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相同染色体認識における非コードDNAの役割

Publicly Offered Research

Project AreaFunctions of non-coding DNA region for genome integrity
Project/Area Number 24114521
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNational Institute of Information and Communications Technology

Principal Investigator

丁 大橋  独立行政法人情報通信研究機構, 未来ICT研究所バイオICT研究室, 主任研究員 (50359080)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2014-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2013: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2012: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Keywords染色体 / 減数分裂 / 対合 / 非コードDNA / 分裂酵母 / 非コードDNA
Research Abstract

本申請研究では、相同染色体の相互認識機構の解明を目指し、分裂酵母減数分裂期における相同組換え非依存的相同染色体の対合機構の同定・解析を目的としている。これまでの研究で、分裂酵母第2染色体のsme2遺伝子座が対合のホットスポットであり、sme2遺伝子座から減数分裂期特異的に転写されるnon-coding RNA meiRNA-Lがsme2遺伝子座に集積し、相同染色体の認識に寄与することを明らかにしてきた。しかし、meiRNA-Lが作る対合サイトの分子メカニズムや類似サイトがほかにもあるかどうかなどの未知な問題が依然として残り、さらなる解明が必要とされている。今年度ではmeiRNA共局在因子を探すことを目標とした。前年度までに酵母スリーハイブリッドシステムを用いて、meiRNAに結合するタンパク質を減数分裂特異的cDNAライブラリからスクリーニングする試みをしたが、Bait依存的のポジティブな相互作用を示す遺伝子の同定には至らなかった。今年において発表された分裂酵母GFPライブラリ及びYFP融合ライブラリのデータベースから、核内蛍光ドットを示すものを検索し、sme2ローカスと共局在を示すタンパク質が複数同定できた。同定したタンパク質のうち、生育に必須でない遺伝子について破壊を行い、sme2サイトの対合活性を検討した。また、生育に必須のタンパク質について、条件的シャットオフできるAuxin-inducible degron (AID)システムを用いて破壊することにした。現在の時点で、sme2サイトの対合活性に影響を与えるタンパク質を3つ同定した。これからは完成していない遺伝子破壊を続けて行い、また、同定できた対合に寄与する遺伝子の機能を詳しく解析する予定である。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] The role of chromosomal retention of noncoding RNA in meiosis2013

    • Author(s)
      Ding DQ, Haraguchi T, Hiraoka Y.
    • Journal Title

      Chromosome Res.

      Volume: 21 Issue: 6-7 Pages: 665-672

    • DOI

      10.1007/s10577-013-9389-1

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Meiosis-specific non-coding RNA mediates robust pairing of homologous chromosomes in meiosis2012

    • Author(s)
      Ding D-Q, Okamasa K, Yamane M, Tsutsumi C, Haraguchi T, Yamamoto M, and Hiraoka Y
    • Journal Title

      Science

      Volume: 336 Issue: 6082 Pages: 732-736

    • DOI

      10.1126/science.1219518

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chromosomally-retained RNA mediates homologous pairing2012

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Journal Title

      Nucleus

      Volume: 3 Issue: 6 Pages: 516-519

    • DOI

      10.4161/nucl.22732

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 非コードRNAが相同染色体の相互認識を担う2012

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 30 Pages: 2617-2619

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の3D-SIM解析2014

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      「ゲノムを支える非コードDNA領域の機能」公開シンポジウム インターメアによる染色体制御機構
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館、東京都文京区
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Fine structures of meiosis-specific chromosome and homologous chromosome pairing in S. pombe2013

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      Pombe 2013 (7th International Fission Yeast Meeting)
    • Place of Presentation
      University of London, UK
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 相同染色体認識における 非コードDNAの役割2013

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      「ゲノムを支える非コードDNA 領域の機能」 第5回領域会議
    • Place of Presentation
      湘南国際村、神奈川県三浦郡葉山町
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の3D-SIM解析2013

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      第31回染色体ワークショップ・第12回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      ホテルおかだ、神奈川県足柄下郡
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Live and 3D structured illumination microscopy revealed dynamic and highly organized meiotic specific chromosome architectures in fission yeast2013

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      The 4th Xiamen Winter Symposium
    • Place of Presentation
      Xiamen University,Xiamen,China
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 核内RNA ボディーが相同染色体の認識に果たす役割2012

    • Author(s)
      平岡 泰
    • Organizer
      第30 回 染色体ワークショップ・第 11 回 核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場、兵庫県
    • Year and Date
      2012-12-19
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 減数分裂特異的な非コードRNAが相同染色体を認識する2012

    • Author(s)
      平岡 泰
    • Organizer
      第35回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡県
    • Year and Date
      2012-12-12
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 分裂裂酵母減数分裂期染色体構造の相同染色体対合における役割2012

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      第35回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡県
    • Year and Date
      2012-12-12
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 相同染色体認識における非コードDNAの役割2012

    • Author(s)
      丁 大橋
    • Organizer
      新学術研究領域「ゲノムを支える非コード領域の機能」第三回領域会議
    • Place of Presentation
      御殿場高原時の栖、静岡県
    • Year and Date
      2012-07-26
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Remarks] Cell Magic

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/publication.html

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks] 生物情報グループ

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/

    • Related Report
      2012 Annual Research Report

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Published: 2013-05-15   Modified: 2019-07-29  

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