Issue: 7 Pages: 613-620

    • DOI

      10.1038/nchem.1681

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Experimental study on the mechanism underlying the anti-aggregation function of a group3LEA peptide.2013

    • Author(s)
      Yamakawa, K., Furuki, T., Furuta, T., Hatanaka, R., Kikawada, T., Niwa, T. Taguchi, H. Furusawa H., Okahata, Y., and Sakurai, M.
    • Journal Title

      Cryobiol. Cryotechnol

      Volume: 59 Pages: 95-99

    • NAID

      110009662022

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The interaction of Hsp104 with yeast prion Sup35 as analyzed by fluorescence cross-correlation spectroscopy.oligomeric state.2013

    • Author(s)
      Ohta S., Kawai-Noma S., Kitamura A., Pack C.G., Kinjo M., Taguchi H.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 442 Issue: 1-2 Pages: 28-32

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2013.10.147

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nano-scale alignment of proteins on a flexible DNA back-bone2012

    • Author(s)
      77. Nojima, T.*, Konno, H., Kodera, N., Seio, K., Taguchi, H. and Yoshida, M.
    • Journal Title

      PLoS One 7.

      Volume: 7

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Flexibility of GroES mobile loop is required for efficient chaperonin function2012

    • Author(s)
      76. Nojima, T., Ikegami, T., Taguchi, H. and Yoshida, M.*
    • Journal Title

      J. Mol. Biol.

      Volume: 422 Pages: 291-299

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Global Analysis of Chaperone Effects Using a Reconstituted Cell-Free Translation System2012

    • Author(s)
      75. Niwa, T., Kanamori T., Ueda, T.*, Taguchi, H.*
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.

      Volume: 109 Pages: 8937-8942

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanism of methionine synthase overexpression in chaperonin-depleted Escherichia coli2012

    • Author(s)
      74. Fujiwara K*, Taguchi H.
    • Journal Title

      Microbiology.

      Volume: 158 Pages: 917-924

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] In vivo structure and dynamics of yeast prion protein2013

    • Author(s)
      Hideki Taguchi
    • Organizer
      SPIE 2013: Nano-Bio Sensing, Imaging Spectroscopy
    • Place of Presentation
      (Korea)
    • Year and Date
      2013-02-20
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 蛋白質フォールディングの「理想」と「現実」:凝集形成とシャペロンの役割2013

    • Author(s)
      田口英樹
    • Organizer
      第13回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      とりぎん文化会館(鳥取県)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 酵母プリオンの恒常性維持機構2013

    • Author(s)
      田口英樹
    • Organizer
      第65回 日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      ウインクあいち(愛知県)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Global analyses of protein aggregation and chaperone effects2012

    • Author(s)
      Hideki Taguchi
    • Organizer
      SFB 3rd International symposium “Molecular Machines in Protein Folding and Protein Transport
    • Place of Presentation
      (Germany)
    • Year and Date
      2012-07-23
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌のシャペロニンGroELの細胞内での役割2012

    • Author(s)
      田口英樹
    • Organizer
      日本蛋白質科学会年会ワークショップ「ここまでわかったシャペロニン:作動機構と細胞内での役割」
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県)
    • Year and Date
      2012-06-20
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Book] 「史上最長の実験は続くよ」2012

    • Author(s)
      田口 英樹
    • Publisher
      実験医学30,
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Book] 「網羅的な解析から見えてきたタンパク質凝集特性とシャペロンの役割」2012

    • Author(s)
      丹羽達也、田口 英樹
    • Publisher
      バイオサイエンスとインダストリー70,
    • Related Report
      2012 Annual Research Report

URL: 

Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi