網羅的ペプチド相互作用実験データを用いた天然変性蛋白質の特性解析と親和性デザイン
Publicly Offered Research
Project Area | Target recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein |
Project/Area Number |
24113707
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Review Section |
Biological Sciences
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Research Institution | Shinshu University |
Principal Investigator |
新井 亮一 信州大学, 繊維学部, 助教 (50344023)
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Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2013)
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Budget Amount *help |
¥11,830,000 (Direct Cost: ¥9,100,000、Indirect Cost: ¥2,730,000)
Fiscal Year 2013: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2012: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
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Keywords | 天然変性蛋白質 / 相互作用解析 / ペプチドライブラリー / ファージディスプレイ / NRSF/REST / PAH1 / 蛋白質デザイン / ペプチド創薬 / 天然変性タンパク質 / パターンデザイン / PAH1 / タンパク質デザイン |
Research Abstract |
神経細胞特異的な転写抑制因子であるNRSFのN末端付近の天然変性領域は、コリプレッサーであるmSin3のPAH1ドメインとα-へリックス形成を伴って結合する。また、髄芽腫では、NRSFの高発現による過剰な転写抑制が報告されており、NRSFとPAH1の結合を拮抗阻害して、転写抑制の解除やアポトーシスを誘導する薬剤の開発が望まれている。そこで、PAH1とより強く相互作用するペプチドを設計開発することを目的とした。まず、アミノ酸の特性と配列パターンを効果的にデザインしたペプチドライブラリーを設計し、ファージディスプレイを行い、新規なPAH1結合配列群を獲得した。次に、これらの結合配列データの情報解析により親和性向上を目指した変異体をデザインし、表面プラズモン共鳴センサーを用いてPAH1との相互作用解析を行った。その結果、野生型NRSF(43-83)では解離定数 Kd = 3.3 μM に対して、Q45L変異体では Kd = 0.29 μM と約10倍の顕著な親和性の向上に成功した。これにより、親和性が向上した結合ペプチドをデザインするための一連の本手法について、一定の有用性を実証できたと考えられる。
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Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(34 results)
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[Presentation] Arai, R., Kobayashi, N., Kimura, A., Teranishi, H., Sato, T., Bradley, L. H., Nishimura, Y. and Hecht, M. H.2012
Author(s)
De novo proteins and interaction analysis using pattern-designed peptide libraries
Organizer
Gordon Research Conference, Intrinsically Disordered Proteins
Place of Presentation
Mount Snow Resort (West Dover, VT, USA)
Year and Date
2012-07-09
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[Presentation] A De Novo Heme Protein, Dnhps1, Created from a 5-Amino Acid Alphabet
Author(s)
Fukuda, S., Kurasawa, S., and Arai, R.
Organizer
27th Annual Symposium of The Protein Society
Place of Presentation
Boston Marriott Copley Place, Boston, MA, USA
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[Presentation] Molecular cloning of novel silk proteins from larvae of caddisfly, Stenopsyche marmorata
Author(s)
X. Bai, K. Ohkawa, T.Nomura, S. Ishihara, Y. Yamaguchi, M. Tsukada, K. Abe, K. Hirabayashi, R. Arai
Organizer
The 8th China International Silk Conference
Place of Presentation
蘇州大学(Suzhou, China)
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